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オルガネラ間の安定な結合を仲介する因子の網羅的同定と機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 19H03174
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43030:機能生物化学関連
研究機関山形大学

研究代表者

田村 康  山形大学, 理学部, 教授 (50631876)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2021年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2020年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2019年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワードオルガネラコンタクトサイト / ミトコンドリア / 小胞体 / 近接ラベリング法 / リソソーム / 液胞 / オルガネラ間コンタクト / 液胞(リソソーム) / オルガネラコンタクト / オルガネラ / スプリットGFP
研究開始時の研究の概要

本研究の目的は,未だ謎の多いオルガネラ同士を安定に結合させる因子を同定し,その機能を明らかにすることである。これまでの研究によりsplit-GFPやsplit-ペルオキシダーゼタンパク質と言ったスプリットタンパク質を用いることによって,オルガネラ間相互作用の定量化や,オルガネラ間コンタクトサイトに局在するタンパク質のビオチン化修飾が可能であることが示されている。本研究では当研究室で条件検討したこれらの実験手法を駆使することで,オルガネラ間相互作用の全容解明を目指す。

研究成果の概要

本研究課題では,近年その存在が明らかとなってきたオルガネラコンタクトサイトに着目し,オルガネラコンタクトサイトで特異的に働く新規タンパク質を同定することを目的とした。この目的を達成するためにまず,オルガネラコンタクトサイト特異的近接ラベリング手法の開発を目指した。具体的には,APEX2やTurboIDといったビオチンリガーゼの選択や,様々なオルガネラ局在化配列,発現方法を検討することで,空間特異的な近接ラベリング手法の開発の開発に成功した。さらにこの独自の手法を用いて,様々なオルガネラ間コンタクトに集積するタンパク質群を,出芽酵母とヒト培養細胞を用いて網羅的に同定することに成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

オルガネラ間コンタクトサイトは発見から間もない新しい概念であり,細胞機能における役割はほとんど未解明である。また一部のオルガネラコンタクトサイト,特にミトコンドリアと小胞体間コンタクトサイトの異常が,ヒトの神経変性疾患に関係することが多く報告されている。本研究によってオルガネラ間コンタクトサイトに集積するタンパク質が同定され,その機能が解明されれば,細胞の作動原理といった基礎的な知見が集積するだけでなく,ヒトの疾患の病態の解明や治療法開発に貢献できると期待される。

報告書

(4件)
  • 2022 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (55件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 2件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (38件) (うち国際学会 3件、 招待講演 10件) 図書 (2件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of Tam41 cytidine diphosphate diacylglycerol synthase from a Firmicutes bacterium2021

    • 著者名/発表者名
      Kimura Keisuke、Kawai Fumihiro、Kubota-Kawai Hisako、Watanabe Yasunori、Tomii Kentaro、Kojima Rieko、Hirata Kunio、Yamamori Yu、Endo Toshiya、Tamura Yasushi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 171 号: 4 ページ: 429-441

    • DOI

      10.1093/jb/mvab154

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Protrudin and PDZD8 contribute to neuronal integrity by promoting lipid extraction required for endosome maturation2020

    • 著者名/発表者名
      Shirane Michiko、Wada Mariko、Morita Keiko、Hayashi Nahoki、Kunimatsu Reina、Matsumoto Yuki、Matsuzaki Fumiko、Nakatsumi Hirokazu、Ohta Keisuke、Tamura Yasushi、Nakayama Keiichi I.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 4576-4576

    • DOI

      10.1038/s41467-020-18413-9

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Organelle membrane-specific chemical labeling and dynamic imaging in living cells.2020

    • 著者名/発表者名
      Tomonori Tamura, Alma Fujisawa, Masaki Tsuchiya, Yuying Shen, Kohjiro Nagao, Shin Kawano, Yasushi Tamura, Toshiya Endo, Masato Umeda, Itaru Hamachi
    • 雑誌名

      Nature chemical biology

      巻: 16 号: 12 ページ: 1361-1367

    • DOI

      10.1038/s41589-020-00651-z

    • NAID

      120006898122

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Improved Split-GFP Systems for Visualizing Organelle Contact Sites in Yeast and Human Cells.2020

    • 著者名/発表者名
      Tashiro S., Kakimoto Y., Shinmyo M., Fujimoto S. and Tamura Y.*
    • 雑誌名

      Front. Cell Dev. Biol.

