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Asgardアーキアは本当に真核生物の起源か?-世界初の培養株を用いた実態解明-

研究課題

研究課題/領域番号 19H01005
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分45:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
研究機関国立研究開発法人海洋研究開発機構

研究代表者

井町 寛之  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(超先鋭研究開発プログラム), 上席研究員 (20361933)

研究分担者 高野 淑識  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海洋機能利用部門(生物地球化学センター), センター長代理 (80399815)
延 優 (NOBUMASARU・KONISHI)  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (40805644)
諸野 祐樹  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(高知コア研究所), 主任研究員 (30421845)
玉木 秀幸  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究グループ長 (00421842)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
46,020千円 (直接経費: 35,400千円、間接経費: 10,620千円)
2021年度: 12,090千円 (直接経費: 9,300千円、間接経費: 2,790千円)
2020年度: 12,220千円 (直接経費: 9,400千円、間接経費: 2,820千円)
2019年度: 21,710千円 (直接経費: 16,700千円、間接経費: 5,010千円)
キーワードアーキア / Asgardアーキア / 真核生物の起源 / 嫌気性微生物 / 海底堆積物
研究開始時の研究の概要

Asgard (アスガルド) と呼ばれているアーキア群が真核生物の起源の最有力候補として大きな注目を集めている。しかしながら、メタゲノム解析でのみ同定されたAsgardアーキアは未だ培養株が存在しないため、Asgardアーキアが本当に真核生物細胞の起源となるような特徴を有しているのか不明であり、培養株を用いた直接的な検証が強く望まれている。本研究では、世界に先駆けて培養に成功したAsgardアーキアの培養株についてその細胞学・生理学的諸性質を明らかにし、Asgardアーキアが真の真核生物の起源たる原核生物であるかについて検証することを目指す。

研究成果の概要

真核生物の起源に関連する生物としてAsgardアーキアが注目されている。本研究では、世界で初めて培養に成功したAsgardアーキアMK-D1について、その詳細な細胞・生理・遺伝学的な特徴の解明を通じて、「Asgardアーキアが真核生物の起源と関係する原核生物であるのか」を明らかにすることを目的として研究を進めた。MK-D1は他のアーキアと同様な細胞膜脂質を持つ一方で、これまでの原核生物には見られない細胞形態を持つことや、他の微生物に依存した生育をすることなどが明らかとなった。得られたMK-D1の特徴およびこれまでの研究結果に基づいて、真核生物の誕生についての新しい進化説E3モデルを提案した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

私たちヒトをはじめとする真核生物の起源は生物学における大きな謎であり、解明されていない重要な課題の1つである。最近の研究からAsgardと呼ばれるアーキア群から真核生物が誕生したことが示唆されたが、このアーキア群に属する培養株は存在しなかったため、アーキアから真核生物へどのように進化したのかは不明のままであった。そのような中、私たちは世界に先駆けてAsgardに属するアーキアMK-D1の培養に成功し、その細胞・生理・遺伝的な特徴を明らかにした。得られた結果を基に、私たちの祖先となったアーキアの特徴を推定するとともに、真核生物誕生の新しいモデルを提案することで私たち真核生物の誕生の道筋を示した。

報告書

(5件)
  • 2022 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 3件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 2件、 招待講演 13件)

  • [国際共同研究] ハインリッヒ・ハイネ大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] ハインリッヒ・ハイネ大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] Detection of planktonic coenzyme factor 430 in a freshwater lake: small-scale analysis for probing archaeal methanogenesis2021

    • 著者名/発表者名
      Urai Atsushi、Matsushita Makoto、Park Ho-Dong、Imachi Hiroyuki、Ogawara Miyuki、Iwata Hiroki、Kaneko Masanori、Ogawa Nanako O.、Ohkouchi Naohiko、Takano Yoshinori
    • 雑誌名

      Progress in Earth and Planetary Science

      巻: 8 号: 1 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1186/s40645-021-00450-7

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Origin of Deep Methane Associated with a Unique Community of Microorganisms in an Organic- and Iodine-Rich Aquifer2021

