軽油相当のバイオ燃料を大量生産可能な高活性型アルカン合成関連酵素の創出

• 研究課題/領域番号: 19H02521
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 新井 宗仁 東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (90302801)
• 研究分担者: 林 勇樹 東京大学, 環境安全研究センター, 准教授 (90444059)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2024-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2023年度)
• 配分額: 17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円); 2023年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円); 2022年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円); 2021年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円); 2020年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円); 2019年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
• キーワード: バイオ燃料 / 酵素 / 酵素デザイン / タンパク質工学 / 進化分子工学 / 理論的設計 / タンパク質 / タンパク質デザイン

研究開始時の研究の概要

石油に代わる再生可能エネルギーを効率的に生産できる基盤技術の開発は、人類の永続的繁栄のために必須である。シアノバクテリアは、アシルACP還元酵素（AAR）とアルデヒド脱ホルミル化オキシゲナーゼ（ADO）という2つの酵素を用い、光合成で軽油相当のアルカンを合成できることから、地球温暖化の防止に有効な再生可能バイオエネルギーの生産源として注目されている。しかしAARとADOの活性は低いため、両酵素の高活性化が急務である。そこで本研究では、実験と理論の両アプローチでAARとADOの酵素活性を飛躍的に向上させた変異体を創出した後、それらをシアノバクテリアに導入し、バイオ燃料の大量生産の実現を目指す。

研究実績の概要

シアノバクテリアは、アシルACP還元酵素（AAR）とアルデヒド脱ホルミル化オキシゲナーゼ（ADO）という2つの酵素を用い、光合成で軽油相当のアルカンを合成できることから、カーボンニュートラルな再生可能バイオエネルギーの生産源として注目されている。しかし両酵素の活性は低いため、高活性化が必要である。そこで本研究では、これらの酵素活性を向上させ、微生物を用いたバイオ燃料生産を効率化させることを目指している。2023年度は次の研究を行った。
(1) これまでに得られたAARとADOの高活性化変異体などをシアノバクテリアSynechocystis sp. PCC 6803に導入する実験を行った。様々なAARとADOの組み合わせを検討したところ、次の結果を得た。①全ての場合において、シアノバクテリア野生株よりもアルカン合成量が増大し、最大で野生株の約5倍量のアルカン合成を達成できた。②野生株ではC17のアルカンが主に生産されたのに対し、導入したAAR/ADOの組み合わせによっては、C15のアルカン生産量が大幅に増大した。③AAR/ADOの高活性化変異体の導入により、野生型のAAR/ADOを導入した場合よりもアルカン生産量が増大した。
(2) タンパク質は特定の立体構造を形成してから機能を発揮するため、タンパク質の機能を制御するためには、タンパク質の構造形成反応機構の解明が重要である。そこで、タンパク質の構造形成反応を予測可能な物理学理論を構築した。この理論は今後、酵素反応の予測にも利用可能と期待される。
(3) 新規有用タンパク質の理論設計を可能とするために、Rosettaソフトウェアを用いたタンパク質の設計や、分子動力学シミュレーション、深層学習モデルを用いたタンパク質設計などを試みた。また、実験による理論設計の検証などを行った。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [国際共同研究] The Scripps Research Institute(米国)
• [雑誌論文] Crucial residue for tuning thermal relaxation kinetics in the biliverdin-binding cyanobacteriochrome photoreceptor revealed by site-saturation mutagenesis. (2024)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Yoshimura, M., Arai, M., Narikawa, R.
  • 雑誌名: J Mol Biol. 巻: 436 号: 5 ページ: 168451-168451
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2024.168451
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Reentrant condensation of a multicomponent cola/milk system induced by polyphosphate. (2024)
  • 著者名/発表者名: Furuki, T., Nobeyama, T., Suetaka, S., Matsui, R., Fukuoka, T., Arai, M., Shiraki, K.
  • 雑誌名: Food Chemistry: X 巻: 21 ページ: 101165-101165
  • DOI: 10.1016/j.fochx.2024.101165
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Dynamics and interactions of intrinsically disordered proteins. (2024)
  • 著者名/発表者名: Arai, M., Suetaka, S., Ooka, K.