      巻: 8 ページ: 571388-571388

    • DOI

      10.3389/fcell.2020.571388

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Phosphatidylserine flux into mitochondria unveiled by organelle-targeted Escherichia coli phosphatidylserine synthase PssA.2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroya Shiino, Shiina Furuta, Rieko Kojima, Keisuke Kimura, Toshiya Endo, Yasushi Tamura
    • 雑誌名

      The FEBS journal

      巻: - 号: 10 ページ: 3285-3299

    • DOI

      10.1111/febs.15657

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The mitochondrial inner membrane protein LETM1 modulates cristae organization through its LETM domain2020

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Seiko、Matsui Aiko、Akabane Shiori、Tamura Yasushi、Hatano Azumi、Miyano Yuriko、Omote Hiroshi、Kajikawa Mizuho、Maenaka Katsumi、Moriyama Yoshinori、Endo Toshiya、Oka Toshihiko
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 3 号: 1 ページ: 99-99

    • DOI

      10.1038/s42003-020-0832-5

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Yeast transformation stress, together with loss of Pah1, phosphatidic acid phosphatase, leads to Ty1 retrotransposon insertion into the INO4 gene2020

    • 著者名/発表者名
      Kudo Shinnosuke、Shiino Hiroya、Furuta Shiina、Tamura Yasushi
    • 雑誌名

      The FASEB Journal

      巻: 34 号: 3 ページ: 4749-4763

    • DOI

      10.1096/fj.201901811rr

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis for interorganelle phospholipid transport mediated by VAT-12020

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Yasunori、Tamura Yasushi、Kakuta Chika、Watanabe Seiya、Endo Toshiya
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 295 号: 10 ページ: 3257-3268

    • DOI

      10.1074/jbc.ra119.011019

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Msp1 Clears Mistargeted Proteins by Facilitating Their Transfer from Mitochondria to the ER2019

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto S., Nakatsukasa K., Kakuta C., Tamura Y., Esaki M., and *Endo T.
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 76 号: 1 ページ: 191-205

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2019.07.006

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A photostable fluorescent marker for the superresolution live imaging of the dynamic structure of the mitochondrial cristae.2019

    • 著者名/発表者名
      Wang C, Taki M, Sato Y, Tamura Y, Yaginuma H, Okada Y, Yamaguchi S.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      巻: 116 号: 32 ページ: 15817-15822

    • DOI

      10.1073/pnas.1905924116

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ミトコンドリアを介したリン脂質輸送機構と制御2021

    • 著者名/発表者名
      田村 康
    • 学会等名
      第20回 日本ミトコンドリア学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 膜脂質ダイナミクスが仲介するミトコンドリア構造形成2021

    • 著者名/発表者名
      田村 康
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会ワークショップ「生命科学の根幹に迫るミトコンドリアダイナミクスの世界」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Split-TurboID-GFPを用いたヒトミトコンドリア-小胞体間コンタクトサイト局在化タンパク質の同定2021

    • 著者名/発表者名
      松崎淳平,田代晋也,新田莉彩子,尾野雅哉,吉丸哲郎,片桐豊雅,田村康
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ヒト細胞における小胞体-リソソーム間コンタクトサイト局在タンパク質の同定2021

    • 著者名/発表者名
      高橋 賢司,尾野 雅哉,吉丸 哲郎,片桐 豊雅,田村 康
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 出芽酵母におけるミトコンドリア-液胞膜間コンタクトサイト局在タンパク質の同定出芽酵母におけるミトコンドリア-液胞膜間コンタクトサイト局在タンパク質の同定2021

