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メンブレンレスオルガネラの細胞内構造ダイナミクス解析技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19H03168
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関広島大学

研究代表者

楯 真一  広島大学, 統合生命科学研究科(理), 教授 (20216998)

研究分担者 安田 恭大  広島大学, 統合生命科学研究科(理), 助教 (40816344)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円)
2022年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2021年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2020年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2019年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
キーワード液液相分離 / プロテオミクス / ストレス顆粒 / 天然変性タンパク質 / 近接標識法 / NMR / B型肝炎ウイルス / 細胞内プロテオミクス解析 / メンブレンレスオルガネラ / 共焦点顕微鏡 / 質量分析 / 細胞内プロテオミクス
研究開始時の研究の概要

細胞は外部からの刺激に応じて,細胞内部で可逆的な顆粒構造を形成する.このような細胞内顆粒構造は,顆粒を構成するタンパク質が持つ天然変性領域を介した「液液相分離」により形成される.本研究では,細胞内光架橋反応と質量分析技術を駆使して,細胞内顆粒構造を構成するタンパク質組成と顆粒内における構成タンパク質間相互作用様式の時空間変化を解明する.この研究を通して,細胞内環境に応じてダイナミックに生成・消滅する細胞内顆粒の形成機構を解明する.

研究成果の概要

空間近接標識法を用いて,タンパク質が液液相分離により細胞内で形成する液滴構造(ドロップレット)形成過程で,構成するタンパク質間の相互作用が時間と共にどのように変化するかを明らかにした.ストレス顆粒構成タンパク質であるTIA1とG3BP1に対して,ストレス刺激後にそれぞれのタンパク質に対して物理的に相互作用するタンパク質群の変化を経時的に追跡することに成功した.時間と共に,明らかなドロップレット内タンパク質間相互作用に変化が観測された.膜を持たない細胞内小器官としてのドロップ内部での機能制御に連動したタンパク質間相互作用変化を初めて観測することに成功した.

研究成果の学術的意義や社会的意義

タンパク質が液液相分離により細胞内に形成する液滴構造は,膜を持たない細胞内小器官として細胞内反応制御に係わる.しかし,200以上のタンパク質・核酸から構成される複雑な液滴構造内部で,どのように機能制御が実現されるかは明らかになっていない.本研究は,液滴構造内部におけるタンパク質間相互作用ネットワークが時間と共に変化する様子を,近接標識法を基にした時分割プロテイミクス法により明らかにした.時間とともに変化するタンパク質間相互作用ネットワークの観測に成功した.時間と共に液滴内部で動的に制御されるタンパク質間相互作用の変化が,ドロップレット内部の機能制御を実現するという新たな機構を明らかにした.

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (27件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (7件) 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 2件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 4件、 招待講演 7件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] Seoul National University/UNIST Central Research Facilities(韓国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Padova(イタリア)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Seoul National University/UNIST Central Research Facilities(韓国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Padova(イタリア)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] NIH(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] ソウル大学(韓国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] リヨン大学(フランス)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Valosin‐containing protein (VCP) regulates the stability of fused in sarcoma (FUS) granules in cells by changing ATP concentrations2022

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Kyota、Watanabe Tomonobu M.、Kang Myeong‐Gyun、Seo Jeong Kon、Rhee Hyun‐Woo、Tate Shin‐ichi
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: - 号: 11 ページ: 1412-1423

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14353

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification of embryonic RNA granules that act as sites of mRNA translation after changing their physical properties2022

    • 著者名/発表者名
      Sato Keisuke、Sakai Moeko、Ishii Anna、Maehata Kaori、Takada Yuki、Yasuda Kyota、Kotani Tomoya
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 25 号: 6 ページ: 104344-104344

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104344

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] FUS液液相分離の機能と細胞内相分離制御機構2022

    • 著者名/発表者名
      安田恭大,楯 真一
    • 雑誌名

      細胞

      巻: 54 ページ: 448-451

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Path ensembles for Pin1-catalyzed cis-trans isomerization of a substrate calculated by weighted ensemble simulations2021

    • 著者名/発表者名
      Kei Moritsugu, Norifumi Yamamoto, Yasushige Yonezawa, Shin-ichi Tate, and Hiroshi Fujisaki
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Theory and Computation

