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RNA可視化法と発光イメージング法に基づく生細胞遺伝子発現時空間解析法の創出

研究課題

研究課題/領域番号 19H02745
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分34020:分析化学関連
研究機関東京大学

研究代表者

吉村 英哲  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (90464205)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円)
2021年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2020年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2019年度: 8,840千円 (直接経費: 6,800千円、間接経費: 2,040千円)
キーワードバイオイメージング / 生物発光 / RNA / 細胞 / 遺伝子発現 / 顕微鏡
研究開始時の研究の概要

本研究は申請者が独自に構築したRNAイメージング技術を基盤として、多数細胞からなる集団において1細胞ごとの生細胞内遺伝子発現の時空間変化を、細胞内局在を解析可能な空間解像度で数日以上にわたって定量分析する、世界初の技術創出を目指す。この技術を用いて、多細胞集団の中で個々の細胞に確率論的に生じる細胞生理現象、すなわちリプログラミング(iPS細胞化)や分化誘導、ガン化などの細胞現象が生じるための必要十分条件となる遺伝子発現時空間特性を同定する。さらに本手法の原理実証のため、体細胞のリプログラミングなどの細胞生理現象について本手法を適用し、現象を生じる遺伝子発現時空間特性の必要十分条件を検討する。

研究成果の概要

本研究では任意のRNAを細胞内で標識し、生物発光を利用して可視化検出する生物発光RNAプローブの開発を行った。開発したプローブの機能を溶液内で評価したところ、標的RNAの添加とともに発光が上昇し、RNaseの添加により標的RNAが分解すると速やかに発光が減少した。このプローブをホ乳類培養細胞に適用し生物発光顕微鏡で観察を行うと、細胞の外部刺激を受けた応答にともないRNAの局在変化が生物発光により観察された。これらの結果から、本研究では生細胞内RNAを標的とした生物発光プローブの開発を行い、細胞内での内在性RNAの局在変化の可視化追跡を実現した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究の結果から、開発したプローブは生細胞内において標的とする内在性RNAの細胞現象に伴う局在変化を可視化追跡可能な性能を有することが示された。本プローブの特徴として、標的とするRNAの配列に応じて、そのRNAを標的とするようにカスタムメイドにデザインできることがある。すなわち、本プローブの原理を用いて様々なRNAを標的として生細胞内で局在変化を経時観察できるようになる。またRNAは遺伝子発現産物であり、各種網羅的解析により同定されたRNAが標的とする生理機能の発現過程において示す動態解析にも応用可能である。

報告書

(4件)
  • 2022 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件、 招待講演 5件) 図書 (4件)

  • [雑誌論文] A Series of Furimazine Derivatives for Sustained Live-Cell Bioluminescence Imaging and Application to the Monitoring of Myogenesis at the Single-Cell Level2022

    • 著者名/発表者名
      Orioka Mariko、Eguchi Masatoshi、Mizui Yuki、Ikeda Yuma、Sakama Akihiro、Li Qiaojing、Yoshimura Hideaki、Ozawa Takeaki、Citterio Daniel、Hiruta Yuki
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry

      巻: 33 号: 3 ページ: 496-504

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.2c00035

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Triple-color single-molecule imaging for analysis of the role of receptor oligomers in signal transduction2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura Hideaki
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 19 号: 0 ページ: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v19.0007

    • ISSN
      2189-4779
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Discovery of a phase-separating small molecule that selectively sequesters tubulin in cells2022

    • 著者名/発表者名
      Ado Genyir、Noda Naotaka、Vu Hue T.、Perron Amelie、Mahapatra Amarjyoti D.、Arista Karla Pineda、Yoshimura Hideaki、Packwood Daniel M.、Ishidate Fumiyoshi、Sato Shin-ichi、Ozawa Takeaki、Uesugi Motonari
    • 雑誌名

      Chemical Science

      巻: 13 号: 19 ページ: 5760-5766

    • DOI

      10.1039/d1sc07151c

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Long-term single cell bioluminescence imaging with C-3 position protected coelenterazine analogues2021

    • 著者名/発表者名
      Mizui Yuki、Eguchi Masatoshi、Tanaka Masanobu、Ikeda Yuma、Yoshimura Hideaki、Ozawa Takeaki、Citterio Daniel、Hiruta Yuki
    • 雑誌名

      Organic & Biomolecular Chemistry

      巻: 19 号: 3 ページ: 579-586

    • DOI

      10.1039/d0ob02020f

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Signaling activations through G-protein-coupled-receptor aggragations.2020

    • 著者名/発表者名
      Watabe, M., Yoshimura, H., Ajunan, S.N.V., Kaizu, K., Takahashi, K.
    • 雑誌名

      Phys. Rev. E

      巻: 102 号: 3 ページ: 032413-032413

    • DOI

      10.1103/physreve.102.032413

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Synergetic roles of Formyl Peptide Receptor 1 oligomerization in ligand-induced signal transduction2020

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi T, Yoshimura H, Kasai RS, Fujiwara TK, Ozawa T
    • 雑誌名

      ACS Chem. Biol.

      巻: 15 号: 9 ページ: 2577-2587

    • DOI

      10.1021/acschembio.0c00631

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 生細胞1分子観察による分子集合体形成とシグナル入力反応の可視化分析2021

    • 著者名/発表者名
      吉村英哲、西口知輝、小澤岳昌
    • 学会等名
      日本分析化学会第70年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 蛍光イメージング分光法 生細胞への応用と蛍光ライブイメージング2021

    • 著者名/発表者名
      吉村英哲
    • 学会等名
      光とレーザーの科学技術フェア2021「分光フェア」分光セミナー
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Oligomer Formation and Signal Transduction of GPCR - A Single-Molecule Live Imaging Study -2021

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Yoshimura
    • 学会等名
      14th International Symposium on Nanomedicine joint with 11th Taiwan-Japan-Korea Nanomedicine Meeting
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生命の仕組みを解明する蛍光分析 -生きたままの細胞を対象に-2020

    • 著者名/発表者名
      吉村英哲
    • 学会等名
      光とレーザーの科学技術フェア2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The roles of receptor oligomerization for signal transduction - A study through single-molecule live-cell imaging-2019

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Yoshimura
    • 学会等名
      13th International Symposium on Nanomedicine
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 分子動態からメカニズムを探る -生細胞1分子イメージングを用いたアプローチ-2019

    • 著者名/発表者名
      吉村英哲
    • 学会等名
      第11回光塾
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] Optical monitoring of single molecule dynamics of RNA in living cells2021

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Yoshimura*, Takeaki Ozawa
    • 総ページ数
      12
    • 出版者
      Springer Series in Chemical Physics,”Progress in Photon Science”
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] 日本分光学会監修 『紫外可視・蛍光分光法』 第3章 蛍光イメージング分光法(FRET, FCS, FCCS):生細胞への応用2021

    • 著者名/発表者名
      吉村英哲
    • 総ページ数
      14
    • 出版者
      講談社サイエンティフィク刊
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] 日本分光学会監修 『紫外可視・蛍光分光法』 付録 蛍光プローブに用いられる色素の一覧2021

    • 著者名/発表者名
      吉村英哲
    • 総ページ数
      16
    • 出版者
      講談社サイエンティフィク刊
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] 発光イメージング実験ガイド プロトコール編 II-4 「二分割ルシフェラーゼ再構成法による発光プローブ」2019

    • 著者名/発表者名
      永井 健治、小澤 岳昌
    • 総ページ数
      223
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758122405
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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