  • 雑誌名: Current Opinion in Structural Biology 巻: 84 ページ: 102734-102734
  • DOI: 10.1016/j.sbi.2023.102734
  • 査読あり
• [雑誌論文] Accurate prediction of protein folding mechanisms by simple structure-based statistical mechanical models. (2023)
  • 著者名/発表者名: Ooka, K., Arai, M.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 14 号: 1 ページ: 6338-6338
  • DOI: 10.1038/s41467-023-41664-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Introduction of reversible cysteine ligation ability to the biliverdin-binding cyanobacteriochrome photoreceptor. (2023)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Yoshimura, M., Hoshino, H., Fushimi, K., Arai, M., & Narikawa, R.
  • 雑誌名: FEBS J. 巻: 290 号: 20 ページ: 4999-5015
  • DOI: 10.1111/febs.16911
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Rational peptide design for inhibition of the KIX?MLL interaction (2023)
  • 著者名/発表者名: Sato Nao、Suetaka Shunji、Hayashi Yuuki、Arai Munehito
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 13 号: 1 ページ: 6330-6330
  • DOI: 10.1038/s41598-023-32848-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structure and Function of Gli123 Involved in Mycoplasma mobile Gliding (2023)
  • 著者名/発表者名: Matsuike Daiki、Tahara Yuhei O.、Nonaka Takahiro、Wu Heng Ning、Hamaguchi Tasuku、Kudo Hisashi、Hayashi Yuuki、Arai Munehito、Miyata Makoto
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 巻: 205 号: 3
  • DOI: 10.1128/jb.00340-22
  • 査読あり
• [雑誌論文] A comparative study of unpasteurized and pasteurized frozen whole hen eggs using size-exclusion chromatography and small-angle X-ray scattering (2022)
  • 著者名/発表者名: Oka Yoshiki、Yukawa Hiroko、Kudo Hisashi、Ooka Koji、Wada Manami、Suetaka Shunji、Chang Mari、Kawai Hidenobu、Tanaka Ryouji、Ichikawa Masahiro、Suzuki Takahisa、Hayashi Yuuki、Handa Akihiro、Arai Munehito
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 12 号: 1 ページ: 9218-9218
  • DOI: 10.1038/s41598-022-12885-z
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The Wako-Saito-Munoz-Eaton model for predicting protein folding and dynamics. (2022)
  • 著者名/発表者名: Ooka, K., Liu, R., Arai, M.
  • 雑誌名: Molecules 巻: 27 号: 14 ページ: 4460-4460
  • DOI: 10.3390/molecules27144460
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Recent advances in the improvement of cyanobacterial enzymes for bioalkane production (2022)
  • 著者名/発表者名: Hayashi Yuuki、Arai Munehito
  • 雑誌名: Microbial Cell Factories 巻: 21 号: 1 ページ: 256-256
  • DOI: 10.1186/s12934-022-01981-4
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Intron-encoded domain of herstatin, an autoinhibitor of human epidermal growth factor receptors, is intrinsically disordered. (2022)
  • 著者名/発表者名: Tashiro, D., Suetaka, S., Sato, N., Ooka, K., Kunihara, T., Kudo, H., Inatomi, J., Hayashi, Y., Arai, M.
  • 雑誌名: Frontiers in Molecular Biosciences 巻: 9 ページ: 862910-862910
  • DOI: 10.3389/fmolb.2022.862910
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Rational design of a helical peptide inhibitor targeting c-Myb-KIX interaction. (2022)
  • 著者名/発表者名: Suetaka, S., Oka, Y., Kunihara, T., Hayashi, Y., Arai, M.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 12 号: 1 ページ: 816-816
  • DOI: 10.1038/s41598-021-04497-w
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Changes in dynamic and static structures of the HIV-1 p24 capsid protein N-domain caused by amino-acid substitution are associated with its viral viability. (2021)
  • 著者名/発表者名: Sato, Y., Matsugami, A., Watanabe, S., Hayashi, F., Arai, M., Kigawa, T., Nishimura, C.
