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魚類椎骨を対象とした数理解析と実験による骨の形態形成メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 19J11643
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
審査区分 小区分44040:形態および構造関連
研究機関大阪大学

研究代表者

坂下 美咲  大阪大学, 生命機能研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2019-04-25 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2020年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2019年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードトポロジー最適化 / 硬骨魚類 / 椎骨 / 組織染色 / 骨芽細胞 / 破骨細胞 / 成長 / 形態形成 / 3D形態 / コンピュータシミュレーション / 形態計測 / マイクロCT / 運動
研究開始時の研究の概要

本研究の目的は,骨の多様な形態が形成されるメカニズムを骨に加わる外力に基づいて理解することである.研究対象の魚類の椎骨は側面の形態が種によって異なる.観察から,これらの形態は各魚種の遊泳法との関連が予想された.そこで,外力依存的に形態を生成する数理モデルを構築し,現在までに一部の形態が再現できた.研究期間中はより多種の形態を正確に再現するため,数理モデルの改良に必要な生物的要因を実験から明らかにする.加えて,椎骨の構造強度解析と変異体を用いた遺伝子操作実験により,椎骨の形態と外力の関連を調べ,数理モデルを検証する.改良した数理モデルを用いて,異なる形態に共通の形成メカニズムを明らかにする.

研究実績の概要

本研究では,骨の多様な形態がつくられるメカニズムを,骨に加わる外力に基づき明らかにすることを目指している.研究対象の硬骨魚類の椎骨は,内部が種間で共通の砂時計型であるのに対して,外部の側面は種によって異なる多様な形を示す.比較形態観察から,これらの側面構造の多様性は各魚種の遊泳法との関連が予想された.このため,トポロジー最適化という外力依存的に構造が生成できる理論を用いて,椎骨の形態再現を試みた.

前年度は,様々な荷重条件下でトポロジー最適化を実行し,それぞれの荷重に対して剛性の高い構造を生成した.これにより,魚類椎骨の多様な側面構造を複数再現することに成功した.本年度は,椎骨内部の砂時計型を定義するパラメータ値の違いによって,最適化結果が異なる側面構造を生成することがわかった.この側面構造の違いが,実際の椎骨の形態の違いと同様であったことから,本研究で構築した数理モデルの妥当性が検証できた.本年度ではこの結果を論文にまとめ,現在査読中である.

加えて前年度は,マイクロCTによる構造観察から,椎骨が中心から放射方向に付加成長していると予想された.これを踏まえて本年度は,組織染色を用いて,骨形成に関わる細胞活動を調べた.結果,骨芽細胞が側面構造の末端に分布していることが示唆された.また,破骨細胞が,側面構造にある空洞の表面に局在することも示唆された.このことから,椎骨は付加成長しつつ,椎骨の中心部から骨が削られていると考えられる.同様の形成過程はトポロジー最適化によるシミュレーションでも見られたことから,魚類椎骨が外力に適応してつくられることが推測された.また,組織観察の結果に基づいて,トポロジー最適化に骨成長の異方性を導入し,生成される構造に違いが見られることを確認した.改良したモデルは,より多くの椎骨の形態を説明できる可能性があるため,今後も解析を継続していく.

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2019

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Comparative morphological examination of vertebral bodies of teleost fish using high‐resolution micro‐CT scans2019

    • 著者名/発表者名
      Sakashita Misaki、Sato Mao、Kondo Shigeru
    • 雑誌名

      Journal of Morphology

      巻: 280 号: 6 ページ: 778-795

    • DOI

      10.1002/jmor.20983

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] トポロジー最適化を用いた数理モデルによる魚類椎骨の多様な形態の再現2019

    • 著者名/発表者名
      坂下 美咲、山﨑 慎太郎、矢地 謙太郎、近藤 滋
    • 雑誌名

      設計工学・システム部門講演会講演論文集

      巻: 2019.29 号: 0 ページ: 2108

    • DOI

      10.1299/jsmedsd.2019.29.2108

    • NAID

      130007836144

    • ISSN
      2424-3078
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] トポロジー最適化を用いた数理モデルによる魚類椎骨の多様な形態の再現2019

    • 著者名/発表者名
      坂下美咲,山﨑慎太郎,矢地謙太郎,近藤滋
    • 学会等名
      日本機械学会第29回設計工学・システム部門講演会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] トポロジー最適化を用いて魚類椎骨の異なる形態を外力に基づき説明する2019

    • 著者名/発表者名
      坂下美咲,山﨑慎太郎,矢地謙太郎,近藤滋
    • 学会等名
      2019年度日本数理生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 魚類椎骨のマイクロCTを用いた観察に基づく形態形成メカニズムの数理モデル化2019

    • 著者名/発表者名
      坂下美咲,佐藤真央,山﨑慎太郎,矢地謙太郎,近藤滋
    • 学会等名
      第39回日本骨形態計測学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] マイクロCTによる構造観察とトポロジー最適化に基づいた魚類椎骨の形態を形成する数理モデル2019

    • 著者名/発表者名
      坂下美咲,山﨑慎太郎,矢地謙太郎,近藤滋
    • 学会等名
      第24回計算工学講演会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2019-05-29   更新日: 2024-03-26  

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