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ゲノムの再編成による多様な人工ゲノムを持つ酵母細胞の創成と育種への応用

研究課題

研究課題/領域番号 19H02878
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分38020:応用微生物学関連
研究機関崇城大学

研究代表者

原島 俊  崇城大学, 生物生命学部, 教授 (70116086)

研究分担者 笹野 佑  崇城大学, 生物生命学部, 教授 (90640194)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
17,030千円 (直接経費: 13,100千円、間接経費: 3,930千円)
2021年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2020年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2019年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
キーワード酵母 / ゲノムの再編成技術 / 人工ゲノム / ゲノム工学 / 染色体工学 / ゲノム編集 / 出芽酵母 / ゲノムの再編成 / 染色体複数部位の同時操作 / 複数ガイドRNAの同時発現 / 同時操作 / PCR / ゲノム干渉 / ゲノムの多様性 / 染色体複数部位の同時分断 / 染色体複数領域の同時部分重複 / 染色体複数領域の同時欠失 / ゲノムの多様性創出 / 人口ゲノム / 育種
研究開始時の研究の概要

目的の有用物質の生産に最適なゲノム(”ベストゲノム”と呼ぶ)を自在に創製する技術の開発は育種工学者の夢である。しかしベストゲノムを設計できる知見が十分でない現在、可能な戦略のひとつは、既存のゲノムを持つ生物から出発して天文学的な種類のゲノム組成を持つ細胞集団を誘導し、それから目的生産物の生産に最適なベストゲノムを持つ細胞をスクリーニングすることであろう。もしこうした戦略を取るのであれば、ゲノムの多様性を創出できる技術開発が不可欠である。本研究では、酵母を材料として、この目的を実現する「ゲノムの再編成技術」を開発し、これまで分離されたことのない種々の変異株を分離できる新規育種技術を確立する。

研究成果の概要

物質生産に最適なゲノムを持つ酵母細胞を育種する技術として、「ゲノムの再編成技術」と命名した技術を提案した。「ゲノムの再編成技術」とは、天然の染色体を分断することで多数の脱落可能な染色体を創製し、そのランダムな組み合わせの脱落による再編成を利用して(例えば20個で約100万通り:Σ20Cr=1-20)、目的物質の生産条件で最も増殖の良い細胞や目的物質の生産性が最も高い細胞を選抜する技術である。1回の形質転換で、同時に複数部位の分断を達成するため、相同組み換え頻度の上昇やPCRで多数のガイドRNAを発現するDNA断片を1日で調製できる技術などを確立し、効率の良いゲノムの再編成技術を開発した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

どのような生物を対象としても、今後のゲノム操作、特に「合成生物工学」では、1回の形質転換操作で、多数の遺伝子を同時に、しかも効率よく操作・改変できる技術が重要になってくるであろう。本研究で開発を試みた「ゲノムの再編成技術」は、酵母を対象としたものではあるが、そのプロトタイプであると考えている。また「ゲノムの再編成技術」の中心的な要素技術である染色体の分断技術の効率化は、染色体任意領域の欠失や重複、置換の効率化をも同時に可能とする。さらに、生産効率が非常に高い細胞が持つゲノムの解析によって、将来ベストゲノムを合理的に設計できる理論を確立するための有用な知見が得られることも期待できる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (7件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] PCR-mediated One-day Synthesis of Guide RNA for the CRISPR/Cas9 System.2022

    • 著者名/発表者名
      Hassan N, Easmin F, Ekino K, Harashima S.
    • 雑誌名

      Bio Protocol

      巻: 11 号: 13

    • DOI

      10.21769/bioprotoc.4082

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 酵母における染色体任意領域の欠失・置換ゲノム工学技術:CRISPR-PCDおよびCRISPR-PCRepの開発2021

    • 著者名/発表者名
      笹野 佑、浴野圭輔、田口久貴、原島 俊
    • 雑誌名

      生物工学会誌

      巻: 100 ページ: 76-76

    • NAID

      130008163652

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] 醸造酵母の非接合性から"超"高次倍数体酵母の育種技術へ2021

    • 著者名/発表者名
      原島 俊
    • 雑誌名

      日本醸造協会誌

      巻: 116 ページ: 727-727

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] 出芽酵母において"超" 高次倍数体の育種はどこまで可能か2021

    • 著者名/発表者名
      廣田冴香、浴野圭輔、原島 俊
    • 雑誌名

      アグリバイオ

      巻: 4 ページ: 49-52

    • NAID

      40022574197

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] CRISPR-PCDup: a novel approach for simultaneous segmental chromosomal duplication in Saccharomyces cerevisiae2020