  • 雑誌名: Protein Science 巻: 30 号: 11 ページ: 2233-2245
  • DOI: 10.1002/pro.4184
  • 査読あり
• [雑誌論文] ラン藻が持つアルカン合成関連酵素の高活性化 (2021)
  • 著者名/発表者名: 林勇樹、工藤恒、新井宗仁
  • 雑誌名: 生物工学 巻: 99 ページ: 469-472
  • NAID: 130008091572
• [雑誌論文] Repressor Activity of SqrR, a Master Regulator of Persulfide-Responsive Genes, Is Regulated by Heme Coordination (2021)
  • 著者名/発表者名: Shimizu T, Hayashi Y, Arai M, McGlynn SE, Masuda T, Masuda S
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol 巻: 62 号: 1 ページ: 100-110
  • DOI: 10.1093/pcp/pcaa144
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Determining Binding Kinetics of Intrinsically Disordered Proteins by NMR Spectroscopy (2020)
  • 著者名/発表者名: Yang Ke、Arai Munehito、Wright Peter E.
  • 雑誌名: Methods in Molecular Biology 巻: 2141 ページ: 663-681
  • DOI: 10.1007/978-1-0716-0524-0_34
  • ISBN: 9781071605233, 9781071605240
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Electrostatic interactions are essential for binding of two enzymes in cyanobacterial alkane biosynthesis. (2020)
  • 著者名/発表者名: Chang, M., Shimba, K., Hayashi, Y., & Arai, M.
  • 雑誌名: Biosci. Biotech. Biochem. 巻: 84 号: 2 ページ: 228-237
  • DOI: 10.1080/09168451.2019.1677142
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of non-conserved residues essential for improving the hydrocarbon-producing activity of cyanobacterial aldehyde-deformylating oxygenase (2019)
  • 著者名/発表者名: H Kudo, Y Hayashi, M Arai
  • 雑誌名: Biotechnology for Biofuels 巻: 12 号: 1 ページ: 89-89
  • DOI: 10.1186/s13068-019-1409-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Improving hydrocarbon production by engineering cyanobacterial acyl-(acyl carrier protein) reductase. (2019)
  • 著者名/発表者名: Kudo, H., Hayashi, Y., & Arai, M.
  • 雑誌名: Biotechnology for Biofuels 巻: 12 号: 1 ページ: 291-291
  • DOI: 10.1186/s13068-019-1623-4
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mutational analysis of a catalytically important loop containing active site and substrate-binding site in Escherichia coli phytase AppA (2019)
  • 著者名/発表者名: M Wada, Y Hayashi, M Arai
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 巻: 83 号: 5 ページ: 860-868
  • DOI: 10.1080/09168451.2019.1571897
  • 査読あり
• [雑誌論文] The retrograde signaling protein GUN1 regulates tetrapyrrole biosynthesis. (2019)
  • 著者名/発表者名: Shimizu, T., Kacprzak, S.M., Mochizuki, N., Nagatani, A., Watanabe, S., Shimada, T., Tanaka, K., Hayashi, Y., Arai, M., Leister, D., Okamoto, H., Terry, M.J., & Masuda, T.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 116 号: 49 ページ: 24900-24906
  • DOI: 10.1073/pnas.1911251116
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] タンパク質の構造ダイナミクスを予測可能とする物理学理論の開発 (2024)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁、大岡紘治、劉潤晶、加藤沙愛、長井駿
  • 学会等名: 日本農芸化学会2024年度大会
  • 招待講演
• [学会発表] 有用タンパク質の合理的設計に向けて (2024)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 高分子進化工学 第2回公開シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] タンパク質のフォールディングとデザイン (2024)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 第12回デジタルバイオ研究会
  • 招待講演
• [学会発表] タンパク質のフォールディングとデザイン (2023)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 京都大学大学院理学研究科化学専攻 学術講演会
  • 招待講演
• [学会発表] Accurate prediction of protein folding mechanisms by simple statistical mechanical models (2023)
  • 著者名/発表者名: Arai, M.
