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ハイスループット単一分子分光による光合成タンパク質のassembly中間体の探索

研究課題

研究課題/領域番号 19H03187
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関東北大学

研究代表者

柴田 穣  東北大学, 理学研究科, 准教授 (20300832)

研究分担者 高橋 裕一郎  岡山大学, 異分野基礎科学研究所, 教授 (50183447)
鞆 達也  東京理科大学, 教養教育研究院神楽坂キャンパス教養部, 教授 (60300886)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
15,730千円 (直接経費: 12,100千円、間接経費: 3,630千円)
2021年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2020年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2019年度: 10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
キーワード低温顕微鏡 / タンパク質Assembly / 励起スペクトル / 単一分子分光 / 時間分解蛍光測定 / エネルギー移動 / 過渡的中間体 / 光化学系I / 過渡的中華体
研究開始時の研究の概要

植物の光合成を駆動するのは、数10個の色素分子を結合したタンパク質複合体である。その複雑な構造が生体内で構築される機構はよく分かっていない。これを明らかにするため、本研究では構造が出来上がる途上の中間体の同定を目指す。光をあてずに発芽させた植物に光照射すると、活発な光合成タンパク質合成が開始される。このような植物に含まれる光合成タンパク質を丸ごと全部溶液中に溶かしで希釈し、単一分子分光という方法で一つ一つのタンパク質の蛍光スペクトルを取得する。最近私が開発した顕微鏡では、多くの分子のスペクトルを効率よく取得できるようになっており、この技術を利用して微量に存在する構造構築中間体を見つける。

研究成果の概要

光合成タンパク質が生体内で構築される機構を探るため、タンパク質の組み立て途上の様子を検出することを目指した。組み立て途上のタンパク質は、生体内では過渡的に生じる希少種であることから、検出は困難である。そこで、分子1個を観測する手法である単一分子検出法を応用し、生体から抽出した分子を全部測定する、という網羅的単一分子検出法という手法を開発した。今回の研究により、サンプル中にわずかにしか存在しない、しかし非常に重要な分子を同定する手法を確立することが出来た。

研究成果の学術的意義や社会的意義

光合成を駆動するタンパク質の構造は明らかとなり、反応機構解明も進んだ。一方で、複雑な構造が生体内で自発的に構築される機構はほとんど分かっていない。特に100個近い色素分子が、大きなタンパク質分子の所定の位置に正しく結合する機構は全くの謎である。光合成反応を駆動するタンパク質の構築機構が分かれば、人工的に光合成反応を起こす分子機械の合成にもヒントとなると期待される。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] High-speed excitation-spectral microscopy uncovers in-situ rearrangement of light-harvesting apparatus in Chlamydomonas during state transitions at submicron precision2021

    • 著者名/発表者名
      Zhang XianJun、Fujita Yuki、Tokutsu Ryutaro、Minagawa Jun、Ye Shen、Shibata Yutaka
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 未定 号: 5 ページ: 872-882

    • DOI

      10.1093/pcp/pcab047

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 単一分子蛍光分光で見える光合成アンテナ系の揺らぐエネルギー移動経路2021

    • 著者名/発表者名
      SHIBATA Yutaka
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 61 号: 1 ページ: 023-026

    • DOI

      10.2142/biophys.61.023

    • NAID

      130007976661

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of a multicolor line-focus microscope for rapid acquisitions of excitation spectra2020

    • 著者名/発表者名
      Sakar Jana, and Yutaka Shibata
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 118 号: 1 ページ: 36-43

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2019.11.023

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A gold nanoparticle conjugate with photosystem I and photosystem II for development of a biohybrid water-splitting photocatalyst2020

    • 著者名/発表者名
      Kawahara Kousuke、Inoue-Kahino Natsuko、Namie Keisuke、Kato Yuki、Tomo Tatsuya、Shibata Yutaka、Kashino Yasuhiro、Noguchi Takumi
    • 雑誌名

      Biomedical Spectroscopy and Imaging

      巻: 9 号: 1-2 ページ: 73-81

    • DOI

      10.3233/bsi-200200

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of Assembly Precursors to Photosystems Emitting Fluorescence at 683 nm and 687 nm by Cryogenic Fluorescence Microspectroscopy2019

    • 著者名/発表者名
      Tomofumi Chiba, and Yutaka Shibata
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta

      巻: 1860 号: 12 ページ: 148090-148090

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2019.148090

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Redox-state dependent blinking of single photosystem I trimers at around liquid-nitrogen temperature2019

    • 著者名/発表者名
      Jana, S., Du, T., Nagao, R., Noguchi, T., Shibata, Y.
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg.

