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新規3次元誘電率顕微鏡の開発と細胞内小器官の連携メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 19H03230
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分44010:細胞生物学関連
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

小椋 俊彦  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 上級主任研究員 (70371028)

研究分担者 山本 条太郎  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (20585088)
岡田 知子  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 総括研究主幹 (30344146)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2022年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2021年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2019年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
キーワード窒化シリコン薄膜 / 走査電子顕微鏡 / 誘電率 / 液中観察 / 培養細胞 / 細胞内小器官 / 走査電子誘電率顕微鏡 / 画像処理 / 3次元構造解析 / オートファジー / 走査電子 / 3次元観察
研究開始時の研究の概要

細胞は、核や小胞体、ゴルジ体等の様々な細胞内小器官が相互に関連し連携することで生命活動を維持し様々な機能を発現している。本研究では、これまで観察が極めて困難であった生きた無処理の細胞内小器官を高分解能でかつその3次元構造をそのまま観察する新たな誘電率顕微鏡の開発を目指す。我々はこれまで電子線を用いた世界初の走査電子誘電率顕微鏡の開発を進めてきた。本提案では、この誘電率顕微鏡を大幅に高機能化し、さらに3次元構造を解析できる新たなシステムを開発する。加えて、本提案により開発した3次元観察システムを用いて、膜タンパク質複合体やオートファジ―等に関連する細胞内小器官の3次元構造変化を詳細に分析する。

研究成果の概要

本研究では、走査電子誘電率顕微鏡の高機能化を行った。具体的には、高感度・低ノイズの初段アンプの開発と10 nm厚のSiN膜による高分解能観察ホルダを開発した。窒化シリコン薄膜を10nm厚にすることで空間分解能が4.5 nmまで向上し、細胞構造や有機材料等の構造をより詳細に観察することが可能となった。本システムを用いる事で、マウス乳がん細胞やメラニン色素細胞、口腔内上皮細胞等の様々な細胞のナノレベルでの直接観察を可能とした。さらに、観察された画像から、細胞内膜等の細胞内小器官の動作機構を解析する事に成功した。これに加えて最新の画像情報処理技術を用いる事で、細胞内小胞等の自動解析技術を開発した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、高機能な走査電子誘電率顕微鏡を開発した。本システムを用いる事で、培養細胞の内部構造をナノレベルの分解能で生きたまま直接観察する事が可能となった。これにより、細胞内小器官のより詳細な解析が進展する事が予想される。さらに、培養細胞だけでなく、バクテリアやタンパク質複合体等の様々な生物試料の溶液中での直接観察と分析を可能とする。これ以外にも溶液中の有機材料やナノ粒子、食品や化粧品、石油化学製品、燃料電池や2次電池材料等の様々な分野においても活用が期待され、学術的にも産業的にも極めて大きな意義があるものと考えられる。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 2件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 5件、 招待講演 9件)

  • [雑誌論文] Structural analysis of melanosomes in living mammalian cells using scanning electron-assisted dielectric microscopy with deep neural network2023

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Okada, Tomoaki Iwayama, Taku Ogura, Shinya Murakami, Toshihiko Ogura
    • 雑誌名

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      巻: 21 ページ: 506-518

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2022.12.027

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of General-purpose Dielectric Constant Imaging Unit for SEM and Direct Observation of Samples in Aqueous Solution2023

    • 著者名/発表者名
      Toshihiko Ogura, Tomoko Okada, Michio Hatano, Mitsuhiro Nakamura, Toshihide Agemura
    • 雑誌名

      Microscopy and Microanalysis

      巻: - 号: 3 ページ: 1037-1046

    • DOI

      10.1093/micmic/ozad030

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Giant Carbon Nano-Test Tubes as Versatile Imaging Vessels for High-Resolution and In Situ Observation of Proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Tracy T Chuong, Toshihiko Ogura, Norihito Hiyoshi, Kazuma Takahashi, Sangho Lee, Keita Hiraga, Hiroki Iwase, Akira Yamaguchi, Kiyoto Kamagata, Eriko Mano, Satoshi Hamakawa, Hirotomo Nishihara, Takashi Kyotani, Galen D Stucky, Tetsuji Itoh
    • 雑誌名

      ACS Applied Materials & Interfaces

      巻: 14 号: 23 ページ: 26507-26516

    • DOI

      10.1021/acsami.2c06318

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Arginine and its Derivatives Suppress the Opalescence of an Antibody Solution2022

    • 著者名/発表者名
      Shogo Oki, Suguru Nishinami, Yoshitaka Nakauchi, Toshihiko Ogura, Kentaro Shiraki
    • 雑誌名

