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スパースモデリングを応用した外科学知識の体系化基盤の構築

研究課題

研究課題/領域番号 19H04484
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分90130:医用システム関連
研究機関京都大学

研究代表者

中尾 恵  京都大学, 医学研究科, 教授 (10362526)

研究分担者 上田 順宏  奈良県立医科大学, 医学部, 学内講師 (40571005)
今井 裕一郎  奈良県立医科大学, 医学部, 研究員 (80347567)
松田 哲也  京都大学, 情報学研究科, 教授 (00209561)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
15,210千円 (直接経費: 11,700千円、間接経費: 3,510千円)
2023年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2022年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2021年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2020年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2019年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
キーワード機械学習 / スパースモデリング / 手術計画 / 下顎骨再建 / 医用人工知能
研究開始時の研究の概要

本研究の目的は,外科医の医学知識や経験を体系化し,外科医自身の新たな洞察や知識の獲得に資する機械学習方法と情報システムの探究である.患者個人の三次元医用画像と医師による手術計画,臨床医学用語間の関係を記述する外科手術コーパスの概念を提案する.スパースモデリングの数理に基づいて手術計画の機序をデータ駆動型で定式化し,患者固有の計画を自動生成する枠組みの構築を目指す.

研究成果の概要

本研究は外科医の医学知識や経験を体系化し,外科医自身の新たな洞察や知識の獲得に資する機械学習方法と情報システムを探究した.特に,日常的に得られる手術計画の事例データから客観的かつ自動的に手術プロセスを定式化するスパースモデリングの枠組みの構築を目指した.異なる施設に所属する複数の医師による696例の手術計画データを集積し,多クラス分類を対象としたLasso解列挙アルゴリズムを開発して手術計画に重要な特徴量を解析した.また,手術計画データと3次元医用画像から得られる画像特徴量,臨床医学用語との因果関係の解析を実現するグラフニューラルネットワークに基づくスパース深層因果探索モデルを開発した.

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究は個人の知識や技術への要求が高い外科学分野を対象にスパースモデリングの数理,データ科学の概念を導入し,外科学知識の定式化を目指した.異なる施設に所属する複数の外科医の協力を得て,多施設間研究として手術計画に共通に見られる法則と差異の抽出,手術計画に重要となる多次元特徴量の解析を実施した.また,機械学習モデルの推論に至る機序の明確化,ホワイトボックス化の課題に対して,本研究では統計的因果探索に基づく機械学習モデルを開発してアプローチしており,推論機序の可視化を実現する機械学習プラットフォーム構築の事例とみなすこともできる.

報告書

(6件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 7件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (23件) (うち国際学会 6件、 招待講演 4件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Medical Image Synthesis and Statistical Reconstruction Methods2023

    • 著者名/発表者名
      Megumi Nakao
    • 雑誌名

      Advanced Biomedical Engineering

      巻: 12 号: 0 ページ: 21-27

    • DOI

      10.14326/abe.12.21

    • ISSN
      2187-5219
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Shape reconstruction for undetectable regions of abdominal organs based on a graph convolutional network2023

    • 著者名/発表者名
      Z. Wang, M. Nakao, M. Nakamura, T. Matsuda
    • 雑誌名

      Expert Systems With Applications

      巻: 15 ページ: 120593-120593

    • DOI

      10.1016/j.eswa.2023.120593

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Image-to-Graph Convolutional Network for 2D/3D Deformable Model Registration of Low-Contrast Organs2022

    • 著者名/発表者名
      Megumi Nakao, Mitsuhiro Nakamura, Tetsuya Matsuda
    • 雑誌名

      IEEE Trans. Med. Imaging

      巻: 41 号: 12 ページ: 3747-3761

    • DOI

      10.1109/tmi.2022.3194517

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Computed Tomography slice interpolation in the longitudinal direction based on deep learning techniques: To reduce slice thickness or slice increment without dose increase2022

    • 著者名/発表者名
      Wu Shuqiong、Nakao Megumi、Imanishi Keiho、Nakamura Mitsuhiro、Mizowaki Takashi、Matsuda Tetsuya
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 17 号: 12 ページ: 1-18

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0279005

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Deformation analysis of surface and bronchial structures in intraoperative pneumothorax using deformable mesh registration2021