    • 著者名/発表者名
      藤本慎太郎, 尾野雅哉, 吉丸哲郎, 片桐豊雅, 田村康
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 細胞ストレス応答におけるミトコンドリア-小胞体コンタクト形成の制御と生理的意義2021

    • 著者名/発表者名
      田村 康
    • 学会等名
      第94回 日本生化学会大会 シンポジウム「多面的ミトコンドリア機能による生命機能制御」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Splitビオチン化酵素を用いた哺乳類細胞内オルガネラ間コンタクト周辺タンパク質の探索2021

    • 著者名/発表者名
      田代晋也, 松崎淳平, 高橋賢司, 新田莉彩子, 尾野雅哉, 吉丸哲郎, 片桐豊雅, 田村康
    • 学会等名
      第73回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Split-TurboID-GFPを用いたミトコンドリア-液胞膜間コンタクトサイト局在タンパク質の同定2021

    • 著者名/発表者名
      藤本慎太郎, 尾野雅哉, 吉丸哲郎, 片桐豊雅, 田村康
    • 学会等名
      第73回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Metabolic roles of organelle contact site2021

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Tamura
    • 学会等名
      第73回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ミトコンドリア- ER間コンタクト制御を介したER ストレス応答2021

    • 著者名/発表者名
      田村 康
    • 学会等名
      第31回 Forum in DOJIN 「細胞内膜系のダイナミズム-オルガネラが織りなす細胞のドラマ」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] オルガネラ間リン脂質輸送制御を介したERストレス応答2020

    • 著者名/発表者名
      田村康
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 酵母形質転換ストレスとPah1の欠損はINO4遺伝子へのTy1レトロトランスポゾン挿入を引き起こす2020

    • 著者名/発表者名
      椎野浩也,工藤真之祐,古田詩唯奈,田村康
    • 学会等名
      第62回日本脂質生化学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア・小胞体間におけるリン脂質合成輸送阻害剤の単離2020

    • 著者名/発表者名
      椎野浩也,橋本美智子,遠藤斗志也,田村康
    • 学会等名
      第72回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア-小胞体間結合因子ERMES複合体クラスターの解離がERストレス軽減に寄与する2020

    • 著者名/発表者名
      柿元百合子,小島理恵子,新名真夏,黒川量雄,中野明彦,遠藤斗志也,田村康
    • 学会等名
      第72回細胞生物学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Split-APEX2-GFP を用いたヒトミトコンドリア-小胞体間コンタクトサイト局在タンパク質の同定2020

    • 著者名/発表者名
      松崎淳平,田代晋也,新田莉彩子,尾野雅哉,吉丸哲郎,片桐豊雅,遠藤斗志也,田村康
    • 学会等名
      第72回細胞生物学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Firmicutes bacterium由来のCDP-DAG合成酵素Tam41の結晶構造の解明2020

    • 著者名/発表者名
      5.木村啓介, 河合文啓, 平田邦生, 河合寿子, 小島理恵子, 渡邊康紀, 遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア-小胞体間リン脂質輸送阻害剤の単離2020

    • 著者名/発表者名
      椎野浩也,橋本美智子,遠藤斗志也,田村康
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] トコンドリア-小胞体間におけるリン脂質合成酵素及び輸送因子阻害剤の探索2020

    • 著者名/発表者名
      椎野浩也,橋本美智子,遠藤斗志也,田村康
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Firmicutes bacterium 由来のCDP-DAG合成酵素Tam41の結晶構造の解明2020

    • 著者名/発表者名
      木村啓介,河合文啓,河合寿子,小島理恵子,渡邊康紀,遠藤斗志也,田村康
    • 学会等名
      第28 回山形分子生物学セミナー
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアの構造形成におけるリン脂質輸送の役割2019

    • 著者名/発表者名
      田村康
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Maintenance of Crista Structure Requires Intramitochondrial Phospholipid Transport2019

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Tamura
    • 学会等名
      第71回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Roles of phospholipid transport in mitochondrial biogenesis2019

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Tamura
    • 学会等名
      The International Conference on the Bioscience of Lipids
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Identification of novel factors involved in formation of ER-mitochondria contact sites2019

