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豚レンサ球菌細胞壁タンパク質の網羅的機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 19H03126
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分42020:獣医学関連
研究機関京都大学 (2021-2022)
東京大学 (2019-2020)

研究代表者

関崎 勉  京都大学, 医学研究科, 研究員 (70355163)

研究分担者 野澤 孝志  京都大学, 医学研究科, 准教授 (10598858)
遠矢 真理  順天堂大学, 医学部, 助教 (20804694)
中川 一路  京都大学, 医学研究科, 教授 (70294113)
黒木 香澄 (石田香澄)  国立感染症研究所, 薬剤耐性研究センター, 主任研究官 (80760272)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
16,900千円 (直接経費: 13,000千円、間接経費: 3,900千円)
2022年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2020年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2019年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
キーワード豚レンサ球菌 / 細胞壁タンパク質 / 遺伝子破壊株 / 網羅的機能解析 / 病原性 / 細胞壁結合蛋白質
研究開始時の研究の概要

グラム陽性菌の細胞壁タンパク質は病原性に関連すると考えらえるが、20種類以上の全ての病原学的役割や複数のタンパク質の関連も評価できていない。豚レンサ球菌では、細菌表層の莢膜が細胞壁タンパク質の機能解析の妨げになっている。そこで、豚レンサ球菌の無莢膜株で、全ての細胞壁タンパク質遺伝子を個別または複数破壊した変異株を作製し、血小板への接着性、上皮細胞への侵入性・通過性、バイオフィルム形成能、オートファジー誘導性など病原性関連性状が変化した遺伝子の組合せを決定する。また、同じ組合せの遺伝子破壊株を莢膜保有株で作製し、実験動物で評価し、全ての細胞壁タンパク質の病原学的役割を網羅的に解明し尽くす。

研究成果の概要

豚レンサ球菌(Streptococcus suis)の無莢膜株は,血小板などへの接着性が亢進する。本菌の2つの主要なclonal complexであるST1とST28に属する株の無莢膜株を用いて,それぞれの細胞壁タンパク質(CWP)遺伝子の全てについて,一ずつ遺伝子欠損(KO)変異株を作製したが,それらのバイオフィルム形成能,血小板接着性,細胞間マトリックス結合性,細胞接着性,細胞侵入性は,無莢膜の親株と差がなかった。一方,S. suis 21株および近縁菌種のS. parasuis 6株,S. ruminantium 6株,合計3菌種33株のドラフトゲノム配列から51種類のCWPを見出した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

多くのグラム陽性菌の表層には,細胞壁に共有結合するCWPが存在し,それらを細胞表層に提示する酵素sortaseの遺伝子を破壊すると,細胞への接着性が低下することが知られていた。一方,莢膜を欠損した菌は,血小板などへの接着性が亢進することも知られており,莢膜欠損株を用いてCWP遺伝子欠損株を作製すれば,どのCWPが接着性に直接関与するか評価できると考えられた。しかし,実際にはCWPは接着性には重要でないことが判明し,soretase遺伝子破壊による接着性の低下と莢膜を除いてCWPを露出させた場合における接着性の亢進が,全く異なるメカニズムにより起こるという学術的に価値ある新たな知見が得られた。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 4件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] Nong Lam University(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Kasetsart University(タイ)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Nong Lam University(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Kasetsart University(タイ)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] Complete genome sequences of four Streptococcus parasuis strains obtained from saliva of domestic pigs in Japan.2022

    • 著者名/発表者名
      Nomoto R, Ishida-Kuroki K, Nakagawa I, Sekizaki T
    • 雑誌名

      Microbiol Resour Announc

      巻: 11 号: 2 ページ: 01245-21

    • DOI

      10.1128/mra.01245-21

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequences of Three Streptococcus ruminantium Strains Obtained from Endocarditis Lesions of Cattle in Japan2022

    • 著者名/発表者名
      Nomoto Ryohei、Ishida-Kuroki Kasumi、Tohya Mari、Nakagawa Ichiro、Sekizaki Tsutomu
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 11 号: 5 ページ: 01248-21

    • DOI

      10.1128/mra.01248-21

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Transition of microbiota in chicken cecal droppings from commercial broiler farms2021

    • 著者名/発表者名
      Takeshita Nachiko、Watanabe Takayasu、Ishida-Kuroki Kasumi、Sekizaki Tsutomu
    • 雑誌名

      BMC Veterinary Research

      巻: 17 号: 1 ページ: 10-10

    • DOI

      10.1186/s12917-020-02688-7

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequences of Two Streptococcus suis Strains Isolated from Asymptomatic Pigs2020

    • 著者名/発表者名
      Minowa-Nozawa Atsuko、Nozawa Takashi、Takamatsu Daisuke、Yoshida Akemi、Murase Kazunori、Kikuchi Taisei、Ishida-Kuroki Kasumi、Nitta Yoshihiro、Sekizaki Tsutomu、Nakagawa Ichiro
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 9 号: 47

    • DOI

      10.1128/mra.01142-20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 6S rRNA gene amplicon sequence data from feces of five species of wild animals in Japan2020