    • 著者名/発表者名
      Nakao Megumi、Kobayashi Kotaro、Tokuno Junko、Chen-Yoshikawa Toyofumi、Date Hiroshi、Matsuda Tetsuya
    • 雑誌名

      Medical Image Analysis

      巻: 73 ページ: 102181-102181

    • DOI

      10.1016/j.media.2021.102181

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Statistical deformation reconstruction using multi-organ shape features for pancreatic cancer localization2021

    • 著者名/発表者名
      Nakao Megumi、Nakamura Mitsuhiro、Mizowaki Takashi、Matsuda Tetsuya
    • 雑誌名

      Medical Image Analysis

      巻: 67 ページ: 101829-101829

    • DOI

      10.1016/j.media.2020.101829

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Kernel-based framework to estimate deformations of pneumothorax lung using relative position of anatomical landmarks2021

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Utako、Nakao Megumi、Ohzeki Masayuki、Tokuno Junko、Chen-Yoshikawa Toyofumi Fengshi、Matsuda Tetsuya
    • 雑誌名

      Expert Systems with Applications

      巻: 183 ページ: 115288-115288

    • DOI

      10.1016/j.eswa.2021.115288

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Regularized Three-Dimensional Generative Adversarial Nets for Unsupervised Metal Artifact Reduction in Head and Neck CT Images2020

    • 著者名/発表者名
      M. Nakao, K. Imanishi, N. Ueda, Y. Imai, T. Kirita, T. Matsuda
    • 雑誌名

      IEEE Access

      巻: 8 ページ: 109453-109453

    • DOI

      10.1109/access.2020.3002090

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Resection Process Map: A novel dynamic simulation system for pulmonary resection2020

    • 著者名/発表者名
      Tokuno Junko、Chen-Yoshikawa Toyofumi F.、Nakao Megumi、Matsuda Tetsuya、Date Hiroshi
    • 雑誌名

      The Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery

      巻: 159 号: 3 ページ: 1130-1138

    • DOI

      10.1016/j.jtcvs.2019.07.136

    • NAID

      120006810863

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 画像分類における深層因果探索モデルの検討2024

    • 著者名/発表者名
      元田 凌平, 中尾 恵
    • 学会等名
      電子情報通信学会技術報告 (MI)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 視覚情報のみから手術鉗子による臓器加圧程度を推定する検討2024

    • 著者名/発表者名
      増井 仁彦, 粂 直人, 中尾 恵, 曲渕 敏博, 濵田 彬弘, 澤田 篤郎, 小林 恭
    • 学会等名
      日本生体医工学会 生体画像と医用人工知能研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Construction of Shape Atlas for Abdominal Organs using Three-Dimensional Mesh Variational Autoencoder2023

    • 著者名/発表者名
      Ryuichi Umehara, Mitsuhiro Nakamura, Megumi Nakao
    • 学会等名
      Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc .
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 階層的潜在変数を用いたMeshVAEによる臓器形状アトラスの構築2023

    • 著者名/発表者名
      梅原 隆一, 中村 光宏, 中尾 恵
    • 学会等名
      電子情報通信学会技術報告 (MI)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 3次元メッシュ変分オートエンコーダーを用いた臓器形状アトラスの構築2023

    • 著者名/発表者名
      梅原 隆一, 中村 光宏, 中尾 恵
    • 学会等名
      電子情報通信学会技術報告 (MI)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 医用画像のxR2022

    • 著者名/発表者名
      中尾 恵
    • 学会等名
      システム制御情報学会 研究発表講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] CT画像間の変位場を用いた敵対的データ拡張の試み2022

    • 著者名/発表者名
      栗山 由也, 中尾 恵, 中村 光宏
    • 学会等名
      第21回情報科学技術フォーラム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Determination of Population-Based Anisotropic Margin for Uterus and Cervix During a Course of Magnetic Resonance-Guided Intensity-Modulated Radiation Therapy2022

    • 著者名/発表者名
      Y. Kishigami, M. Nakamura, M. Nakao, H. Okamoto, A. Takahashi, H. Igaki
    • 学会等名
      64th AAPM annual meeting
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 子宮頸がんに対する放射線治療における非等方マージンサイズの決定2022

