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細菌の環境での生き様の理解による有用細菌の実環境利用への展開

研究課題

研究課題/領域番号 19H02865
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分38020:応用微生物学関連
研究機関東北大学

研究代表者

永田 裕二  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (30237531)

研究分担者 大坪 嘉行  東北大学, 生命科学研究科, 准教授 (40342761)
加藤 広海  東北大学, 生命科学研究科, 助教 (90727265)
津田 雅孝  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (90172022)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
2021年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2020年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2019年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
キーワード環境細菌 / 極貧栄養環境 / 細菌コミュニティ / バイオレメディエーション / 炭酸固定
研究開始時の研究の概要

有用細菌の実環境利用における問題の主因は、細菌の環境での生き様が十分に理解されていないことによる。本研究では、環境汚染物質分解細菌株をモデルとして、極貧栄養条件下での適応・増殖戦略と、当該物質分解コミュニティに共在するが分解能を持たない他細菌株との関係性に着目し、環境細菌の実環境での生き様の理解を深める。さらに、分解細菌の効果を最大限に発揮するための具体的接種方法を提示し、実環境での有用細菌株の効率的利用のための理論的基盤を構築する。

研究成果の概要

従属栄養細菌である有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌株が、アルコールデヒドロゲナーゼをコードするadhX遺伝子の高発現で、低栄養環境下でCO2固定を伴ない増殖する現象を見出した。さらに、新規qTn-Seq法などを利用して、本現象の機構を推定した。一方、非分解細菌Cupriavidus株がgamma-HCH分解細菌コミュニティ形成の鍵であることを見出した。また、移動性のPaenibacillus株が非移動性のgamma-HCH分解細菌株の棲息領域を拡大するヒッチハイク現象を見出し、本現象がgamma-HCH分解細菌株の土壌環境での生残性を向上させる結果を得た。

研究成果の学術的意義や社会的意義

有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌株をモデルとして、環境汚染物質分解細菌の低栄養環境下での新奇適応現象を見出すと共に、その機構解明に繋がる知見を得た。また、分解細菌単独よりも、非分解細菌を含むコミュニティの方が長期持続的な分解活性を維持する現象を見出し、その鍵となる細菌株を同定した。これら知見は基礎学問的に新奇な知見であるだけでなく、バイオレメディエーションなどの微生物の実環境利用や、微生物の効率的利用による物質生産などにも応用可能である。

報告書

(4件)
  • 2022 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (81件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (15件) (うち国際共著 1件、 査読あり 15件、 オープンアクセス 11件) 学会発表 (66件) (うち招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Genome evolution related to γ-hexachlorocyclohexane metabolic function in the soil microbial population2022

    • 著者名/発表者名
      Kato Hiromi、Su Lijun、Tanaka Ayami、Katsu Honami、Ohtsubo Yoshiyuki、Otsuka Shigeto、Senoo Keishi、Nagata Yuji
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 86 号: 6 ページ: 800-809

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac042

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reconstruction of a Soil Microbial Network Induced by Stress Temperature2022

    • 著者名/発表者名
      Yang Dailin、Kato Hiromi、Kawatsu Kazutaka、Osada Yutaka、Azuma Toyohiro、Nagata Yuji、Kondoh Michio
    • 雑誌名

      Microbiology Spectrum

      巻: 10 号: 5

    • DOI

      10.1128/spectrum.02748-22

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Algorisms used for in silico finishing of bacterial genomes based on short-read assemblage implemented in GenoFinisher, AceFileViewer, and ShortReadManager2022

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Yoshiyuki、Hirose Yuu、Nagata Yuji
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 86 号: 6 ページ: 693-703

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac032

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 従属栄養細菌の極貧栄養環境でのCO<sub>2</sub>依存的な増殖現象2022

    • 著者名/発表者名
      永田 裕二、加藤 広海、大坪 嘉行
    • 雑誌名

      環境バイオテクノロジー学会誌

      巻: 22 号: 1 ページ: 9-13

    • DOI

      10.50963/jenvbio.22.1_9

    • ISSN
      1347-1856, 2436-5041
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Microbial communities developing within bulk sediments under fish carcasses on a tidal flat2021

    • 著者名/発表者名
      Kawamoto Y, Kato H, Nagata Y, and Urabe J
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 16 号: 2 ページ: e0247220-e0247220

