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エピジェネティックをキーワードにした、木材腐朽菌の基礎および応用研究の新展開

研究課題

研究課題/領域番号 19H03017
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分40020:木質科学関連
研究機関京都大学

研究代表者

中沢 威人  京都大学, 農学研究科, 助教 (80608141)

研究分担者 坂本 正弘  京都大学, 農学研究科, 准教授 (40303870)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2021年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2020年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2019年度: 10,790千円 (直接経費: 8,300千円、間接経費: 2,490千円)
キーワード木材腐朽菌 / リグニン / セルロース / ヒストン / 糸状菌 / バイオマス / 腐朽菌 / 担子菌 / セルラーゼ / 木材 / きのこ / エピジェネティック / 植物細胞壁 / 転写制御 / キノコ / 木質 / 木材腐朽 / 二次代謝 / 天然物
研究開始時の研究の概要

本研究では、“エピジェネティック”をテーマにして、腐朽菌を用いた基礎・応用研究を展開する。
1. 基礎研究では、代表者は近年、白色腐朽菌ヒラタケで“リグニン分解モード”と“多糖分解モード”が、エピジェネティック変動を伴ってON/OFFが切り替わるダイナミックな制御スイッチを発見した。この分子機構を調査するとともに、多様な腐朽菌において、この機構が腐朽制御の基本原理か多様性かを明らかにする。
2. 応用研究では、ゲノムワイドなエピジェネティック情報に基づいた生合成工学を行う。腐朽菌を用いて木材を処理しつつ、高付加価値な生理活性物質(低分子)を高生産させる。

研究成果の概要

白色腐朽菌ヒラタケにおいて、ヒストンH3のK4もしくはK36のメチル化レベルの改変が木質分解酵素遺伝子群の転写に及ぼす影響を調査した。その結果、これらの修飾レベルの改変によって、セルロース分解酵素遺伝子群の転写の一挙活性化もしくは不活性化が発生することが示唆された。
ヒストンH3K4メチル化レベルを低下させるccl1破壊株におけるrho1b遺伝子の高発現が、いくつかのセルロース分解酵素遺伝子の転写活性化の原因の一つであることが示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

木材腐朽菌の分解酵素遺伝子群は、培養条件によって転写レベルで調節されていることが昔から知られていた。転写調節の分子機構の解明は、人為的な木材分解制御(分解能の改変)に重要である。しかし、分子遺伝学研究がほとんど行われておらず、ほとんど明らかになっていなかった。本研究では、これらの障壁を打ち破り、突破口を見出した。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 1件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Overexpressing <i>Pleurotus ostreatus rho1b</i> results in transcriptional upregulation of the putative cellulolytic enzyme‐encoding genes observed in <i>ccl1</i> disruptants2021

    • 著者名/発表者名
      Okuda Nozomi、Nakazawa Takehito、Horii Masato、Wu Hongli、Kawauchi Moriyuki、Sakamoto Masahiro、Honda Yoichi
    • 雑誌名

      Environmental Microbiology

      巻: 23 号: 11 ページ: 7009-7027

    • DOI

      10.1111/1462-2920.15786

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gene targeting using pre-assembled Cas9 ribonucleoprotein and split-marker recombination in <i>Pleurotus ostreatus</i>2021

    • 著者名/発表者名
      Boontawon Tatpong、Nakazawa Takehito、Xu Haibo、Kawauchi Moriyuki、Sakamoto Masahiro、Honda Yoichi
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters

      巻: 368 号: 13 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1093/femsle/fnab080

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Functional analyses of Pleurotus ostreatus pcc1 and clp1 using CRISPR/Cas92021

    • 著者名/発表者名
      Boontawon Tatpong、Nakazawa Takehito、Horii Masato、Tsuzuki Masami、Kawauchi Moriyuki、Sakamoto Masahiro、Honda Yoichi
    • 雑誌名

      Fungal Genetics and Biology

      巻: 154 ページ: 103599-103599

    • DOI

      10.1016/j.fgb.2021.103599

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient genome editing with CRISPR/Cas9 in Pleurotus ostreatus2021

    • 著者名/発表者名
      Boontawon Tatpong、Nakazawa Takehito、Inoue Chikako、Osakabe Keishi、Kawauchi Moriyuki、Sakamoto Masahiro、Honda Yoichi
    • 雑誌名

      AMB Express

      巻: 11 号: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1186/s13568-021-01193-w

    • NAID

      120006960305

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Targeted disruption of hir1 alters the transcriptional expression pattern of putative lignocellulolytic genes in the white-rot fungus Pleurotus ostreatus2021

    • 著者名/発表者名
      Wu H., Nakazawa T., Morimoto R., Shivani, Sakamoto M., Honda Y.
    • 雑誌名

      Fungal Genet. Biol.