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Tamura
    • 学会等名
      Organelle zones: opening a new era of Cell Biology
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Two independent regulatory mechanisms controlling the number of ER-mitochondria contact sites.2019

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Tamura
    • 学会等名
      Organelle zones meet compartmental gates and contact sites
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ミトコンドリアと小胞体間結合領域を制御する分子メカニズムの解明2019

    • 著者名/発表者名
      柿元百合子, 小島理恵子, 新名真夏,遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      ミトコンドリアサイエンスワークショップ2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ERMES数を制御する分子メカニズムの解明2019

    • 著者名/発表者名
      柿元百合子, 小島理恵子, 新名真夏,遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      日本生化学会大会東北支部第85回例会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア局在型CDP-DAG合成酵素Tam41の結晶化2019

    • 著者名/発表者名
      木村啓介, 小島理恵子, 遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Roles of nuclear-vacuole junctions in maintaining mitocondrial morphology2019

    • 著者名/発表者名
      新名真夏, 遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      第71回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Identification of novel factors regulating mitochondrial volume in yeast2019

    • 著者名/発表者名
      後藤美稀, 遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      第71回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] リン脂質合成及び輸送阻害剤の探索2019

    • 著者名/発表者名
      椎野浩也,橋本美智子 遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      第71回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア・小胞体間コンタクトサイトの数を制御する分子メカニズムの解明2019

    • 著者名/発表者名
      柿元百合子, 小島理恵子, 遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      第71回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 哺乳類ミトコンドリア・ER膜間コンタクト形成に関与する因子の探索2019

    • 著者名/発表者名
      田代晋也・名黒功・遠藤斗志也・田村康
    • 学会等名
      第71回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] リン脂質合成及び輸送阻害剤の探索2019

    • 著者名/発表者名
      椎野浩也, 橋本美智子 遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ヒトミトコンドリア・ER膜間コンタクト形成に関与する因子の探索2019

    • 著者名/発表者名
      田代晋也・名黒功・遠藤斗志也・田村康
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア-小胞体間結合因子ERMES複合体のクラスター数を制御する分子メカニズムの解明2019

    • 著者名/発表者名
      柿元百合子,小島理恵子,新名真夏,遠藤斗志也,田村康
    • 学会等名
      第27回山形分子生物学セミナー
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 出芽酵母におけるミトコンドリアを制御する因子の同定2019

    • 著者名/発表者名
      後藤美稀,遠藤斗志也,田村康
    • 学会等名
      第27回山形分子生物学セミナー
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア-小胞体間におけるリン脂質合成及び輸送阻害剤の探索2019

    • 著者名/発表者名
      椎野浩也, 橋本美智子, 遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      第27回山形分子生物学セミナー
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ヒト細胞ミトコンドリア・ER膜間コンタクト形成に関与する因子の探索2019

    • 著者名/発表者名
      田代晋也,名黒功, 遠藤斗志也, 田村康
    • 学会等名
      第27回山形分子生物学セミナー
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [図書] ミトコンドリアを介した脂質輸送と代謝,実験医学(増刊)ミトコンドリアと疾患・老化2019

    • 著者名/発表者名
      田村康,河野慎,遠藤斗志也
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [図書] ミトコンドリアを介したオルガネラコンタクト2019

    • 著者名/発表者名
      田村康
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      科学評論社
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 研究室HP

    • URL

      https://www.tamuralab.com/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 細胞内の脂質交通を追跡できる実験手法を開発

    • URL

      https://www.yamagata-u.ac.jp/jp/information/press/20210115_01/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 田村研究室

    • URL

      https://www.tamuralab.com/publications

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] タンパク質の細胞内輸送の校正システムを発見

    • URL

      https://www.yamagata-u.ac.jp/jp/information/press/20190822_01/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 細胞のリン脂質が「動く遺伝子」の抑制に重要であることを発見

    • URL

      https://www.yamagata-u.ac.jp/jp/information/press/20200305_02/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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