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0247220

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural and catalytic effects of surface loop-helix transplantation within haloalkane dehalogenase family2020

    • 著者名/発表者名
      Marek M, Chaloupkova R, Prudnikova T, Sato Y, Rezacova P, Nagata Y, Smatanova IK, Damborsky J
    • 雑誌名

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      巻: 18 ページ: 1352-1362

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2020.05.019

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Transcriptome Analysis of Zygotic Induction During Conjugative Transfer of Plasmid RP42020

    • 著者名/発表者名
      Miyakoshi Masatoshi、Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 11 ページ: 1125-1125

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.01125

    • NAID

      120007165442

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A transcriptional regulator, IscR, of Burkholderia multivorans acts as both repressor and activator for transcription of iron-sulfur cluster-biosynthetic isc operon2020

    • 著者名/発表者名
      Nonoyama S, Kishida K, Sakai K, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M
    • 雑誌名

      Research in Microbiology

      巻: 171 号: 8 ページ: 319-330

    • DOI

      10.1016/j.resmic.2020.06.005

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Special Issue: Microbial degradation of xenobiotics2020

    • 著者名/発表者名
      Nagata Y
    • 雑誌名

      Microorganisms

      巻: 8 号: 4 ページ: 487-487

    • DOI

      10.3390/microorganisms8040487

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 従属栄養細菌のCO2依存的な極貧栄養環境適応2020

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 雑誌名

      イオサイエンスとインダストリー

      巻: 78 ページ: 498-500

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expression of an alcohol dehydrogenase gene in a heterotrophic bacterium induces carbon dioxide-dependent high-yield growth under oligotrophic conditions2020

    • 著者名/発表者名
      Shinnosuke Inaba, Hironori Sakai, Hiromi Kato, Takayuki Horiuchi, Hirokazu Yano, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, and Yuji Nagata
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 166 号: 6 ページ: 531-545

    • DOI

      10.1099/mic.0.000908

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Suppression of substrate inhibition in phenanthrene-degrading Mycobacterium by co-cultivation with a non-degrading Burkholderia strain.2019

    • 著者名/発表者名
      Natsumi Ogawa, Hiromi Kato, Kouhei Kishida, Eikichi Ichihashi, Taichiro Ishige, Hirofumi Yoshikawa, Yuji Nagata, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 印刷中 号: 6 ページ: 625-637

    • DOI

      10.1099/mic.0.000801

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Properties and efficient scrap-and-build repairing of mechanically sheared 3’ DNA ends2019

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Yoshiyuki、Sakai Keiichiro、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 2 号: 1 ページ: 409-409

    • DOI

      10.1038/s42003-019-0660-7

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Conjugative Transfer of IncP-9 Catabolic Plasmids Requires a Previously Uncharacterized Gene, mpfK, Whose Homologs Are Conserved in Various MPFT-Type Plasmids2019

    • 著者名/発表者名
      Kishida Kouhei、Nonoyama Shouta、Lukas Tim、Kawahara Shotaro、Kudo Koji、Nagata Yuji、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 85 号: 24

    • DOI

      10.1128/aem.01850-19

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Lessons from the genomes of lindane‐degrading sphingomonads2019

    • 著者名/発表者名
      Nagata Yuji、Kato Hiromi、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
    • 雑誌名

      Environmental Microbiology Reports

      巻: 11 号: 5 ページ: 630-644

    • DOI

      10.1111/1758-2229.12762

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 土壌細菌の進化と種間相互作用2023

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      第34回加藤記念研究助成贈呈式特別講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 土壌圏微生物による人工農薬分解のフロンティア2023

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      日本農薬学会第48回大会 未来開拓シンポジウム「将来の植物保護に向けた応用微生物学」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Uncovering the Dynamics of Microbial Genomic Structure and Function in Relation to Carbon Source Variation: An Investigation of Taxonomic Succession and Metagenome Composition2023

    • 著者名/発表者名
      Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
    • 学会等名
      第17回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 土壌の違いが細菌叢形成に与える影響2023

    • 著者名/発表者名
      平野 翔子、加藤 広海、Leonardo Stari、大坪 嘉行、永田 裕二
    • 学会等名
      第17回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 細菌由来のデハロゲナーゼを発現するシロイヌナズナ植 物の人工農薬分解活性2023