    • 著者名/発表者名
      Hassan Naim、Sasano Yu、Kimura Shunta、Easmin Farhana、Ekino Keisuke、Taguchi Hisataka、Harashima Satoshi
    • 雑誌名

      AMB Express

      巻: 10 号: 1 ページ: 27-27

    • DOI

      10.1186/s13568-020-0957-4

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Systematic approach for assessing whether undeletable chromosomal regions in Saccharomyces cerevisiae are required for cell viability.2020

    • 著者名/発表者名
      Hassan N, Easmin F, Sasano Y, Ekino K, Taguchi H, Harashima S.
    • 雑誌名

      AMB Express

      巻: 10 号: 1 ページ: 73-73

    • DOI

      10.1186/s13568-020-01001-x

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 出芽酵母における染色体工学の最先端と応用2020

    • 著者名/発表者名
      笹野 佑、原島 俊
    • 雑誌名

      アグリバイオ

      巻: 10 ページ: 41-44

    • NAID

      40022636814

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] 出芽酵母における染色体工学の最先端と応用2020

    • 著者名/発表者名
      笹野 佑、原島 俊
    • 雑誌名

      細胞

      巻: 7 ページ: 53-57

    • NAID

      40022636814

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] CRISPR-PCD and CRISPR-PCRep: Two novel technologies for simultaneous multiple segmental chromosomal deletion/replacement in Saccharomyces cerevisiae2020

    • 著者名/発表者名
      Easmin Farhana、Sasano Yu、Kimura Shunta、Hassan Naim、Ekino Keisuke、Taguchi Hisataka、Harashima Satoshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 129 号: 2 ページ: 129-139

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2019.08.004

    • NAID

      40022159677

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] CRISPR-PCDup: a novel approach for simultaneous segmental chromosomal duplication in Saccharomyces cerevisiae.2020

    • 著者名/発表者名
      Hassan N, Sasano Y, Kimura S, Easmin F, Ekino K, Taguchi H, Harashima S.
    • 雑誌名

      AMB Express.

      巻: 10

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] gRNA-transient expression system for simplified gRNA delivery in CRISPR/Cas9 genome editing.2019

    • 著者名/発表者名
      Easmin F, Hassan N, Sasano Y, Ekino K, Taguchi H, Harashima S.
    • 雑誌名

      J Biosci Bioeng

      巻: 印刷中 号: 3 ページ: 373-378

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2019.02.009

    • NAID

      40022010876

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] キシロース発酵性酵母 Spathaspora passalidarum における遺伝子破壊法の確立2021

    • 著者名/発表者名
      豊留 あいり、 山城 裕孝、 笹野 佑、 田口久貴
    • 学会等名
      日本生物工学会第73回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 酵母の染色体異数性が清酒醸造に与える影響と酵母育種への応用2019

    • 著者名/発表者名
      堀田夏紀、小高裕貴、野口英樹、松村憲吾、杉山峰崇、笹野 佑、原島 俊、秦 洋二
    • 学会等名
      日本生物工学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 酵母の染色体異数性が清酒醸造に与える影響2019

    • 著者名/発表者名
      堀田夏紀、小高裕貴、野口英樹、松村憲吾、杉山峰崇、笹野 佑、原島 俊、秦 洋二、石田博樹
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Spathaspora passalidarum 由来キシロース還元酵素を発現するSaccharomyces cerevisiae2019

    • 著者名/発表者名
      立山陽子、藤井菜穂、笹野 佑、田口久貴
    • 学会等名
      第26回日本生物工学会九州支部大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 複数染色体領域の欠失による発酵阻害物質耐性出芽酵母菌株の育種2019

    • 著者名/発表者名
      豊留あいり、高田和真、高木佑希子、笹野 佑、田口久貴
    • 学会等名
      第26回日本生物工学会九州支部大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 出芽酵母における任意領域の選書k受胎外環状DNA化技術の開発2019

    • 著者名/発表者名
      生田宗一郎、久冨 歩、笹野 佑、田口久貴
    • 学会等名
      第71回 日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 嫌気環境での高効率キシロース発酵に向けたSpathaspora 属酵母のキシロース代謝2019

    • 著者名/発表者名
      笹野 佑
    • 学会等名
      公益財団法人発酵研究所 第13回女性研究報告会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [図書] 遺伝学の百科事典2022

    • 著者名/発表者名
      原島 俊 他120名
    • 総ページ数
      690
    • 出版者
      丸善出版
    • ISBN
      9784621306604
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 崇城大学 研究業績データベース

    • URL

      http://rsrch.ofc.sojo-u.ac.jp/sjuhp/KgApp?resId=S000280

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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