    • 著者名/発表者名
      Urai Atsushi、Takano Yoshinori、Imachi Hiroyuki、Ishii Shun’ichi、Matsui Yohei、Ogawara Miyuki、Tasumi Eiji、Miyairi Yosuke、Ogawa Nanako O.、Yoshimura Toshihiro、Inagaki Fumio、Yokoyama Yusuke、Kawano Kenjiro、Murai Daisuke、Park Ho-Dong、Ohkouchi Naohiko
    • 雑誌名

      ACS Earth and Space Chemistry

      巻: 5 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1021/acsearthspacechem.0c00204

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 真核生物の起源アーキア:培養と新しい真核生物誕生モデルの提案2020

    • 著者名/発表者名
      井町寛之、延優
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 38 ページ: 1496-1500

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] 難培養性アーキアからみえてきた真核生物細胞の起源2020

    • 著者名/発表者名
      井町寛之、延優
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー(B&I)

      巻: 78 ページ: 332-334

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Isolation of an archaeon at the prokaryote-eukaryote interface2020

    • 著者名/発表者名
      Imachi Hiroyuki、Nobu Masaru K.、Nakahara Nozomi、Morono Yuki、Ogawara Miyuki、Takaki Yoshihiro、Takano Yoshinori、Uematsu Katsuyuki、Ikuta Tetsuro、Ito Motoo、Matsui Yohei、Miyazaki Masayuki、Murata Kazuyoshi、Saito Yumi、Sakai Sanae、Song Chihong、Tasumi Eiji、Yamanaka Yuko、Yamaguchi Takashi、Kamagata Yoich
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 577 号: 7791 ページ: 519-525

    • DOI

      10.1038/s41586-019-1916-6

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 海底アーキアから見えてきた私たち真核生物の起源2021

    • 著者名/発表者名
      井町寛之、延優
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第77回学術講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 海底アーキアから見出す私たち真核生物の進化の道筋2021

    • 著者名/発表者名
      延優、井町寛之
    • 学会等名
      日本Archaea研究会第33回講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 私の海底下微生物の培養プロトコル2021

    • 著者名/発表者名
      井町寛之
    • 学会等名
      極限環境生物学会第22回シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 海底アーキアから見えてきた私たち真核生物の成り立ち2021

    • 著者名/発表者名
      井町寛之、延優
    • 学会等名
      第32回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Isolation of a syntrophic archaeon from deep-sea sediment -a new window into eukaryogenesis2021

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Imachi
    • 学会等名
      International Center of Deep-Life Investigation (IC-DLI) Webinar
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 海底アーキアの生き方から考える私たち真核生物の成り立ち2021

    • 著者名/発表者名
      井町寛之
    • 学会等名
      生理研研究会 極限環境適応戦略
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 共生アーキアから見えてきた私たち真核生物の起源2021

    • 著者名/発表者名
      井町寛之、延優
    • 学会等名
      第1回ERATO深津共生進化機構プロジェクト共生進化機構先端セミナー
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 真核生物の誕生のカギを握るアーキア:培養と新しい真核生物誕生モデルの提案2020

    • 著者名/発表者名
      井町寛之、延優
    • 学会等名
      第7回日本細胞外小胞学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] An archaeon at the prokaryote-eukaryote interface: isolation and a new eukaryogenesis model.2020

    • 著者名/発表者名
      Imachi Hiroyuki、Nobu K. Masaru
    • 学会等名
      Thermal Biology Institute of Montana State University seminar
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 私たち真核生物の祖先?ーPart I. 海底から培養したアーキアとその生理学的特徴ー2020

    • 著者名/発表者名
      井町寛之
    • 学会等名
      第3回 ExCELLSシンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 私たち真核生物の祖先?ーPart II. 祖先アーキアのゲノムと新しい進化説ー2020

    • 著者名/発表者名
      延優
    • 学会等名
      第3回 ExCELLSシンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 私たち真核生物はどのようにして生まれたのか?2020

    • 著者名/発表者名
      井町寛之
    • 学会等名
      静岡県立沼津東高等学校・科学講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] An archaeon at the prokaryote-eukaryote interface: isolation and a new theory for eukaryogenesis2019

    • 著者名/発表者名
      Imachi Hiroyuki、Nobu Masaru K.
    • 学会等名
      The Origin of Eukaryote
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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