    • 著者名/発表者名
      鄧 文昊、高田 美信、大坪 嘉行、渡辺 正夫、永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] The succession of taxonomic structure and metagenome composition of bacterial community cultured with different carbon sources2023

    • 著者名/発表者名
      Leonardo Stari、Hiromi Kato、Yoshiyuki Ohtsubo、 Yuji Nagata
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 従属栄養細菌の超低栄養環境での増殖を引き起こすAdhXは promiscuousなアルコール脱水酵素である2023

    • 著者名/発表者名
      伊藤 蓮、永田 裕二、大坪 嘉行
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 混合無菌土壌に移植した土壌細菌集団の菌叢形成2023

    • 著者名/発表者名
      平野 翔子、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] PCB分解細菌の可動性遺伝因子ICEKKS102Tn4677 の oriT における TraR標的の探索2023

    • 著者名/発表者名
      松本 哲、永田 裕二、大坪 嘉行
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌の機能と進化2023

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、Stari Leonardo、加藤広海、大坪嘉行
    • 学会等名
      第70回日本生態学会大会シンポジウム「土壌圏の複雑性と適応性を明らかにする総合科学」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] γ-HCH 分解細菌の多様性と進化2022

    • 著者名/発表者名
      勝 保奈実、蘇 立俊、田中 彩美、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二
    • 学会等名
      第16回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 二価サブライブラリ構築による新型コロナウィルスに結合する DNA アプタマーの取得と展開2022

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行、永田裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会シンポジウム「機能性核酸の創製と生命科学応用に向けた新展開」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia株由来の細胞外多糖類画分による難培養 性 Verrucomicrobia門細菌の集積培養2022

    • 著者名/発表者名
      笹川 航,加藤 広海,大坪 嘉行,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ヒッチハイク現象の環境汚染物質分解細菌への応用2022

    • 著者名/発表者名
      岩本 和音,加藤 広海,大坪 嘉行,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] γ-HCH 分解細菌コミュニティ形成におけるCupriavidus 株の重要性2022

    • 著者名/発表者名
      佐子川 さやか,羽賀 千晃,加藤 広海,大坪 嘉行,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] gamma-HCH 脱塩化水素酵素 LinA による DDT の分解2022

    • 著者名/発表者名
      伊藤 蓮 ,カファヤ ユスフ ,宮内 啓介 ,大坪 嘉行 , 永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 細菌由来の有機塩素系殺虫剤分解に関わるデハロゲナー ゼを発現するシロイヌナズナ植物の作製2022

    • 著者名/発表者名
      鄧 文昊,高田 美信,大坪 嘉行,渡辺 正夫,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤分解細菌が産生する membrane vesicle に含まれる DNA2022

    • 著者名/発表者名
      石原 知行,加藤 広海,大坪 嘉行,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] qTn-Seq 法を用いたSphingobium japonicum UT26 株 の超低栄養環境での増殖に関わる遺伝子の同定2022

    • 著者名/発表者名
      野々山 翔太,柳 熙盟,加藤 広海,大坪 嘉行,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ICE 接合伝達に関与する推定転写因子 TraR の標的遺伝 子の探索2022

    • 著者名/発表者名
      松本 哲,永田 裕二,大坪 嘉行
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 細菌の環境適応・機能進化機構の 包括的理解と環境細菌の高度利用 および未開拓潜在機能開発への応用2022

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      公益財団法人発酵研究所 (IFO) 第16回助成研究報告会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 異なる無菌土壌への細菌集団移植時の菌叢形成2022

    • 著者名/発表者名
      平野 翔子, 加藤 広海, 大坪 嘉行,永田 裕二
    • 学会等名
      微生物生態学会35回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Community succession of a soil bacterial population cultured with different carbon sources2022

    • 著者名/発表者名
      Stari Lazo Leonardo Alfredo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Cupriavidus株が長期持続的g-HCH分解細菌集団形成の鍵である2022

    • 著者名/発表者名
      佐子川さやか、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌機能発現を支える種間相互作用2022

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      大隅基礎科学創成財団微生物コンソーシアム定例会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] バクテリアにおけるヒッチハイク現象の環境浄化技術への応用2021

    • 著者名/発表者名
      岩本和音、Kafayat Olaide Yusuf Habibullah、加藤広海、永田裕二
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] γ-HCH分解細菌コミュニティの固体培地上での異種複合コロニー形成2021

