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水が引き起こす化学進化-高分解能AFMによる前生物的RNA合成のその場観察-

研究課題

研究課題/領域番号 19H02015
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分17050:地球生命科学関連
研究機関金沢大学 (2022)
立命館大学 (2019-2021)

研究代表者

荒木 優希  金沢大学, 数物科学系, 助教 (50734480)

研究分担者 古川 善博  東北大学, 理学研究科, 准教授 (00544107)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード水和構造 / 前生物的RNA / 周波数変調原子間力顕微鏡 / 重合反応 / 固液界面 / 周波数原子間力顕微鏡 / 水和 / 粘土 / 生命起源 / 吸着 / 触媒 / RNA / 周波数変調型原子間力顕微鏡
研究開始時の研究の概要

RNAは、遺伝情報の蓄積と生体反応の触媒の両方を担う分子として、生命の起源に最も重要な生体高分子と考えられている。初期地球におけるRNA(前生物的RNA)の形成は、粘土鉱物や金属イオンを触媒として起こったと考えられているが、その形成過程や環境について統一的な見解が得られていない。本研究では、高分解能の原子間力顕微鏡(FM-AFM)を用いてRNA形成(ヌクレオチドの重合)過程における水の挙動を分子スケールで観察する。ヌクレオチド表面が金属イオンによって局所的に脱水すること、水の存在によって粘土表面にヌクレオチドが秩序的に吸着することを明らかにし、生命起源における水の重要なはたらきを明らかにする。

研究成果の概要

本研究は、脱水反応であるRNAの形成が原始海洋中で起こりうるか解明すべく、触媒と考えられている鉱物表面の水、およびそれに対する溶存イオンの効果を原子スケール観察によって明らかにすることを目的とする。触媒鉱物表面でのヌクレオチドの吸着挙動とその際の鉱物表面の水和構造を周波数変調原子間力顕微鏡で高分解その場観察した結果、溶存するマグネシウムイオンがヌクレオチドの吸着を顕著に増大させ、そのとき鉱物表面の水の構造が変化していることが明らかとなった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

マグネシウムは生体内の酵素活性、結石の析出防止剤、整腸剤など水溶液中で起こる現象に非常によく使われている。マグネシウムが用いられる必然性は明らかにされていないが、本研究で着目した「物質表面の水への影響」がこれらの機構に関わっている可能性が高い。身近な物質であるため、近年、マグネシウムは石油掘削の潤滑剤や生分解性材料等、新たな活路を見出されており、マグネシウムが固体表面の水に及ぼす影響を継続して研究することで、これらの応用技術への波及効果が期待できる。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 3件、 招待講演 6件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] 炭酸カルシウム結晶の相転移過程における水和構造その場観察2022

    • 著者名/発表者名
      荒木優希,塚本勝男,高木良介,宮下知幸,大藪範昭,小林圭,山田啓文
    • 雑誌名

      表面と真空

      巻: 65 号: 11 ページ: 520-525

    • DOI

      10.1380/vss.65.520

    • ISSN
      2433-5835, 2433-5843
    • 年月日
      2022-11-10
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 周波数変調原子間力顕微鏡による液中、大気中の界面水のその場計測2022

    • 著者名/発表者名
      荒木優希
    • 学会等名
      神戸大学 界面科学コロキウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] マグネシウムイオンによる水和構造変化に起因する 粘土上へのヌクレオチド吸着2021

    • 著者名/発表者名
      荒木優希、古川善博
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合2021年大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 周波数変調原子間力顕微鏡による 固液界面その場観察 -鉱物-水-生命の関係を原子スケールで紐解く-2021

    • 著者名/発表者名
      荒木優希
    • 学会等名
      WaTUSイブニングセミナー
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] バイオミネラリゼーションにおける 界面のミクロ構造研究の重要性2021

    • 著者名/発表者名
      荒木優希
    • 学会等名
      第4回日本表面真空学会若手部会研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 添加物による水和構造への影響2020

    • 著者名/発表者名
      荒木優希, 小林圭, 山田啓文
    • 学会等名
      第49回日本結晶成長学会国内会議
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Prebiotic RNA evolution in liquid environment -in situ observation by FM-AFM-2020

    • 著者名/発表者名
      Yuki Araki
    • 学会等名
      Virtual ELSI Colloquium
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Influence of interface water of clay minerals on ion adsorption2019

    • 著者名/発表者名
      Yuki Araki,Masahiko Okumura,Yasunobu Ando,Kei Kobayashi,Hirofumi Yamada
    • 学会等名
      12th International Symposium on Atomic Level Characterizations for New Materials and Devices ‘19 (ALC’19)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Atomic-scale Visualization of Ion Behavior on Clay Minerals2019

    • 著者名/発表者名
      Yuki Araki,Masahiko Okumura,Yasunobu Ando,Kei Kobayashi,Hirofumi Yamada
    • 学会等名
      International Conference on Crystal Growth and Epitaxy (ICCGE-19)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 周波数変調原子間力顕微鏡による粘土表面のセシウム吸着の原子スケールその場観察2019

    • 著者名/発表者名
      荒木優希,奥村勝彦,安藤康伸,小林圭,山田啓文
    • 学会等名
      第47回可視化情報シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 立命館大学メゾスコピック物理研究室

    • URL

      https://mesoscopic.site

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 中田研究室

    • URL

      http://mesoscopic.site

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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