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ユビキチン関連経路を介した選択的ミトコンドリア分解の制御機構

研究課題

研究課題/領域番号 19F19816
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
審査区分 小区分43030:機能生物化学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

岡本 浩二  大阪大学, 生命機能研究科, 准教授 (40455217)

研究分担者 SCHUSTER RAMONA  大阪大学, 生命機能研究科, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2019-11-08 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2021年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2020年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2019年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
キーワードミトコンドリア / オートファジー / 翻訳後修飾 / ユビキチン / 出芽酵母
研究開始時の研究の概要

余剰または不良ミトコンドリアの丸ごと隔離・除去は、単細胞から多細胞の真核生物まで保存された基本的な仕組みであり、ミトコンドリアの量や品質の管理に寄与していると考えられているが、その詳細な分子機構は未だ多くの謎に包まれている。本研究では出芽酵母をモデル生物に用いて、ユビキチン関連経路がどのように選択的ミトコンドリア分解を正または負に制御しているかを解明してゆく。

研究実績の概要

余剰または不良ミトコンドリアの丸ごと隔離・除去は、進化的に保存された基本的な機構であり、オートファジーの仕組みを利用していることから、「マイトファジー」と呼ばれ、その破綻は様々な疾患を引き起こす可能性が提起されているが、詳細な分子機構は未だ多くの謎に包まれている。一方、タンパク質のユビキチン化および脱ユビキチン化は、タンパク質の翻訳後修飾の一つであり、細胞内で様々な役割を果たしているが、出芽酵母のマイトファジーやオートファジーとの関連は未解明な点が多い。本研究の目的は、出芽酵母のマイトファジーの制御において、ユビキチン関連経路がどのように機能しているかを明らかにすることである。とりわけ、脱ユビキチン化酵素(DUB)に着目し、それらの分子機能の解明を目指した。前年度までに、21種類のDUBをコードする遺伝子の破壊株を作成・解析し、Doa4およびUbp6の欠損細胞でマイトファジーが強く抑制されていることを見出した。

本年度の研究において、Doa4およびUbp6の酵素活性を失った変異体を発現する酵母株を作成・解析した結果、遺伝子欠損株と同様にマイトファジーが野生株の30-40%に低下することがわかった。また、小胞体やペルオキシソームの選択的オートファジー、バルクオートファジーにも、Doa4およびUbp6が寄与していることを明らかにした。一方、細胞質から液胞へタンパク質を輸送する選択的オートファジー(Cvt経路)については、Doa4およびUbp6の欠損細胞は野生株と同様であった。なお、過去の研究から、Doa4およびUbp6の欠損細胞で遊離ユビキチン量が減少していることが報告されている。そこで、これらの変異細胞でユビキチンを過剰発現したところ、マイトファジーが野生株の60-70%にまで回復した。以上の知見から、マイトファジーは遊離ユビキチンを必要とすることが示唆される。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 3件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 2件、 招待講演 5件) 備考 (3件)

  • [国際共同研究] グローニンゲン大学(オランダ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] ジョンズホプキンス大学(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] グローニンゲン大学(オランダ)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] ジョンズホプキンス大学(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] ジョンンズホプキンス大学(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] The protein N-terminal acetyltransferase A complex contributes to yeast mitophagy via promoting expression and phosphorylation of Atg322021

    • 著者名/発表者名
      Kubota Mitsutaka、Okamoto Koji
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 170 号: 2 ページ: 175-182

    • DOI

      10.1093/jb/mvab068

    • NAID

      40022722295

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial dynamics and degradation in the oleaginous yeast Lipomyces starkeyi2021

    • 著者名/発表者名
      Duan Lan、Okamoto Koji
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 26 号: 8 ページ: 627-635

    • DOI

      10.1111/gtc.12875

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial clearance: mechanisms and roles in cellular fitness2021

    • 著者名/発表者名
      Onishi Mashun、Okamoto Koji
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 595 号: 8 ページ: 1239-1263

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14060

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Regulatory mechanisms of mitophagy in yeast2021

    • 著者名/発表者名
      Liu Yang、Okamoto Koji
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      巻: 1865 号: 5 ページ: 129858-129858