    • 著者名/発表者名
      佐子川 さやか 羽賀千晃 加藤広海 永田裕二
    • 学会等名
      微生物生態学会34回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 土壌環境中でのγ -HCH 分解細菌の多様性と進化2021

    • 著者名/発表者名
      勝 保奈実 , 田中 彩美 , 加藤 広海 , 永田 裕二
    • 学会等名
      微生物生態学会34回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] メタゲノムから見た土壌環境のγ -HCH 分解細菌の多様性2021

    • 著者名/発表者名
      加藤 広海,勝 保奈実 , 永田 裕二
    • 学会等名
      微生物生態学会34回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia 株由来の細胞外多糖類による土壌細菌の選択的培養2021

    • 著者名/発表者名
      笹川 航 , 加藤 広海 , 大塚 重人 , 永田 裕二
    • 学会等名
      微生物生態学会34回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Membrane vesicle production and vesicle-related DNA of sphingomonad strain capable of degrading organochlorine pesticide2021

    • 著者名/発表者名
      Hiromi Kato, Tatsuya Suzuki, Tomoyuki Ishihara, Takamitsu Soma, Masanori Toyofuku, Nobuhiko Nomura, and Yuji Nagata
    • 学会等名
      EMBO Workshop Bacterial membrane vesicles: Biogenesis, functions and medical applications
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 新規qTnSeq法の開発:PCB/ビフェニル分解菌への適用と2つの指標値の導入2021

    • 著者名/発表者名
      逸見裕太郎、永田裕二、大坪嘉行
    • 学会等名
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] qTnSeq法を用いたBurkholderia属細菌における潜在的抗生物質耐性遺伝子の網羅的同定2021

    • 著者名/発表者名
      野々山翔太、逸見裕太郎、永田裕二、大坪嘉行
    • 学会等名
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 平板培地を用いた実験進化により構築したモデル細菌集団内の多様性維持機構2021

    • 著者名/発表者名
      平野彰大、山本達也、仁平賢、野村暢彦、永田裕二、矢野大和
    • 学会等名
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 従属栄養細菌の極貧栄養環境でのCO2依存的な増殖現象2021

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会シンポジウム「細菌の低栄養環境に対する増殖を伴う適応機構」
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 実験進化系で得られた人工殺虫剤分解に関与する進化型ハロアルカンデハロゲナーゼ2021

    • 著者名/発表者名
      陳 楠楠,大坪 嘉行,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤分解能を持つスフィンゴモナッド細菌株のmembrane vesicle形成とvesicleが有するDNA2021

    • 著者名/発表者名
      鈴木 達也,相馬 隆光,加藤 広海,豊福 雅典, 野村 暢彦,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ハロアルカンデハロゲナーゼ及びデアミナーゼからなる融合酵素DahXのtRNA編集活性2021

    • 著者名/発表者名
      高橋 由紀子,佐藤 優花里,中鉢 千尋,野々山 翔太, 永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] γ-Hexachlorocyclohexane(HCH)汚染土壌のメタゲノム解析2021

    • 著者名/発表者名
      加藤 広海,田中 彩美,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ICEKKS1024677の接合伝達を制御する遺伝子発現制御機構2021

    • 著者名/発表者名
      松本 哲,永田 裕二,大坪 嘉行
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 新型コロナウィルスを認識するDNAアプタマーの作製と迅速検出法の構築2021

    • 著者名/発表者名
      大坪 嘉行,永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおける転写制御因子IscRの解析2021

    • 著者名/発表者名
      野々山 翔太,岸田 康平,酒井 啓一郎,永田 裕二, 津田 雅孝,大坪 嘉行
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Taq DNA polymeraseによる新規タイプのCIS反応2021

    • 著者名/発表者名
      川原 昌太郎,永田 裕二,大坪 嘉行
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] キャピラリーシーケンサーと TraceViewer を用いた DNA 解析のススメ2020

    • 著者名/発表者名
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子取得のための人工キャプチャリング株の構築2020

    • 著者名/発表者名
      蘇 立俊、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia 属ヘム獲得系転写活性化因子 HemP の普遍的機能の解析2020

    • 著者名/発表者名
      野々山 翔太、佐藤 拓哉、永田 裕二、大坪 嘉行、津田 雅孝
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] qTnSeq法を利用したPCB/ビフェニル分解菌の分解制限要因の同定と排除2020