      巻: 147 ページ: 103507-103507

    • DOI

      10.1016/j.fgb.2020.103507

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparative transcriptional analyses of Pleurotus ostreatus mutants on beech wood and rice straw shed light on substrate-biased gene regulation2021

    • 著者名/発表者名
      Wu H., Nakazawa T., Xu H, Yang R., Bao D., Kawauchi M., Sakamoto M., Honda Y.
    • 雑誌名

      Appl. Microbio. Biotechnol.

      巻: 105 号: 3 ページ: 1175-1190

    • DOI

      10.1007/s00253-020-11087-9

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] A promoter assay system using gene targeting in agaricomycetes Pleurotus ostreatus and Coprinopsis cinerea.2020

    • 著者名/発表者名
      Nguyen D.X., Nakazawa T., Myo G., Inoue C., Sakamoto M., Honda Y.
    • 雑誌名

      J. Microbiol. Methods

      巻: 179 ページ: 106053-106053

    • DOI

      10.1016/j.mimet.2020.106053

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcriptional shifts in delignification‐defective mutants of the white‐rot fungus Pleurotus?ostreatus2020

    • 著者名/発表者名
      Wu Hongli、Nakazawa Takehito、Takenaka Atsuki、Kodera Rina、Morimoto Ryota、Sakamoto Masahiro、Honda Yoichi
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 594 号: 19 ページ: 3182-3199

    • DOI

      10.1002/1873-3468.13890

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 菌類遺伝学からのアプローチによるリグニン分解研究2021

    • 著者名/発表者名
      中沢 威人
    • 学会等名
      リグニン学会若手の会・日本木材学会バイオマス変換研究会合同講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 担子菌の研究:オリジナリティとマニアックの狭間で2021

    • 著者名/発表者名
      中沢 威人
    • 学会等名
      糸状菌分子生物学研究会若手の会第9回WS
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Ceriporiopsis subvermisporaとヒラタケの間におけるgat1およびpex1の単独遺伝子変異がリグニン分解能および木質分解系酵素遺伝子群の転写発現に与える影響の比較解析2020

    • 著者名/発表者名
      中沢 威人、井上 智香子、森本 亮太、徐 海博、坂本 正弘、本田与一
    • 学会等名
      第66回リグニン討論会(第3回年次大会)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 木質培地上でヒラタケを培養した場合にみられるリグニン分解酵素遺伝子群の転写におけるCCAAT-boxの役割2020

    • 著者名/発表者名
      中沢 威人、坂 知奈美、山本 太一、 河内 護之、坂本 正弘、本田与一
    • 学会等名
      第71回日本木材学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 担子菌ヒラタケにおけるccl1遺伝子破壊がヒストン修飾および転写発現に及ぼす影響2019

    • 著者名/発表者名
      奥田 希実
    • 学会等名
      第19回糸状菌分子生物学カンファレンス
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Ceriporiopsis subvermisporaとヒラタケの間におけるgat1およびpex1の単独遺伝子変異がリグニン分解能および木質分解系酵素遺伝子群の転写発現に与える影響の比較解析2019

    • 著者名/発表者名
      中沢 威人
    • 学会等名
      第70回日本木材学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Comparative genetic and transcriptome analyses of pex1 and gat1 single-gene mutants between Ceriporiopsis subvermispora and Pleurotus ostreatus2019

    • 著者名/発表者名
      中沢 威人
    • 学会等名
      15th European Conference on Fungal Genetics
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Effects of mutations in hirA encoding a putative chromatin remodeler on lignin degradation and transcriptional expression of wood degrading enzyme genes in Pleurotus ostreatus2019

    • 著者名/発表者名
      呉 紅麗
    • 学会等名
      1st International Lignin Symposium
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Effects of hirA disruption on extracellular cellulase and xylanase activities and histone H3K4 dimethylation in Pleurotus ostreatus2019

    • 著者名/発表者名
      呉 紅麗
    • 学会等名
      19th Asian Mycological Congress
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Effects of multiple disruption of putative ligninolytic enzyme genes on wood lignin degradation in Pleurotus ostreatus2019

    • 著者名/発表者名
      張 雨凡
    • 学会等名
      1st International Lignin Symposium
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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