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AHL転写因子を介した植物の器官成長を司る転写制御ネットワークの解明

研究課題

研究課題/領域番号 19F19781
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

杉本 慶子  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (30455349)

研究分担者 FAVERO DAVID  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2019-11-08 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2021年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2020年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2019年度: 100千円 (直接経費: 100千円)
キーワードAHL / SOB3 / petiole / PIF / transcription / growth / plants / photomorphogenesis
研究開始時の研究の概要

The aim of this project is to establish where AT-HOOK MOTIF NUCLEAR LOCALIZED(AHL) transcription factors(TFs) fit withing gene regulatory networks(GRNs) which modulate growth in response to environmental stimuli in the model Plant Arabidopsis thaliana.

研究実績の概要

My work during the past funding period has provided new insights into the mechanisms by which the AHL transcription factors regulate transcription and growth in Arabidopsis. Together with my collaborators at Washington State University, I finished generating data for and writing a manuscript that describes how AHLs regulate gene expression and suppress hypocotyl growth in seedlings grown in short days. We recently resubmitted this manuscript to BMC Plant Biology, where it has been provisionally accepted. In this manuscript, we describe how AHLs affect the expression of different sets of genes at different times throughout the course of a short day. For example, we showed that SOB3 and/or other AHLs repress the expression of the PIF-activated, growth-promoting genes XTR7 and CDF5 at ZT9 and ZT24, but not at ZT4. On the other hand, we found that SOB3 and/or other AHLs activate the expression of the growth-repressing genes HY5, BBX22, RGA, and PRR9 specifically at ZT4. However, we unexpectedly also found that SOB3 exhibits similar patterns of binding to target genes at ZT4, ZT9, and ZT24. Thus, our data from this study collectively suggest that AHLs affects gene expression in a time-point specific manner irrespective of changes in binding to DNA throughout short days. Apart from work related to the BMC Plant Biology manuscript, I have also recently generated data suggesting that AHLs affect PIF activity at the protein level, i.e. they can reduce PIF-mediated activation of target genes without affecting PIF protein levels.

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 5件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] University of Potsdam(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Washington State University(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] 4-Phenylbutyric acid promotes plant regeneration as an auxin by being converted to phenylacetic acid via an IBR3-independent pathway2022

    • 著者名/発表者名
      Iwase Akira、Takebayashi Arika、Aoi Yuki、Favero David S、Watanabe Shunsuke、Seo Mitsunori、Kasahara Hiroyuki、Sugimoto Keiko
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 39 号: 1 ページ: 51-58

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.21.1224b

    • NAID

      130008161269

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • 年月日
      2022-03-25
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Trihelix transcription factors GTL1 and DF1 prevent aberrant root hair formation in an excess nutrient condition.2022

    • 著者名/発表者名
      Shibata, M., Favero, D.S., Takebayashi, R., Takebayashi, A, Kawamura, A, Rymen, Hosokawa, Y, and Sugimoto, K.
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Warm Temperature Promotes Shoot Regeneration in <i>Arabidopsis thaliana</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Lambolez Alice、Kawamura Ayako、Takahashi Tatsuya、Rymen Bart、Iwase Akira、Favero David S、Ikeuchi Momoko、Suzuki Takamasa、Cortijo Sandra、Jaeger Katja E、Wigge Philip A、Sugimoto Keiko
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: ー 号: 5 ページ: 618-634

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac017

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Wound-inducible WUSCHEL-RELATED HOMEOBOX 13 is required for callus growth and organ reconnection2021

    • 著者名/発表者名
      Ikeuchi Momoko, Iwase Akira, Ito Tasuku, Tanaka Hayato, Favero David S, Kawamura Ayako, Sakamoto Shingo, Wakazaki Mayumi, Tameshige Toshiaki, Fujii Haruki, Hashimoto Naoki, Suzuki Takamasa, Hotta Kazuhiro, Toyooka Kiminori, Mitsuda Nobutaka, Sugimoto Keiko
    • 雑誌名

      Plant Physiology

      巻: 188 号: 1 ページ: 425-441

    • DOI

      10.1093/plphys/kiab510

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The SUMO E3 ligase SIZ1 negatively regulates shoot regeneration2020

    • 著者名/発表者名
      Duncan Coleman, Ayako Kawamura, Momoko Ikeuchi, David Seth Favero, Alice Lambolez, Bart Rymen, Akira Iwase, Takamasa Suzuki, Keiko Sugimoto
    • 雑誌名

      Plant Physiology

      巻: 184 号: 1 ページ: 330-344

    • DOI

      10.1104/pp.20.00626

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular pathways regulating elongation of aerial plant organs: a focus on light, the circadian clock, and temperature2020

    • 著者名/発表者名
      Favero David S.、Lambolez Alice、Sugimoto Keiko
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 105 号: 2 ページ: 392-420

    • DOI

      10.1111/tpj.14996

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] AT-Hook Transcription Factors Restrict Petiole Growth by Antagonizing PIFs2020

    • 著者名/発表者名
      Favero David S.、Kawamura Ayako、Shibata Michitaro、Takebayashi Arika、Jung Jae-Hoon、Suzuki Takamasa、Jaeger Katja E.、Ishida Takashi、Iwase Akira、Wigge Philip A.、Neff Michael M.、Sugimoto Keiko
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 30 号: 8 ページ: 1454-1466

    • DOI

      10.1016/j.cub.2020.02.017

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mechanisms regulating PIF transcription factor activity at the protein level2020

    • 著者名/発表者名
      Favero David S.
    • 雑誌名

      Physiologia Plantarum

      巻: - 号: 3 ページ: 325-335

    • DOI

      10.1111/ppl.13075

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Towards a better understanding of the molecular mechanisms that govern AHL-mediated repression of PIF-activated gene transcription2022

    • 著者名/発表者名
      David S. Favero
    • 学会等名
      The 63rd Annual Meeting of the Japanese Society of Plant Physiologists
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] AT-hook transcription factors promote photomorphogenesis by antagonizing the PHYTOCHROME INTERACTING FACTORs2021

    • 著者名/発表者名
      David S. Favero
    • 学会等名
      Japanese Society of Plant Physiologists
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] AT-hook transcription factors restrict petiole growth by antagonizing PIFs2020

    • 著者名/発表者名
      David S. Favero
    • 学会等名
      Plant Biology 2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] AT-hook transcription factors restrict petiole growth by antagonizing PIFs2020

    • 著者名/発表者名
      David S. FAVERO
    • 学会等名
      Japanese Society of Plant Physiologists
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] Cell Function Research Team

    • URL

      http://cellfunction.riken.jp/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-11-29   更新日: 2024-03-26  

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