  • 学会等名: 21st KIAS Conference on Protein Structure and Function
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] タンパク質のフォールディングとデザイン研究の新展開 (2023)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 生物物理若手の会 夏の学校
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular dynamics simulations of substrate binding and product dissociation dynamics of a cyanobacterial alkane synthase (2023)
  • 著者名/発表者名: Yoshimura, M., Oda, S., Arai, M.
  • 学会等名: 第61回日本生物物理学会年会
• [学会発表] 合理的なリンカー設計による二価型キメラペプチド阻害剤の開発 (2023)
  • 著者名/発表者名: 佐藤那音、季高駿士、新井宗仁
  • 学会等名: 第23回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] ポリリン酸が引き起こす多成分複合系のリエントラント凝縮 (2023)
  • 著者名/発表者名: 古木智大、延山知弘、季高駿士、新井宗仁、白木賢太郎
  • 学会等名: 第23回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 機能性タンパク質の理論的設計 (2022)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 物性研短期研究会「理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働」
  • 招待講演
• [学会発表] タンパク質の立体構造予測ツールAlphaFold 2を使って何ができるのか (2022)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: ラン藻ゲノム交流会2022
  • 招待講演
• [学会発表] Computational and experimental studies of hot spots in the c-Myb-KIX interaction (2022)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: CBI学会2022年大会
• [学会発表] Rational design of proteins that can inhibit allergic diseases (2022)
  • 著者名/発表者名: 寺西美月、佐藤那音、季高駿士、佐野美桜、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Identifying key residues of c-Myb-KIX interaction by alanine scanning mutagenesis (2022)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Search for helix-mimetic compounds that inhibit protein-protein interactions (2022)
  • 著者名/発表者名: 佐藤那音、季高駿士、本多栄治、高島一、竹原大、吉森篤史、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Rational drug design to inhibit α-helix-mediated protein-protein interactions (2021)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、佐藤那音、本多栄治、高島一、岡芳樹、椢原朋子、竹原大、吉森篤史、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第59回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Rational design of the peptide inhibitor targeting the interactions involved in transcriptional activation (2021)
  • 著者名/発表者名: 佐藤那音、季高駿士、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第59回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Rational design of an interleukin-33/ST2 inhibitor for suppressing allergic asthma (2021)
  • 著者名/発表者名: 寺西美月、佐野美桜、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第59回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Facilitating a two-step enzymatic reaction by trapping two enzymes in light-inducible droplets (2021)
  • 著者名/発表者名: 大窪理仁、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第59回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Rational design of highly active mutants of an alkane-producing enzyme (2021)
  • 著者名/発表者名: 磯田正覚、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第59回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Visualized and Quantitative Structural Analysis of Peptidomimetics for PPI Drug Discovery (2021)
  • 著者名/発表者名: Hajime Takashima, Atsushi Yoshimori, Eiji Honda, Tomonori Taguri, Jun Ozawa, Satoshi Shuto, Shunji Suetaka, Nao Sato, Yuuki Hayashi, Munehito Arai, Dai Takehara
  • 学会等名: CBI学会2021年大会
• [学会発表] c-Myb-KIX間相互作用を阻害するヘリカルペプチドの合理的設計 (2021)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: CBI学会2021年大会
• [学会発表] Structural Peptidomimetics (2): PPIs Hit Discovery Using PepMetics Library (2021)
  • 著者名/発表者名: Eiji Honda, Hajime Takashima, Dai Takehara, Atsushi Yoshimori, Shunji Suetaka, Yuuki Hayashi, Munehito Arai
  • 学会等名: ACS Fall 2021
  • 国際学会
• [学会発表] Rational design of inhibitors targeting the interaction between interleukin-33 and its receptor ST2 (2021)
