| 研究課題/領域番号 |
19H03425
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分48040:医化学関連
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| 研究機関 | 国際医療福祉大学 |
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研究代表者 |
辻 省次 国際医療福祉大学, 医学部, 教授 (70150612)
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| 研究分担者 |
池内 健 新潟大学, 脳研究所, 教授 (20372469)
田中 真生 国際医療福祉大学, 医学部, 講師 (30774252)
石浦 浩之 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (40632849)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2021年度)
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| 配分額 *注記 |
17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
2021年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2020年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2019年度: 9,230千円 (直接経費: 7,100千円、間接経費: 2,130千円)
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| キーワード | association study / Alzheimer disease / rare variants / アルツハイマー病 / 低頻度バリアント / リスク遺伝子 / rare variant / 関連解析 / exome解析 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
本研究では孤発性アルツハイマー病446例，認知機能正常の高齢健常者446例の全エクソンシーケンスデータを用いて，一般集団において見出されないか，極めて稀なvariantsに重点を置いて解析を行う．さらに，permutationによりランダムな集団構成での検定を繰り返し行うことにより有意水準を決定し，多重検定に伴う第２種過誤を克服する新たな戦略 (rare variants association study) を開発する．見出されたvariantsについては，独立のデータセット（アルツハイマー病400例，認知機能の正常な高齢者健常者400例）を用いた検証を行い，その生物学的意義を明らかにする．
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| 研究成果の概要 |
サンプルサイズが小さくても，permutationにより関連解析の検出力を高めることをめざした．アルツハイマー病患者446例，認知機能正常な高齢健常者446例のexomeデータを用いて関連遺伝子の探索を行った．見出された候補遺伝子にはGC率が高い領域が含まれていたために，exon capture，library作成の最適化を行った．新規に，アルツハイマー病患者262例，認知機能正常高齢健常者260例を用いてexome解析を実施し，精度の高いデータを得た．当初見出した候補遺伝子については有意な関連は確認されなかったが，関連が示唆される複数の遺伝子が示され，permutationの意義を確認した．
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
多因子疾患の発症に関わる遺伝子の探索は，ゲノムワイド関連解析 (genome-wide association study, GWAS)が行われる．関連解析では，個々の変異毎に，疾患群と対照群の間で検定を行うが，変異の数に対応した多重検定の補正が必要になり，有意水準としてのp値が極めて小さくなり，検出力を確保するために，巨大なサンプルサイズが必要となる．この課題を克服するために，permutationにより，有意水準としてのp値を定めることにより，検出力を高めることを検討し，この手法の有用性が高いことを見出し，多因子疾患の関連解析の新たな手法を提案した点に本研究の意義がある．
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