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核内微小環境の形成を介した転写動態制御の統合的解明

研究課題

研究課題/領域番号 19H03154
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43010:分子生物学関連
研究機関東京大学

研究代表者

深谷 雄志  東京大学, 定量生命科学研究所, 准教授 (00786163)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円)
2021年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2020年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2019年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
キーワードショウジョウバエ / エンハンサー / 転写バースト / 転写因子 / ライブイメージング / ショウジョウバエ初期胚 / 天然変性領域 / 転写 / インシュレーター
研究開始時の研究の概要

転写制御に働く調節DNA領域はエンハンサーと呼ばれ、転写因子やコアクチベーターとの結合を介して発生過程に応じた遺伝子発現の緻密な時空間制御を可能にしている。申請者のこれまでの研究により、エンハンサーは標的遺伝子と一対一の安定的なループ構造を形成するのではなく、むしろ転写を活性化する微小環境を核内に生み出すことで動的に転写制御に働くという新規作用機序の存在が強く示唆された。本研究では、DNAを足場として転写活性化因子が局所的に濃縮された「動的な核内微小環境」の形成こそがエンハンサー作用機序の本質であるという新たな可能性について多面的に検証を行い、その解明に取り組む。

研究成果の概要

転写因子の核内動態と、遺伝子発現を同時に可視化する超解像ライブイメージング技術を新たに構築することに成功した。詳細な解析の結果、エンハンサーが転写因子の局所濃度の動的変化を介して、遺伝子発現の時空間動態を緻密に制御していることを解明した。さらに、ゲノム上に離れて存在する2つの異なる遺伝子が、転写因子が局所的に濃縮された場を共有することで、同時制御されるという新たな遺伝子発現制御機構を発見した。ショウジョウバエ個体を用いたゲノム編集解析により、転写因子の局所濃度の制御に異常が生じることによって、遺伝子発現の時空間的なパターンが乱れ、結果として形態形成に著しい破綻が生じることも実験的に示された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究は、生物の持つゲノム情報がどのように正確に読み出されているのか、というセントラルドグマにおける基本原理の謎の解明につながる画期的成果である。また、転写因子の異常凝集は癌をはじめとするさまざまな疾患との関連が報告されていることから、本研究によって得られた知見はは多様な疾患メカニズムの解明や新規治療法の開発へ向けた基盤的知見となるものと期待される。

報告書

(4件)
  • 2022 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 3件、 招待講演 10件)

  • [雑誌論文] Mod(mdg4) variants repress telomeric retrotransposon HeT-A by blocking subtelomeric enhancers2022

    • 著者名/発表者名
      Chikara Takeuchi, Moe Yokoshi, Shu Kondo, Aoi Shibuya, Kuniaki Saito, Takashi Fukaya, Haruhiko Siomi, Yuka W Iwasaki
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 50 号: 20 ページ: 11580-11599

    • DOI

      10.1093/nar/gkac1034

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamic modulation of enhancer responsiveness by core promoter elements in living <i>Drosophila</i> embryos2021

    • 著者名/発表者名
      Yokoshi Moe、Kawasaki Koji、Camb?n Manuel、Fukaya Takashi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 50 号: 1 ページ: 92-107

    • DOI

      10.1093/nar/gkab1177

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamic regulation of anterior-posterior patterning genes in living Drosophila embryos2021

    • 著者名/発表者名
      Fukaya Takashi
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 未定 号: 10 ページ: 2227-2236.e6

    • DOI

      10.1016/j.cub.2021.02.050

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Visualizing the Role of Boundary Elements in Enhancer-Promoter Communication2020

    • 著者名/発表者名
      Moe Yokoshi, Kazuma Segawa, Takashi Fukaya
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: VOLUME 78, ISSUE 2 号: 2 ページ: 224-235

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2020.02.007

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Transcription dynamics in living Drosophila embryos2021

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      JSDB/APDBN Symposium RNA, Stem Cells, Technology in Development
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Transcription dynamics in living Drosophila embryos2021

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      The 1st ASHBi SignAC workshop
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Regulation of transcriptional bursting in living Drosophila embryos2020

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Regulation of transcriptional bursting in living Drosophila embryos2020

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Regulation of transcriptional bursting by core promoter elements2020

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      EMBL Conference Transcription and Chromatin
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] topological regulation of enhancer-promoter communication2019

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] topological regulation of transcriptional bursting2019

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      NIBB-Princeton Joint Symposium
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] topological regulation of transcriptional bursting2019

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      日本遺伝学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] topological regulation of transcriptional bursting2019

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      第4回定量生命科学研究所シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] topological regulation of transcriptional bursting2019

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fukaya
    • 学会等名
      日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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