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計算-実験統合型アプローチによる含窒素ヘテロ環式化合物の酵素的合成法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 19J23697
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
審査区分 小区分38030:応用生物化学関連
研究機関静岡県立大学

研究代表者

本山 智晴  静岡県立大学, 薬食生命科学総合学府, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2019-04-25 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2021年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2020年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2019年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードTDH / KBL / Cupriavidus necator / EDMP / Pyrazine synthesis / L-threonine / 含窒素ヘテロ環式化合物 / ピラジン / 3-エチル-2,5-ジメチルピラジン / L-スレオニン / L-スレオニン脱水素酵素 / 2-アミノ-3-ケトブチル酸CoAリガーゼ / ピラジン化合物 / X線結晶構造解析
研究開始時の研究の概要

生物に広く存在し、香料や医薬品でもあるピラジン化合物は、非酵素的に産生されると考えられていた。しかし、いくつかの細菌において、ピラジン生合成経路の存在が示唆されている。その生合成経路に関わる酵素を同定・応用利用することができれば、酵素法によりピラジンなどの含窒素ヘテロ環式化合物を合成することが可能になる。
申請者は、短鎖型L-スレオニン脱水素酵素 (TDH) に加え、新たにピラジン合成酵素 (PyrS) を複数の細菌のゲノム上に見出し、PyrSがTDHの代謝物からピラジンを合成することを発見した。そこで本研究では、これら酵素を組み合わせて含窒素ヘテロ環式化合物の酵素的合成法の確立を目指す。

研究実績の概要

Cupriavidus necator由来L-threonine 3-dehydrogenase (CnTDH) および2-amino-3-ketobutyrate CoA ligase (CnKBL) が関与する、L-Thrを起点とした3-ethyl-2,5-dimethylpyrazine (EDMP) 合成機構の解明およびその知見をもとにしたピラジンの化学酵素的合成を目指した研究を行った。2021年度は、1. 二機能性を有するCnKBLの反応速度論解析、2. CnKBLのX線結晶構造解析による二機能性の起源の解明、3. TDHとKBLが関与するL-Thrを起点としたEDMP合成機構の推定、4. 化学酵素的に合成されるEDMPの収率の決定、5. 一連の研究から得られた知見をもとにした多様なピラジンの化学酵素的合成を行った。
今年度の研究およびこれまでの研究成果を総合することで、L-Thrを起点とするEDMP合成機構の解明および多様なピラジンの化学酵素的合成に成功した。さらに、他の生物種由来のKBLもCnKBLと同様にKBL活性とTA活性の二機能性を有していることを確認しているため、TDHとKBLが関与するEDMP合成機構は、tdhおよびkbl遺伝子が保存されている生物種において共通する機構であると考えられる。以上の研究成果は、申請者が筆頭著者としてCommunications Chemistry誌に発表済みである。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Chemoenzymatic synthesis of 3-ethyl-2,5-dimethylpyrazine by L-threonine 3-dehydrogenase and 2-amino-3-ketobutyrate CoA ligase/L-threonine aldolase2021

    • 著者名/発表者名
      3)Motoyama T., Nakano, S., Hasebe F., Miyata, R., Kumazawa, S., Miyoshi, N., and Ito, S.
    • 雑誌名

      Communications Chemistry

      巻: 4 ページ: 108-108

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Protein Sequence Selection Method That Enables Full Consensus Design of Artificial l-Threonine 3-Dehydrogenases With Unique Enzymatic Properties2020

    • 著者名/発表者名
      Motoyama T., Hiramatsu N., Asano Y., Nakano S., Ito S.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 59 号: 40 ページ: 3823-3833

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.0c00570

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] L-スレオニンを起点とするピラジン生合成機構の解明とその応用2021

    • 著者名/発表者名
      本山智晴、中野祥吾、長谷部文人、宮田椋、熊澤茂則、三好規之、伊藤創平
    • 学会等名
      日本生物工学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Chemoenzymatic reaction to synthesize alkylpyrazines from metabolites of L-threonine2021

    • 著者名/発表者名
      Motoyama Tomoharu, Nakano Shogo, Hasebe Fumihito, Miyoshi Noriyuki, Ito Sohei
    • 学会等名
      Pacifichem
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] L-アミノ酸を起点とするピラジン合成酵素群の発見とその解析2019

    • 著者名/発表者名
      本山智晴、中野祥吾、山本雄大、常盤広明、浅野泰久、伊藤創平
    • 学会等名
      第71回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Elucidation of product release mechanism associated with structural changes in L-threonine 3-dehydrogenase2019

    • 著者名/発表者名
      Tomoharu Motoyama, Shogo Nakano, Yuta Yamamoto, Hiroaki Tokiwa, Yasuhisa Asano, Sohei Ito
    • 学会等名
      ACS Fall 2019 National Meeting & Exposition
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2019-05-29   更新日: 2024-03-26  

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