    • 著者名/発表者名
      岸上 祐加子, 中村 光宏, 中尾 恵, 岡本 裕之, 高橋 彩加, 井垣 浩
    • 学会等名
      日本放射線腫瘍学会第35回学術大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 識別モデルの判断に関わる特徴の深層画像生成による可視化2022

    • 著者名/発表者名
      白 優志, 中尾 恵, 松田 哲也
    • 学会等名
      電子情報通信学会技術報告 (MI)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Improvement of Image Quality of Cone-beam CT Images by Three-dimensional Generative Adversarial Network2021

    • 著者名/発表者名
      T. Hase, M. Nakao, M. Nakamura, T. Matsuda
    • 学会等名
      42nd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Shape Reconstruction for Abdominal Organs based on a Graph Convolutional Network2021

    • 著者名/発表者名
      Z. Wang, M. Nakao, M. Nakamura, T. Matsuda
    • 学会等名
      42nd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 非観測領域における生体画像情報の統計的再構成2021

    • 著者名/発表者名
      中尾 恵
    • 学会等名
      第60回日本生体医工学大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 下顎骨再建に重要な特徴量群抽出に基づく手術計画モデルの生成2021

    • 著者名/発表者名
      永井 一希, 中尾 恵, 上田 順宏, 今井 裕一郎, 畠中 利英, 桐田 忠昭, 松田 哲也
    • 学会等名
      電子情報通信学会技術報告 (MI)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 下顎骨再建計画に重要な特徴量の複数医師間の解析2021

    • 著者名/発表者名
      畑山侑介, 永井一希, 中尾 恵, 松田 哲也
    • 学会等名
      電子情報通信学会技術報告 (MI)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 外科教育の深化に貢献する VR/AR/XAI 技術2021

    • 著者名/発表者名
      中尾 恵
    • 学会等名
      VR医学セミナー
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Enumerated sparse extraction of important surgical planning features for mandibular reconstruction2020

    • 著者名/発表者名
      K. Nagai, M. Nakao, N. Ueda, Y. Imai, T. Kirita, T. Matsuda
    • 学会等名
      Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] スパース生体モデリングと治療支援画像生成2020

    • 著者名/発表者名
      中尾 恵
    • 学会等名
      日本医学物理学会学術大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 下顎骨再建術を対象とした手術計画に重要な特徴量抽出手法の提案2020

    • 著者名/発表者名
      永井 一希, 中尾 恵, 上田 順宏, 今井 裕一郎, 桐田 忠昭, 松田 哲也
    • 学会等名
      電子情報通信学会技術報告 (MI)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Deep learningによるCT画像の金属アーチファクト低減法‐下顎再建術前シミュレーションへの応用-2019

    • 著者名/発表者名
      上田 順宏, 今井 裕一郎, 中尾 恵, 今西 勁峰, 山川 延宏, 柳生 貴裕, 松田 哲也, 桐田 忠昭
    • 学会等名
      第64回日本口腔外科学会総会・学術大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Assessment of facial asymmetry after mandibular reconstruction with free fibula flap using computer-aided design2019

    • 著者名/発表者名
      N. Ueda, M. Nakao, N. Yamakawa, Y. Nakagawa, Y. Imai, T. Matsuda, T. Kirita
    • 学会等名
      7th WORLD CONGRESS of the International Academy of Oral Oncology
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] CycleGANを用いたCT画像における金属アーチファクト低減法2019

    • 著者名/発表者名
      中尾 恵, 今西 勁峰, 上田 順宏, 今井 裕一郎, 桐田 忠昭, 松田 哲也
    • 学会等名
      電子情報通信学会技術報告 (MI)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Lasso解列挙による下顎骨再建計画に重要な特徴量の抽出2019

    • 著者名/発表者名
      永井 一希, 中尾 恵, 上田 順宏, 今井 裕一郎, 畠中 利英, 松田 哲也
    • 学会等名
      第63回システム制御情報学会 研究発表講演会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 京都大学大学院医学研究科 人間健康科学系専攻 知能医工学分野

    • URL

      https://ibme.hs.med.kyoto-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [備考] 京都大学大学院 医学研究科 人間健康科学系専攻 知能医工学分野

    • URL

      https://ibme.hs.med.kyoto-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] Research Home

    • URL

      http://www.bme.sys.i.kyoto-u.ac.jp/~meg/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2025-01-30  

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