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細菌における多様なリグニン由来芳香族化合物の外膜・内膜輸送システムの全容解明

研究課題

研究課題/領域番号 19H02867
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分38020:応用微生物学関連
研究機関長岡技術科学大学

研究代表者

政井 英司  長岡技術科学大学, 工学研究科, 教授 (20272867)

研究分担者 菱山 正二郎  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (00353821)
桑原 敬司  長岡技術科学大学, 工学研究科, 准教授 (50525574)
城所 俊一  長岡技術科学大学, 工学研究科, 教授 (80195320)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2022年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2021年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2020年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2019年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
キーワードリグニン / 芳香族化合物 / 外膜輸送 / 内膜輸送 / Sphingobium属細菌 / Sphingobium
研究開始時の研究の概要

細菌を用いたリグニン由来芳香族化合物からの高効率な物質生産系を構築するには、代謝系の改良に加えて、基質の取り込み能の強化が有効と考えられる。本研究では、多様なTonB-dependent receptorが関与すると推定される芳香族化合物の外膜輸送システムを明らかにするとともに、内膜輸送体遺伝子を同定し、リグニン由来芳香族化合物の取り込みシステムの全容解明を目指す。さらに、外膜・内膜輸送体遺伝子の高発現が、物質生産の効率向上に寄与するかを検証する。

研究成果の概要

リグニン由来芳香族化合物分解菌Sphingobium sp. SYK-6株において、ビフェニル型 (5-5型)二量体化合物の外膜輸送がTonB-dependent transporter (TBDT)であるDdvTに担われることを明らかにしていた。本研究では新たにフェニルクマラン型 (β-5型)二量体化合物の外膜輸送を担うTBDTであるPhcTを同定した。また他のリグニン由来芳香族化合物の外膜輸送にもTBDTが関与することが示唆された。さらにSYK-6株およびPseudomonas putida KT2440株においてリグニン由来単量体化合物の内膜輸送に働くトランスポーターを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

植物の主要な細胞壁成分であるリグニンは複雑な結合を持つ芳香族高分子であり、その莫大な存在量から有効利用が望まれている。現在、リグニンの化学分解で得られる低分子芳香族化合物を細菌の代謝能を利用してポリマー原料に変換する技術の開発が進められている。今後は変換効率の向上が求められ、代謝系の改良に加えて、代謝の入り口であり物質変換の律速段階となり得る基質取り込み能の強化が必要である。リグニン由来芳香族化合物の外膜・内膜輸送システムの全容解明を目的として得られた本研究の成果は、芳香族化合物の取り込みに関する新知見と、リグニン由来芳香族化合物からの高効率な物質生産系の構築に有用な情報を提供する。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 4件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (8件) 備考 (3件)

  • [国際共同研究] National Renewable Energy Laboratory(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] National Renewable Energy Laboratory(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] National Renewable Energy Laboratory/Oak Ridge National Laboratory(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Functional roles of multiple Ton complex genes in a Sphingobium degrader of lignin-derived aromatic compounds2021

    • 著者名/発表者名
      Masaya Fujita, Shodai Yano, Koki Shibata, Mizuki Kondo, Shojiro Hishiyama, Naofumi Kamimura, Eiji Masai
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 22444-22444

    • DOI

      10.1038/s41598-021-01756-8

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of aromatic acid/proton symporters in Pseudomonas putida KT2440 toward efficient microbial conversion of lignin-related aromatics2021

    • 著者名/発表者名
      Wada Ayumu, Prates Erica T., Hirano Ryo, Werner Allison Z., Kamimura Naofumi, Jacobson Daniel A., Beckham Gregg T, Masai Eiji
    • 雑誌名

      Metabolic Engineering

      巻: 64 ページ: 167-179

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2021.01.013

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Iron acquisition system of Sphingobium sp. strain SYK-6, a degrader of lignin-derived aromatic compounds2020

    • 著者名/発表者名
      Fujita Masaya, Sakumoto Taichi, Tanatani Kenta, Yu HongYang, Mori Kosuke, Kamimura Naofumi, Masai Eiji
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 12177-12177

    • DOI

      10.1038/s41598-020-68984-2

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Iron acquisition system of Sphingobium sp. strain SYK-6, a degrader of lignin-derived aromatic compounds2020

    • 著者名/発表者名
      Masaya Fujita、Taichi Sakumoto、Kenta Tanatani、Hong Yang Yu 、Kosuke Mori、Naofumi Kamimura、Eiji Masai
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2020.03.26.005173

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A TonB-dependent receptor constitutes the outer membrane transport system for a lignin-derived aromatic compound2019

    • 著者名/発表者名
      Masaya Fujita、Kosuke Mori、Hirofumi Hara、Shojiro Hishiyama、Naofumi Kamimura、Eiji Masai
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 2 号: 1

    • DOI

      10.1038/s42003-019-0676-z

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Sphingomonad科細菌の細胞外膜における植物由来芳香族化合物取り込みメカニズムの解明2023

    • 著者名/発表者名
      藤田 雅也, 柴田 昴輝, 菱山 正二郎, 田辺 幹雄, 千田 俊哉, 上村 直史, 政井 英司
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium sp. SYK-6株の外膜におけるフェニルクマラン型化合物取り込みシステムの解明2022

    • 著者名/発表者名
      藤田 雅也, 柴田 昴輝, 田辺 幹雄, 千田 俊哉, 上村 直史, 政井 英司
    • 学会等名
      第67回リグニン討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium属細菌におけるリグニン由来芳香族化合物の内膜輸送システムの解明2021

    • 著者名/発表者名
      平野 瞭、上村直史、政井英司
    • 学会等名
      第66回リグニン討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium sp. SYK-6株に見いだされた立体選択的なリグニン由来芳香族化合物の外膜輸送システム2020

    • 著者名/発表者名
      柴田昂輝, 藤田雅也, 上村直史, 菱山正二郎, 政井英司
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] The inner mambrane transporter system for lignin-derived aromatic compounds in Pseudomonas putida2019

    • 著者名/発表者名
      Ayumu Wada, Kosuke Mori, Naofumi Kamimura, Eiji Masai
    • 学会等名
      1st International Lignin Symposium
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Iron acquisition pathways essential for the catabolism of lignin-derived aromatics in Sphingobium sp. SYK-62019

    • 著者名/発表者名
      Masaya Fujita, Taichi Sakumoto, Kenta Tanatani, Naofumi Kamimura, Eiji Masai
    • 学会等名
      1st International Lignin Symposium
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium属におけるリグニン由来芳香族化合物の外膜輸送システム2019

    • 著者名/発表者名
      柴田昂輝, 藤田雅也, 上村直史, 菱山正二郎, 政井英司
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Pseudomonas putida のリグニン由来芳香族化合物トランスポーターの解明2019

    • 著者名/発表者名
      和田歩, 上村直史, 政井英司
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 長岡技術科学大学・微生物代謝工学研究室

    • URL

      http://bio.nagaokaut.ac.jp/~masai-l/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 長岡技術科学大学 微生物代謝工学研究室

    • URL

      http://bio.nagaokaut.ac.jp/~masai-l/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] http://bio.nagaokaut.ac.jp/~masai-l/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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