      Journal of Pharmaceutical Sciences

      巻: 111 号: 4 ページ: 1126-1132

    • DOI

      10.1016/j.xphs.2021.11.018

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of multi-frequency impedance scanning electron microscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Ogura Toshihiko
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 17 号: 1 ページ: e0263098-e0263098

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0263098

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Raman scattering enhancement of dielectric microspheres on silicon nitride film2022

    • 著者名/発表者名
      Ogura Toshihiko
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-022-09315-5

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Nanoscale observation of PM2.5 incorporated into mammalian cells using scanning electron-assisted dielectric microscope2021

    • 著者名/発表者名
      Okada Tomoko、Iwayama Tomoaki、Murakami Shinya、Torimura Masaki、Ogura Toshihiko
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 228-228

    • DOI

      10.1038/s41598-020-80546-0

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Scanning Electron-Assisted Dielectric Microscopy Reveals Autophagosome Formation by LC3 and ATG12 in Cultured Mammalian Cells2021

    • 著者名/発表者名
      Okada Tomoko、Ogura Toshihiko
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 号: 4 ページ: 1834-1834

    • DOI

      10.3390/ijms22041834

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Direct observation of unstained biological samples in water using newly developed impedance scanning electron microscopy2019

    • 著者名/発表者名
      Ogura Toshihiko
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 14 号: 8 ページ: e0221296-e0221296

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0221296

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of INSOL‐tag for proteome‐wide protein handling and its application in protein array analysis2019

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Eriko、Mori Masatoshi、Shiku Hiroshi、Miyahara Yoshihiro、Kawamura Yoshifumi、Ogawa Koji、Ogura Toshihiko、Goshima Naoki
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 25 号: 1 ページ: 41-53

    • DOI

      10.1111/gtc.12735

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Osteoblastic lysosome plays a central role in mineralization2019

    • 著者名/発表者名
      Iwayama Tomoaki、Okada Tomoko、Ueda Tsugumi、Tomita Kiwako、Matsumoto Shuji、Takedachi Masahide、Wakisaka Satoshi、Noda Takeshi、Ogura Taku、Okano Tomomichi、Fratzl Peter、Ogura Toshihiko、Murakami Shinya
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 5 号: 7

    • DOI

      10.1126/sciadv.aax0672

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Nanoscale observation of fine particles and biological specimens in aqueous condition by scanning-elect ron assisted dielectric microscop2022

    • 著者名/発表者名
      小椋 俊彦、岡田 知子
    • 学会等名
      11th International Conference on Fine Particle s Magnetis
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Nanoscale imaging of intact biological specimens in water using scanning electron assisted dielectric mi croscop2022

    • 著者名/発表者名
      小椋 俊彦、岡田 知子
    • 学会等名
      第8回メタロミクスに関する国際会議(ISM-8)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Direct observation of biological fine particles in water by scanning-electron assisted dielectric microscopy2021

    • 著者名/発表者名
      小椋俊彦、岡田知子
    • 学会等名
      Pacifichem 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 走査電子誘電率顕微鏡の開発と水溶液中の試料の直接観察2021

    • 著者名/発表者名
      小椋俊彦
    • 学会等名
      第45回静電気学会全国大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 走査電子誘電率顕微鏡による溶液中のコロイド粒子や生物試料の直接観察2021

    • 著者名/発表者名
      小椋俊彦
    • 学会等名
      コロイド先端 技術講座「先端バイオ計測技術」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] High-resolution imaging of proteins and cells under aqueous condition using scanning-electron assisted dielectric microscopy (SE-ADM)2020

    • 著者名/発表者名
      小椋 俊彦、伊藤 徹二、岡田 知子
    • 学会等名
      第30回日本MRS年次大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 革新的液中ナノ顕微鏡開発と細胞外微粒子の包括的解明2020

    • 著者名/発表者名
      小椋 俊彦
    • 学会等名
      日本分析化学会第69回年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Nanoscale observation of biological specimens in aqueous condition by scanning-electron assisted dielectric microscopy2019

    • 著者名/発表者名
      小椋 俊彦、岡田 知子
    • 学会等名
      OKINAWA COLLOIDS 2019 conference
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Nanoscale imaging of unstained biological specimens in water using newly developed scanning-electron assisted dielectric microscopy2019

    • 著者名/発表者名
      小椋 俊彦、岡田 知子
    • 学会等名
      5th International Kyushu Colloid Colloquium
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 走査電子誘電率顕微鏡によるナノ・マイクロプラスチックの細胞への影響解析2019

    • 著者名/発表者名
      小椋 俊彦、岡田 知子
    • 学会等名
      産総研・シンポジウム「マイクロプラスチックの計測・評価を考える」
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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