  • 著者名/発表者名: 寺西美月、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第21回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Rational design of the peptide inhibitor targeting the interaction of the KIX domain of the transcriptional coactivator CBP with transcriptional activators (2021)
  • 著者名/発表者名: 佐藤那音、季高駿士、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第21回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Discovery of helix mimetic inhibitors targeting the interactions between the transcriptional activators and coactivator (2021)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、林勇樹、本多栄治、高島一、新井宗仁
  • 学会等名: 第21回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] High-throughput screening of acyl-ACP reductase using the activity-dependent E. coli luminescence and evaluation of highly active mutants (2021)
  • 著者名/発表者名: 林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第21回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] タンパク質分子機能の合理的設計 (2021)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 日本化学会 第101春季年会 中長期テーマシンポジウム「次世代分子システムが拓く未来の化学―協奏的機能連動」
  • 招待講演
• [学会発表] NMRによるタンパク質間相互作用の解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 次世代NMRワークショップ
  • 招待講演
• [学会発表] 実験的手法と理論的手法によるc-Myb－KIX間相互作用に重要なアミノ酸残基の特定同定 (2021)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第10回日本生物物理学会関東支部会
• [学会発表] 転写コアクチベーターCBPのKIXドメインと転写アクチベーターとの相互作用を標的としたPPI阻害剤の合理的設計 (2021)
  • 著者名/発表者名: 佐藤那音、季高駿士、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第10回日本生物物理学会関東支部会
• [学会発表] IL33-ST2のPPI阻害剤の論理的設計と実験的検証 (2021)
  • 著者名/発表者名: 寺西美月、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第10回日本生物物理学会関東支部会
• [学会発表] 統計力学モデルの拡張によるタンパク質のフォールディング機構の解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 大岡紘治、新井宗仁
  • 学会等名: 第10回日本生物物理学会関東支部会
• [学会発表] Theoretical approaches to protein folding and design (2020)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 第58回日本生物物理学会年会シンポジウム "Biophysical studies on protein folding-misfolding and aggregation with regard to life sciences"
  • 招待講演
• [学会発表] Rational design of an alpha-helical peptide to inhibit c-Myb-KIX interaction (2020)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第58回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Rational design of the peptide inhibitor targeting the KIX domain of CBP and transcriptional activators interaction (2020)
  • 著者名/発表者名: 佐藤那音、季高駿士、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第58回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Protein folding mechanisms predicted by an extended statistical mechanical model (2020)
  • 著者名/発表者名: 大岡紘治、新井宗仁
  • 学会等名: 第58回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Structural analysis of MMOB1620 which composes Mycoplasma mobile's motor (2020)
  • 著者名/発表者名: 佐藤宏樹、児玉彩、工藤恒、大岡紘治、季高駿士、林勇樹、新井宗仁、宮田真人
  • 学会等名: 第58回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Rational design of small proteins that inhibit a transcriptional activator-coactivator interaction (2020)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第20回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Rational design of an inhibitor for the interaction of the KIX domain of CBP with transcriptional activators (2020)
  • 著者名/発表者名: 佐藤那音、季高駿士、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第20回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Prediction of folding pathways of multi-domain proteins by an extended statistical mechanical model (2020)
  • 著者名/発表者名: 大岡紘治、新井宗仁
  • 学会等名: 第20回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 機能性タンパク質システムの理論的デザインに向けて (2020)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 日本化学会第100春季年会 中長期テーマシンポジウム「次世代分子システムが拓く未来の化学」
