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植物プランクトンの新たな光利用:ロドプシンによるエネルギー生産機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19J21582
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関東京大学

研究代表者

長谷川 万純  東京大学, 新領域創成科学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2019-04-25 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2021年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2020年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2019年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワード植物プランクトン / ロドプシン / 光合成 / 光エネルギー
研究開始時の研究の概要

一次生産者として重要な役割を担う植物プランクトンが太陽光を利用する機構は、永らく、クロロフィル色素による光合成のみであると考えられてきた。しかし、近年の遺伝子解析技術の発展に伴い、海洋性真核植物プランクトンから、光合成とは異なる光受容体遺伝子(ロドプシン)が次々に発見されている。これらのロドプシンの多くは、機能の分からない未知ロドプシンであり、加えて植物プランクトンの細胞内のどこで働くかも分かっていない。
本研究では、海洋性真核植物プランクトンの中でもゲノムが解読されている褐虫藻に着目し、ロドプシンの機能と利用波長および局在を調べることによるロドプシンの生理的役割の解明を目的とする。

研究実績の概要

本研究は、光合成を行い、重要な一次生産者として特に水圏生態系を支える植物プランクトンにおける、光合成とは異なる光利用機構であるロドプシンの機能の網羅的解析と、植物プランクトンがロドプシンを持つ生理的役割の解明を目的としている。本年度は、光合成を行う原核生物であるシアノバクテリアと、真核生物である褐虫藻由来のロドプシンの解析を試み、シアノバクテリア由来のロドプシンについて、大きな進展があった。本年度の実施内容は、以下の通りである。
1.シアノバクテリア由来ロドプシンの系統解析:シアノバクテリアのゲノム、メタゲノムおよびメタゲノム配列から再構築されたゲノム情報からロドプシン遺伝子を探索し、複数のロドプシンに類似な配列を取得した。それらの配列の膜貫通性を予測し、ロドプシンの特徴である7回膜貫通の配列を選別した。これらの配列と機能既知ロドプシンの配列を用いて系統解析を行ったところ、シアノバクテリアに特異的な新規ロドプシンクレードを発見した。
2.シアノバクテリア由来新規ロドプシンの機能解析および分光解析:発見した新規クレードに属するシアノバクテリア由来ロドプシンの機能を、異種発現解析とにより明らかにした。また、ロドプシンタンパク質を精製し、詳細な分光学的解析を行うことで、その利用波長や分光学的特性を明らかにした。
3.シアノバクテリアの生息環境とロドプシンの関係の解明:シアノバクテリア由来ロドプシンの機能と利用波長、およびロドプシンをもつシアノバクテリアの生息環境の情報から、シアノバクテリアがロドプシンを持つ意義を微生物生態学的に考察した。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Lokiarchaeota archaeon schizorhodopsin-2 (LaSzR2) is an inward proton pump displaying a characteristic feature of acid-induced spectral blue-shift2020

    • 著者名/発表者名
      Kojima Keiichi、Yoshizawa Susumu、Hasegawa Masumi、Nakama Masaki、Kurihara Marie、Kikukawa Takashi、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 20857-20857

    • DOI

      10.1038/s41598-020-77936-9

    • NAID

      120006955824

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A unique clade of light-driven proton-pumping rhodopsins evolved in the cyanobacterial lineage2020

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa Masumi、Hosaka Toshiaki、Kojima Keiichi、Nishimura Yosuke、Nakajima Yu、Kimura-Someya Tomomi、Shirouzu Mikako、Sudo Yuki、Yoshizawa Susumu
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 16752-16752

    • DOI

      10.1038/s41598-020-73606-y

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evolution-inspired design of multicolored photoswitches from a single cyanobacteriochrome scaffold2020

    • 著者名/発表者名
      Fushimi Keiji、Hasegawa Masumi、Ito Takeru、Rockwell Nathan C.、Enomoto Gen、-Win Ni-Ni、Lagarias J. Clark、Ikeuchi Masahiko、Narikawa Rei
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 117 号: 27 ページ: 15573-15580

    • DOI

      10.1073/pnas.2004273117

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 褐虫藻の光利用:Symbiodiniaceae科褐虫藻ロドプシンの探索と機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      長谷川万純、小島慧一、中尾新、西村陽介、須藤雄気、吉澤晋
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第34回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 海表面マイクロ層 (SML) に生息する海洋微生物の光防御システムの解明2021

    • 著者名/発表者名
      髙田真子、藤原敬允、長谷川万純、吉澤晋
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第34回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 海洋細菌が保有するロドプシンのアンテナ機構の検証2021

    • 著者名/発表者名
      藤原敬允、長谷川万純、吉澤晋
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第34回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアの光合成とは異なる光利用:シアノロドプシンの発見2020

    • 著者名/発表者名
      長谷川万純、西村陽介、吉澤晋
    • 学会等名
      日本地球化学会 第67回オンライン大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Functional and spectroscopic analyses of novel cyanobacterial rhodopsins2019

    • 著者名/発表者名
      Masumi Hasegawa, Keiichi Kojima, Yosuke Nishimura, Yu Nakajima, Yuki Sudo, Susumu Yoshizawa
    • 学会等名
      2019 ESP-IUPB World Congress
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ロドプシンから探るシアノバクテリアの多様な光利用2019

    • 著者名/発表者名
      長谷川万純、西村陽介、吉澤晋
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第33回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 褐虫藻Symbiodinium minutum由来のロドプシン遺伝子の探索と機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      長谷川万純、西村陽介、吉澤晋
    • 学会等名
      2019 年日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Second mechanism of cyanobacterial light utilization: Phylogenetic and functional analyses of cyanobacterial rhodopsins2019

    • 著者名/発表者名
      Masumi Hasegawa, Yosuke Nishimura, Susumu Yoshizawa
    • 学会等名
      3rd Joint symposium on Integrated Bioscience between Zhejiang University and the University of Tokyo
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ゲノム情報を用いたシアノバクテリア由来ロドプシンの系統・機能・分光解析2019

    • 著者名/発表者名
      長谷川万純、小島慧一、西村陽介、中島悠、須藤雄気、吉澤晋
    • 学会等名
      藍藻の分子生物学2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 光合成微生物“シアノバクテリア”の新たな光エネルギー利用機構 ーシアノロドプシンの発見ー

    • URL

      https://www.aori.u-tokyo.ac.jp/research/topics/2020/20201030.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-05-29   更新日: 2024-03-26  

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