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2021.129858

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular mechanisms and physiological functions of mitophagy2021

    • 著者名/発表者名
      Onishi Mashun、Yamano Koji、Sato Miyuki、Matsuda Noriyuki、Okamoto Koji
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: 40 号: 3 ページ: 1-1

    • DOI

      10.15252/embj.2020104705

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Selective autophagy of intracellular organelles: Recent research advances2021

    • 著者名/発表者名
      Li Wen、He Pengcheng、Huang Yuge、Li Yi-Fang、Lu Jiahong、Li Min、Kurihara Hiroshi、Luo Zhuo、Meng Tian、Onishi Mashun、Ma Changle、Jiang Lei、Hu Yongquan、Gong Qing、Zhu Dongxing、Xu Yiming、Liu Rong、Liu Lei、Yi Cong、Zhu Yushan、Ma Ningfang、Okamoto Koji、Xie Zhiping、Liu Jinbao、He Rong-Rong、Feng Du
    • 雑誌名

      Theranostics

      巻: 11 号: 1 ページ: 222-256

    • DOI

      10.7150/thno.49860

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Detection of mitophagy in mammalian cells, mice, and yeast2020

    • 著者名/発表者名
      Calvelli Hannah、Krigman Judith、Onishi Mashun、Narendra Derek P.、Sun Nuo、Okamoto Koji
    • 雑誌名

      Methods in Cell Biology

      巻: 155 ページ: 557-579

    • DOI

      10.1016/bs.mcb.2019.10.006

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Repression of mitochondrial metabolism for cytosolic pyruvate-derived chemical production in Saccharomyces cerevisiae2019

    • 著者名/発表者名
      Morita Keisuke、Matsuda Fumio、Okamoto Koji、Ishii Jun、Kondo Akihiko、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Microbial Cell Factories

      巻: 18 号: 1 ページ: 177-177

    • DOI

      10.1186/s12934-019-1226-6

    • NAID

      120006734920

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Paf1 complex transcriptionally regulates the mitochondrial-anchored protein Atg32 leading to activation of mitophagy2019

    • 著者名/発表者名
      Zheng Liangde、Shu Wen-Jie、Li Yu-Min、Mari Muriel、Yan Chaojun、Wang Dehe、Yin Zhao-Hong、Jiang Wei、Zhou Yu、Okamoto Koji、Reggiori Fulvio、Klionsky Daniel J.、Song Zhiyin、Du Hai-Ning
    • 雑誌名

      Autophagy

      巻: 19 号: 8 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1080/15548627.2019.1668228

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] ミトコンドリアを無標識で可視化する2021

    • 著者名/発表者名
      岡本 浩二、藤井 奏子、宮崎 淳
    • 学会等名
      第20回日本ミトコンドリア学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 巨大脂肪滴を形成する油脂酵母Lipomyces starkeyiのミトコンドリア分解2021

    • 著者名/発表者名
      Duan Lan、岡本 浩二
    • 学会等名
      第54回酵母遺伝学フォーラム研究報告会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Endoplasmic reticulum-related pathways act in mitochondrial clearance2021

    • 著者名/発表者名
      Koji Okamoto
    • 学会等名
      第73回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Regulation of mitophagy via endoplasmic reticulum membrane-bound factors2019

    • 著者名/発表者名
      Okamoto Koji
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia Conference on Mitochondria & Metabolism in Health and Disease
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Regulation of mitochondrial clearance via factors on the endoplasmic reticulum2019

    • 著者名/発表者名
      Okamoto Koji
    • 学会等名
      The 16th Conference of Asian Society for Mitochondrial Research and Medicine
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] The TORC1 signaling pathway regulates respiration-induced mitophagy in yeast2019

    • 著者名/発表者名
      Okamoto Koji
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 研究室紹介サイト(研究科ホームページ内)

    • URL

      https://www.fbs.osaka-u.ac.jp/ja/research_group/detail/8

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [備考] 研究室ホームページ

    • URL

      https://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/okamoto/index.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [備考] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/okamoto/Okamoto_Lab/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2019-11-29   更新日: 2024-03-26  

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