  • 招待講演
• [学会発表] Mycoplasma mobile が持つモーターを構成する機能未知タンパク質、MMOB1620 の構造 (2020)
  • 著者名/発表者名: 佐藤宏樹、工藤恒、児玉彩、大岡紘治、季高駿士、林勇樹、新井宗仁、宮田真人
  • 学会等名: 第93回日本細菌学会総会
• [学会発表] アレルギー性喘息に関わるインターロイキン33阻害剤の開発に向けて (2020)
  • 著者名/発表者名: 佐野美桜、岡芳樹、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第９回日本生物物理学会関東支部会
• [学会発表] Rational design of binding proteins for PPI inhibition and antibody purification (2019)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 19th KIAS Conference on Protein Structure and Function
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 理論と実験によるタンパク質デザイン (2019)
  • 著者名/発表者名: 新井宗仁
  • 学会等名: 第71回日本生物工学会大会シンポジウム「タンパク質工学におけるドライ－ウェット技術融合の新展開」
  • 招待講演
• [学会発表] ラン藻由来アルカン合成関連酵素の高活性化に重要な非保存部位の探索 (2019)
  • 著者名/発表者名: 工藤恒、張マリ、大岡絋治、季高駿士、佐野美桜、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「天然物生合成の構造生物学と合成生物学の協奏」
  • 招待講演
• [学会発表] アルカン合成関連酵素の高活性化に重要な非保存部位の同定 (2019)
  • 著者名/発表者名: 工藤恒、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第19回 東京大学生命科学シンポジウム
• [学会発表] タンパク質間相互作用を阻害しうるペプチドの合理的設計 (2019)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第19回 東京大学生命科学シンポジウム
• [学会発表] 統計力学モデルによるタンパク質のフォールディング反応機構の予測 (2019)
  • 著者名/発表者名: 大岡紘治、新井宗仁
  • 学会等名: 第19回 東京大学生命科学シンポジウム
• [学会発表] 細胞内酵素活性に応じて発光する大腸菌を利用したアシル-ACP還元酵素の高活性変異体の創出 (2019)
  • 著者名/発表者名: 林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 統計力学モデルの拡張によるリゾチームとα-ラクトアルブミンのフォールディング反応機構の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 大岡紘治、新井宗仁
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] c-Myb-KIX間相互作用を標的としたペプチド阻害剤の合理的設計 (2019)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] ラン藻由来アルカン合成関連酵素の高活性化に重要な非保存部位の探索 (2019)
  • 著者名/発表者名: 工藤恒、張マリ、大岡絋治、季高駿士、佐野美桜、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] アルカン合成関連酵素間の結合に必要な静電相互作用 (2019)
  • 著者名/発表者名: 張マリ、榛葉啓悟、工藤恒、季高駿士、大岡紘治、佐野美桜、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Identification of the residues that are responsible for improving the activities of cyanobacterial enzymes for hydrocarbon biosynthesis (2019)
  • 著者名/発表者名: 工藤恒、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: Enzyme Engineering XXV
  • 国際学会
• [学会発表] 細胞内発光を利用したハイスループットスクリーニングにより得られた高活性変異体アシルACP還元酵素の評価 (2019)
  • 著者名/発表者名: 林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第71回日本生物工学会大会
• [学会発表] Computational design of a peptide inhibitor targeting c-Myb-KIX interaction (2019)
  • 著者名/発表者名: 季高駿士、岡芳樹、椢原朋子、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Improving activity of dihydrofolate reductase by theoretical saturation mutagenesis (2019)
  • 著者名/発表者名: 大原和久、岡芳樹、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Structural analysis of MMOB1620 which composes Mycoplasma mobile's motor (2019)
  • 著者名/発表者名: 佐藤宏樹、児玉彩、工藤恒、大岡紘治、季高駿士、林勇樹、新井宗仁、宮田真人
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Prediction of protein folding mechanisms by an extended statistical mechanical model (2019)
  • 著者名/発表者名: 大岡紘治、新井宗仁
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Toward the development of an inhibitor of interleukin-33 responsible for allergic asthma (2019)
  • 著者名/発表者名: 佐野美桜、岡芳樹、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Rational design of peptides that inhibit interactions between the KIX domain of CBP and transcription factors (2019)
  • 著者名/発表者名: 佐藤那音、季高駿士、林勇樹、新井宗仁
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [図書] バイオ燃料生産に向けたラン藻由来アルカン生成酵素の高活性化（植田充美 監修「バイオエネルギー再燃」） (2021)
  • 著者名/発表者名: 林勇樹、工藤恒、新井宗仁
  • 総ページ数: 9
  • 出版者: シーエムシー出版
  • ISBN: 9784781316215
• [備考] 新井研究室のホームページ
  • URL: https://folding.c.u-tokyo.ac.jp/
• [備考] 新井研究室のホームページ
  • URL: http://folding.c.u-tokyo.ac.jp/