      巻: 17 号: 4 ページ: 2522-2529

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.0c01280

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hepta-Histidine Inhibits Tau Aggregation2021

    • 著者名/発表者名
      Kondo Kanoh、Ikura Teikichi、Tanaka Hikari、Fujita Kyota、Takayama Sumire、Yoshioka Yuki、Tagawa Kazuhiko、Homma Hidenori、Liu Su、Kawasaki Ryosuke、Huang Yong、Ito Nobutoshi、Tate Shin-ichi、Okazawa Hitoshi
    • 雑誌名

      ACS Chemical Neuroscience

      巻: 12 号: 16 ページ: 3015-3027

    • DOI

      10.1021/acschemneuro.1c00164

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] タンパク質天然変性領域が実現するヌクレオソーム結合能の「超高感度応答性」機構2021

    • 著者名/発表者名
      TATE Shin-ichi
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 61 号: 5 ページ: 312-315

    • DOI

      10.2142/biophys.61.312

    • NAID

      130008093155

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] タンパク質天然変性領域が実現するヌクレオソーム結合能の「超高感度応答性」機構2021

    • 著者名/発表者名
      楯 真一
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 61

    • NAID

      130008093155

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Impact of the Hereditary P301L Mutation on the Correlated Conformational Dynamics of Human Tau Protein Revealed by the Paramagnetic Relaxation Enhancement NMR Experiments2020

    • 著者名/発表者名
      Kawasaki Ryosuke、Tate Shin-ichi
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 21 号: 11 ページ: 3920-3920

    • DOI

      10.3390/ijms21113920

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Ultrasensitive Change in Nucleosome Binding by Multiple Phosphorylations to the Intrinsically Disordered Region of the Histone Chaperone FACT2020

    • 著者名/発表者名
      D. Aoki, A. Awazu, M. Fujii, J. Uewaki, M. Hashimoto, N. Tochio, T. Umehara, S. Tate
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 432 号: 16 ページ: 4637-4657

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2020.06.011

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Linking substrate and nucleus via actin cytoskeleton in pluripotency maintenance of mouse embryonic stem cells2019

    • 著者名/発表者名
      David Brit Gracy、Fujita Hideaki、Yasuda Kyota、Okamoto Kazuko、Panina Yulia、Ichinose Junya、Sato Osamu、Horie Masanobu、Ichimura Taro、Okada Yasushi、Watanabe Tomonobu M
    • 雑誌名

      Stem Cell Research

      巻: 41 ページ: 101614-101614

    • DOI

      10.1016/j.scr.2019.101614

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Translational regulation of protrusion-localized RNAs involves silencing and clustering after transport2019

    • 著者名/発表者名
      Moissoglu Konstadinos、Yasuda Kyota、Wang Tianhong、Chrisafis George、Mili Stavroula
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 8 ページ: 1-31

    • DOI

      10.7554/elife.44752

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Structure dynamics of intrinsically disordered proteind (IDPs) and their biological roles2022

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Tate
    • 学会等名
      The 7th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] NMRによる天然変性タンパク質の構造ダイナミクスと機能との相関解析2022

    • 著者名/発表者名
      楯 真一
    • 学会等名
      広島大学統合生命科学研究科シンポジウム「分子原子レベルの統合生命科学研究」(招待講演)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chirality Disruption in Protein Dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Tate
    • 学会等名
      Molecular Chirality 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Recent structural researches on proteins as drug targets2020

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Tate
    • 学会等名
      第79回 日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural properties of oxidized LDL receptor LOX-1 as a therapeutic target for atherosclerosis and cancers; significance of LOX-1 structure and dynamics in terms of drug design and drug delivery2019

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Tate
    • 学会等名
      Pharma Chemistry 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Multiple-phosphorylation in the intrinsically disordered region (IDR) of chromatin remodeler FACT tunes its remodeling activity through conformational dynamics2019

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Tate
    • 学会等名
      The 8th Asia-Pacific NMR symposium
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Effects of the detrimental familial mutation on the structure and dynamics of Tau and their relation to the fibril formation2019

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Tate
    • 学会等名
      The 10th Asia-Pacific IDP symposium
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考]

    • URL

      https://www.mls.sci.hiroshima-u.ac.jp/biophys/index.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] Molecular Biophysics Laboratory

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2025-11-20  

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