      巻: 1860 号: 1 ページ: 30-40

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2018.11.002

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Excitation-spectral microscopy uncovers in-situ rearrangement of LHCII in Chlamydomonas during state transitions2021

    • 著者名/発表者名
      張 先駿, 藤田 祐輝, 得津 隆太郎, 皆川 純, 叶 深, 柴田 穣
    • 学会等名
      第11回日本光合成学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Excitation-spectral microscopy uncovers in-situ rearrangement of LHCII in Chlamydomonas during state transition2021

    • 著者名/発表者名
      張 先駿, 藤田 祐輝, 得津 隆太郎, 皆川 純, 叶 深, 柴田 穣
    • 学会等名
      第28回光合成セミナー2021: 反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系Iassembly中間体の時間分解蛍光および単一分子分光解析2021

    • 著者名/発表者名
      金田直也, Sreedhar Nellaepalli, 高橋裕一郎, 柴田穣
    • 学会等名
      第28回光合成セミナー2021: 反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 二次元蛍光寿命相関分光による光化学系Iタンパク質の単一分子電子移動速度の測定2021

    • 著者名/発表者名
      谷口凜,篠田稔行,鞆達也,叶深,近藤徹,柴田穣
    • 学会等名
      第15回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系I assembly中間体の単粒子分光と時間分解蛍光解析2021

    • 著者名/発表者名
      金田直也, Sreedhar Nellaepalli, 高橋裕一郎, 叶深, 柴田穣
    • 学会等名
      2021年度 化学系学協会東北大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ストリークカメラを検出器とした細胞内局所での時間分解顕微蛍光分光2021

    • 著者名/発表者名
      藤田 祐輝,張 先駿, 金田 直也,柴田 穣
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 励起スペクトル顕微鏡と超解像イメージングで明らかになったステート遷移におけるチラコイ ド膜の不規則な構造変化2021

    • 著者名/発表者名
      張 先駿, 藤田 祐輝, 金田 直也, 得津 隆太郎, 皆川 純, 叶 深, 柴田 穣
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Uphill energy transfer mechanism for photosynthesis in the Antarctic alga2021

    • 著者名/発表者名
      Makiko Kosugi, Masato Kawasaki, Yutaka Shibata, Kojiro Hara, Shinichi Takaichi, Toshio Moriya, Naruhiko Adachi, Yasuhiro Kamei, Yasuhiro Kashino, Sakae Kudoh, Hiroyuki Koike, Toshiya Senda
    • 学会等名
      The 12th Symposium on Polar Science
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Connecting the spectral properties to the structure of photosystem I containing Chlorophyll-f2020

    • 著者名/発表者名
      Rin Taniguchi, Yutaka Shibata, Toshiyuki Shinoda, Tatsuya Tomo, Shen Ye
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] In situ visualization of reversible state transition in live Chlamydomonas cells by noninvasive excitation spectral microscopy2020

    • 著者名/発表者名
      Xianjun Zhang, Yuki Fujita, Ryutaro Tokutsu, Jun Minagawa, Shen Ye, Yutaka Shibata
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Simultaneous Mapping of Fluorescence Spectra and Lifetimes of Chlorophylls Revealed Accumulation of Quenched LHCII2020

    • 著者名/発表者名
      Yuki Fujita, Xianjun Zhang, Touru Kondou, Yutaka Shibata
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 単一分子分光によるクロロフィル-f を含む光化学系I の蛍光不均一性2020

    • 著者名/発表者名
      小林 誉宗,谷口 凛,柴田 穣,篠田 稔行,鞆 達也,叶 深
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 極低温光学顕微分光法による緑藻クラミドモナスのステート遷移の葉緑体内不均一性の観測2020

    • 著者名/発表者名
      藤田祐輝,張先駿,柴田穣
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Single Molecule Spectroscopy On Photosystem I Revealed The Dynamical Nature Of The Light Harvesting2019

    • 著者名/発表者名
      Yutaka Shibata, Sankar Jana, Ting Du, Ryo Nagao, and Takumi Noguchi
    • 学会等名
      International Conference on Artificial Photosynthesis-2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Evaluation of the movement of photosynthetic antenna complexes in algal cells by excitation spectral measurements on microscope2019

    • 著者名/発表者名
      Xianjun Zhang, Sankar Jana, Shen Ye, Yutaka Shibata
    • 学会等名
      International Conference on Artificial Photosynthesis-2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 光で単一分子の挙動を測る

    • URL

      http://sub.web.tohoku.ac.jp/orgphys/content/files/research_Shibata.pdf

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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