| 研究課題/領域番号 |
19H03212
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分43050:ゲノム生物学関連
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| 研究機関 | 東京大学 (2021-2023)
宮崎大学 (2019-2020) |
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研究代表者 |
菊地 泰生 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (20353659)
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| 研究分担者 |
平形 樹生 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (40844791)
佐藤 薫 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20548507)
塩見 美喜子 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (20322745)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2022年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2021年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2020年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2019年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
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| キーワード | ゲノム構造変化 / C. elegans / 姉妹種 / トランスポゾン / 進化 / ゲノム / small RNA / ゲノム構造進化 / 比較ゲノム / トランポゾン / 近縁種 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
トランスポゾンは生物進化を助長する一方で、トランスポゾンの転移活性はゲノム損傷ひいては致死を引き起こすため、真核生物はSmall RNAによるRNAサイレンシング機構を駆使してトランスポゾンを抑制する。本研究ではモデル生物であるC. elegansと、近年発見された姉妹種C. inopinataの比較解析を行うことで、トランスポゾンによるゲノムの構造進化、さらにそれを制御するsmall RNA機構を明らかにすることを目的として行う。
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| 研究成果の概要 |
トランスポゾンは生物進化を助長する一方で、トランスポゾン転移はゲノムの損傷の原因となり、生殖不全や致死など、生物にとって有害な影響をもたらす。石垣島で発見されたC. inopinataのゲノムにはトランスポゾンが特徴的に多く存在する。本研究期間で、発達ステージごとのsmall RNA発現解析、野外分離株を用いたC. inopinataのゲノム進化解析を行い、C. inopinataにおけるsmall RNAプロファイルを明らかにし、C. inopinata野生株におけるトランスポゾンの動態を明らかにした。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
トランスポゾンは生物の進化に役立つ一方で、ゲノムにダメージを与え、生殖障害や死亡を引き起こすリスクがあります。真核生物はこれを防ぐため、Small RNAによるRNAサイレンシングでトランスポゾンを抑制しています。石垣島で発見されたC. elegansの姉妹種C. inopinataは、体が約2倍大きく、繁殖方法や生態が異なります。研究により、C. inopinataのゲノムには多くのトランスポゾンがあり、重要な遺伝子が損傷を受けていることが分かりました。small RNAパスウェイの変化がトランスポゾンの活性化に関与している可能性もあきらかとなりました。
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