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複合体間の動的な相互作用による翻訳制御の構造基盤

研究課題

研究課題/領域番号 19H03172
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

伊藤 拓宏  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (70401164)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2021年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2020年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2019年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワード翻訳 / 翻訳開始因子 / 統合的ストレス応答 / 電子顕微鏡 / 生体分子 / リボソーム
研究開始時の研究の概要

本研究では、複雑で動的なヒトの翻訳制御機構のうち、【1】翻訳開始因子eIF2のリン酸化とeIF2のGEFであるeIF2Bによって制御される統合的ストレス応答機構、【2】早期終止リボソームとSMG1複合体、Upf複合体、Exon-junction complex(EJC)によって形成される超複合体によるナンセンス変異依存mRNA分解機構(NMD)の発動機構、の2つの機構を標的とする。通常の組み換えタンパク質を用いた複合体の再構成に加えて、再構成試験管内翻訳系を駆使してクライオ電子顕微鏡による立体構造解析を進め、生化学的・生物物理的な解析と併せてこれらの機構を明らかにすることを目指す。

研究成果の概要

eIF2-eIF2B GEF活性型複合体とリン酸化eIF2(eIF2-P)-eIF2B GEF不活性型複合体の2つの立体構造を決定し、eIF2BによるeIF2の活性化機構とeIF2-PによるeIF2Bの不活性化機構を明らかにした。さらには、ISRを抑える小分子ISRIBの活性発現機構を明らかにした。また、eIF2Bに結合して機能するシチリア型サシチョウバエ熱ウイルス NSsタンパク質のISR抑制機構を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究によりISR制御の核となるeIF2/eIF2-PとeIF2Bによるヌクレオチド交換活性制御の構造的機構が明らかとなった。さらには、これらを参照することによりISRIBやSFSV NSsによるeIF2Bの制御機構を立体構造の視点から明らかにした。今後、eIF2-PとeIF2Bの結合を制御することは神経変性疾患の新規治療法の開発につながると期待できる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 4件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 2件、 招待講演 4件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] Justus-Liebig University(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Cambridge(英国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Boston Univeristy(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Cambridge(英国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] eIF2B-capturing viral protein NSs suppresses the integrated stress response2021

    • 著者名/発表者名
      Kashiwagi Kazuhiro、Shichino Yuichi、Osaki Tatsuya、Sakamoto Ayako、Nishimoto Madoka、Takahashi Mari、Mito Mari、Weber Friedemann、Ikeuchi Yoshiho、Iwasaki Shintaro、Ito Takuhiro
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 7102-7102

    • DOI

      10.1038/s41467-021-27337-x

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] ISRIB Blunts the Integrated Stress Response by Allosterically Antagonising the Inhibitory Effect of Phosphorylated eIF2 on eIF2B2021

    • 著者名/発表者名
      Zyryanova Alisa F.、Kashiwagi Kazuhiro、Rato Claudia、Harding Heather P.、Crespillo-Casado Ana、Perera Luke A.、Sakamoto Ayako、Nishimoto Madoka、Yonemochi Mayumi、Shirouzu Mikako、Ito Takuhiro、Ron David
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 81 号: 1 ページ: 88-103

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2020.10.031

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dual targeting of DDX3 and eIF4A by the translation inhibitor rocaglamide A2021

    • 著者名/発表者名
      Chen Mingming、Asanuma Miwako、Takahashi Mari、Shichino Yuichi、Mito Mari、Fujiwara Koichi、Saito Hironori、Floor Stephen N.、Ingolia Nicholas T.、Sodeoka Mikiko、Dodo Kosuke、Ito Takuhiro、Iwasaki Shintaro
    • 雑誌名

      Cell Chemical Biology

      巻: 28 号: 4 ページ: 475-486

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2020.11.008

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] eIF2B and the Integrated Stress Response: A Structural and Mechanistic View2020

    • 著者名/発表者名
      Marintchev Assen、Ito Takuhiro
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 59 号: 13 ページ: 1299-1308

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.0c00132

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] HCV IRES captures an actively translating 80S ribosome2019

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama Takeshi、Machida Kodai、Iwasaki Wakana、Shigeta Tomoaki、Nishimoto Madoka、Takahashi Mari、Sakamoto Ayako、Yonemochi Mayumi、Harada Yoshie、Shigematsu Hideki、Shirouzu Mikako、Tadakuma Hisashi、Imataka Hiroaki、Ito Takuhiro
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 印刷中 号: 6 ページ: 1205-1214

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2019.04.022

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis for eIF2B inhibition in integrated stress response2019

    • 著者名/発表者名
      Kashiwagi Kazuhiro、Yokoyama Takeshi、Nishimoto Madoka、Takahashi Mari、Sakamoto Ayako、Yonemochi Mayumi、Shirouzu Mikako、Ito Takuhiro
    • 雑誌名

      Science

      巻: 364 号: 6439 ページ: 495-499

    • DOI

      10.1126/science.aaw4104

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] eIF2B結合性ウイルスタンパク質NSsによる統合的ストレス応答抑制2021

    • 著者名/発表者名
      伊藤拓宏
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] eIF2Bに結合するウイルスタンパク質NSsは統合的ストレス応答を抑制する2021

    • 著者名/発表者名
      伊藤拓宏
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 統合的ストレス応答阻害剤ISRIBの作用機序2020

    • 著者名/発表者名
      伊藤拓宏
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ストレス応答による翻訳開始停止機構の構造基盤~X線結晶構造解析とクライオ電子顕微鏡2020

    • 著者名/発表者名
      伊藤拓宏
    • 学会等名
      第64回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] eIF2 のリン酸化による eIF2B 活性の阻害機構2019

    • 著者名/発表者名
      柏木一宏
    • 学会等名
      第21回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis of eIF2B regulation by eIF2 phosphorylation2019

    • 著者名/発表者名
      Kashiwagi Kazuhiro
    • 学会等名
      EMBO Workshop, Protein Synthesis and Translational Control
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] HCV IRES captures an actively translating 80S ribosome to hijack the host translational machinery2019

    • 著者名/発表者名
      Ito Takuhiro
    • 学会等名
      EMBO Workshop, Protein Synthesis and Translational Control
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] eIF2のリン酸化によるeIF2BのGEF活性制御の構造基盤2019

    • 著者名/発表者名
      伊藤拓宏
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 翻訳の構造生物学~cryo-EMによる単粒子解析およびX線結晶構造解析、FMO法による解析例~2019

    • 著者名/発表者名
      伊藤拓宏
    • 学会等名
      CBI学会第411回講演会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 翻訳構造解析研究チーム

    • URL

      https://www.bdr.riken.jp/ja/research/labs/ito-t/index.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 翻訳構造解析研究チーム

    • URL

      https://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/ito-t/index.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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