    • 著者名/発表者名
      逸見 裕太郎、永田 裕二、津田 雅孝、大坪 嘉行
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 農薬分解細菌を用いた平板培地実験進化系の構築2020

    • 著者名/発表者名
      仁平 賢、山本 達也、平野 彰大、野村 暢彦、永田 裕二、矢野 大和
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 人工遺伝子クラスターを利用した有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子キャプチャリング株の作製2020

    • 著者名/発表者名
      蘇 立俊、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 有機リン系殺虫剤分解細菌Sphingopyxis wildii株由来の2種のハロアルカンデハロゲナーゼの解析2020

    • 著者名/発表者名
      鄧 文昊、Annapoorni Lakshman Sagar、陳 楠楠、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、Dayanannda Siddavattam、永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤分解能を持つスフィンゴモナッド細菌株のmembrane vesicle形成2020

    • 著者名/発表者名
      鈴木 達也、相馬 隆光、加藤 広海、豊福 雅典、野村 暢彦、永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 培養条件検討からadhX遺伝子依存的貧栄養環境生育機構に迫る2020

    • 著者名/発表者名
      酒井 洋範、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Acidovorax sp. KKS102株が有する融合酵素DahXのtRNA編集活性2020

    • 著者名/発表者名
      高橋 由紀子、中鉢 千尋、野々山 翔太、佐藤 優花里、永田 裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Construction of experimental evolution system of haloalkane dehalogenases and characterization of the evolved enzymes2020

    • 著者名/発表者名
      Nannan CHEN, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Survivability of a gamma-hexachlorocyclohexane-degrading sphingomonad strain in soil.2020

    • 著者名/発表者名
      Kafayat YUSUF, Hiromi Kato, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 超音波で断片化したDNAの3'端と効率的修復2020

    • 著者名/発表者名
      大坪 嘉行、酒井 啓一郎、永田 裕二、津田 雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達に関与するtraR遺伝子の機能解析2020

    • 著者名/発表者名
      松本 哲、酒井 啓一郎、永田 裕二、津田 雅孝、大坪 嘉行
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivorans の鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写活性化機構の解析2020

    • 著者名/発表者名
      野々山 翔太、岸田 康平、永田 裕二、大坪 嘉行、津田 雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] PCB分解菌Acidovorax sp. KKS102株が示す多段階増殖とレスポンスレギュレーターBphQの翻訳後修飾2020

    • 著者名/発表者名
      酒井 啓一郎、永田 裕二、津田 雅孝、大坪 嘉行
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium japonicum UT26株の有機塩素系殺虫剤分解に関わるABCトランスポーターの解析2019

    • 著者名/発表者名
      尾形拓哉、佐藤優花里、永田裕二
    • 学会等名
      日本生化学会東北支部会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 人工の代謝酵素遺伝子クラスターを利用した高機能有機塩素殺虫剤資化細菌の育種2019

    • 著者名/発表者名
      蘇 立俊 , 加藤 広海 , 大坪 嘉行 , 津田 雅孝 , 永田 裕二
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第33回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 微生物はなぜ群れを作るのか?:平板培地実験進化系を用いたBHQの検証2019

    • 著者名/発表者名
      仁平 賢, 山本 達也, 平野 彰大, 野村 暢彦, 永田 裕二 , 矢野 大和
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第33回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 環境細菌におけるadhX遺伝子が関与する貧栄養環境適応機構の普遍性2019

    • 著者名/発表者名
      酒井 洋範 , 加藤 広海 , 大坪 嘉行 , 津田 雅孝 , 永田 裕二
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第33回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌叢の液体培養系における遷移の動態解析2019

    • 著者名/発表者名
      東 豊浩 , 加藤 広海 , 長田 穣 , 永田 裕二 , 近藤倫生
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第33回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌叢の初期形成過程における移動性細菌の役割2019

    • 著者名/発表者名
      加藤 広海 , 津田 雅孝 , 永田 裕二
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第33回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 生態学は生物群集デザインに活用できるか?2019

    • 著者名/発表者名
      近藤 倫生、東 豊浩、加藤 広海、川津 一隆、長田 穣、永田 裕二
    • 学会等名
      日本生物工学会第71回大会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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