    • 著者名/発表者名
      Ishida-Kuroki K, Takeshita N, Nitta Y, Chuma T, Maeda K, Shimoda H, Takano A, Sekizaki T
    • 雑誌名

      Microbiol Resour Announc

      巻: 9 号: 22

    • DOI

      10.1128/mra.00368-20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 16S rRNA gene amplicon sequence data from feces of wild deer (Cervus nippon) in Japan2020

    • 著者名/発表者名
      Ishida-Kuroki K, Takeshita N, Nitta Y, Chuma T, Maeda K, Shimoda H, Takano A, Sekizaki T
    • 雑誌名

      Microbiol Resour Announc

      巻: 9 号: 22

    • DOI

      10.1128/mra.00346-20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 16S rRNA Gene Amplicon Sequence Data from Chicken Cecal Feces from Vietnam and Thailand.2019

    • 著者名/発表者名
      1.Takeshita N, Kim H, Witoonsatian K, Tohya M, Võ TH, Boonyong N, Nguyên TPB, Nakagawa I, Meekhanon N, Nguyên NH, Sekizaki T.
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcement

      巻: 8 号: 32

    • DOI

      10.1128/mra.00781-19

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of pig saliva as the major natural habitat of Streptococcus suis by analyzing oral, fecal, vaginal, and environmental microbiota.2019

    • 著者名/発表者名
      Murase K, Watanabe T, Arai S, Kim H, Tohya M, Ishida-Kuroki K, Vo TH, Nguyen TPB, Nakagawa I, Osawa R, Nguyen NH, Sekizaki T
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 14 号: 4 ページ: e0215983-e0215983

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0215983

    • NAID

      120006634676

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Functional dysbiosis within dental plaque microbiota in cleft lip and palate patients2019

    • 著者名/発表者名
      Funahashi Kenta、Shiba Takahiko、Watanabe Takayasu、Muramoto Keiko、Takeuchi Yasuo、Ogawa Takuya、Izumi Yuichi、Sekizaki Tsutomu、Nakagawa Ichiro、Moriyama Keiji
    • 雑誌名

      Progress in Orthodontics

      巻: 20 号: 1 ページ: 11-11

    • DOI

      10.1186/s40510-019-0265-1

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] High rate misidentification of biochemically determined <i>Streptococcus</i> isolates from swine clinical specimens2019

    • 著者名/発表者名
      Meekhanon N, Kaewmongkol S, Jirawattanapong P, Kaminsonsakul T, Kongsoi S, Chumsing S, Okura M, Ueno Y, Sekizaki T, Takamatsu D
    • 雑誌名

      The Journal of Veterinary Medical Science

      巻: 81 号: 4 ページ: 567-572

    • DOI

      10.1292/jvms.18-0678

    • NAID

      130007632968

    • ISSN
      0916-7250, 1347-7439
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Streptococcus suisの細胞壁結合タンパク質に関する調査2020

    • 著者名/発表者名
      Pan Yaqi,黒木香澄,野本竜平,遠矢真理,仁田義弘,関崎 勉
    • 学会等名
      第163回日本獣医学会学術集会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ブタの感染性心内膜炎から分離した Streptococcus suis の性状2020

    • 著者名/発表者名
      関崎 勉
    • 学会等名
      第93回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 新たな汚染指標細菌候補であるStreptococcus suisの豚肉フードチェーン内汚染状況調査2020

    • 著者名/発表者名
      黒木香澄,仁田義弘,門屋亨介,関崎 勉
    • 学会等名
      第93回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Genome comparison of the capsule-negative Streptococcus suis isolates from endocarditis.2019

    • 著者名/発表者名
      Dozaki S, Suzuki E, Tohya M, Watanabe T, Kuroki K, Sekizaki T
    • 学会等名
      The 4th International Workshop on Streptococcus suis, Montr&eacute;al, Canada
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 豚心内膜炎病変部由来Streptococcus suisの比較ゲノム解析による無莢膜菌出現理由の推測2019

    • 著者名/発表者名
      堂崎真一,遠矢真理,渡辺孝康,鈴木詠律子,黒木香澄,関崎 勉
    • 学会等名
      第162回日本獣医学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 豚肉フードチェーン内の網羅的な細菌汚染状況調査とStreptococcus suisの汚染指標細菌としての有用性の検証2019

    • 著者名/発表者名
      黒木香澄,仁田義弘,門屋亨介,関崎 勉
    • 学会等名
      第162回日本獣医学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 比較ゲノム解析から推測する豚心内膜炎病変部由来Streptococcus suisでの無莢膜菌の出現理由2019

    • 著者名/発表者名
      堂崎真一,遠矢真理,渡辺孝康,鈴木詠律子,黒木香澄,関崎 勉
    • 学会等名
      第51回Lancefieldレンサ球菌研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 豚肉フードチェーン内の細菌叢解析による新たな汚染指標細菌Streptococcus suisの有用性の検証2019

    • 著者名/発表者名
      黒木香澄,仁田義弘,門屋亮介,関崎 勉
    • 学会等名
      第51回Lancefieldレンサ球菌研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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