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リボソーム不活性化タンパク質を網羅的かつ強力に阻害する新規薬剤の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19K05699
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関東邦大学

研究代表者

齋藤 良太  東邦大学, 理学部, 教授 (90327974)

研究分担者 後藤 勝  東邦大学, 理学部, 准教授 (80379289)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2021年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードpterin-7-carboxamide / リシン毒素A鎖阻害剤 / X線結晶構造解析 / プテリン / リシン毒素 / 阻害剤 / リシン毒素A鎖 / リボソーム不活性化タンパク質 / 毒素タンパク質 / リシン / リボソーム不活性化タンパク質阻害剤
研究開始時の研究の概要

本研究は、致死性中毒を引き起こすリボソーム不活性化タンパク質 (RIP) を網羅的に阻害する世界初の解毒剤の開発を目的としている。具体的には、トウゴマ種子由来リシンを標的とし、申請者が見出した高阻害活性化合物との相互作用をX線結晶構造解析によって明らかにする。そして得られた構造情報を基に、さらに高活性が期待される化合物を設計・合成し、それらの活性ならびに酵素複合体の立体構造を明らかにする。そして、高いリシン阻害活性を示した化合物について、リシンと同一の活性部位構造を有する他のRIPに対する阻害活性評価も行う。

研究成果の概要

L-フェニルアラニン、L-チロシン及びこれらの誘導体で修飾したプテリン-7-カルボキサミドを阻害剤としてRTAに取り込ませると、2分子の阻害剤がRTAの一次ポケットと二次ポケットに1つずつ取り込まれることを明らかにした。一方、トリペプチド含有プテリン-7-カルボキサミドを阻害剤に用いた場合、プテリン環が一次ポケットと強く相互作用するだけでなく、Lysの側鎖末端の芳香環部分が二次ポケットに取り込まれていることが分かった。詳細な構造解析により、RTAのTyr80及びAsn122のコンフォーメーション変化ならびにAsn78との相互作用が、二次ポケットへの阻害剤取り込みの引き金となることがわかった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、リシン毒素A鎖(RTA)活性部位中の2つのポケットを同時に塞ぐ有機小分子阻害剤を初めて開発した。さらに、2つのポケットを塞ぐために必要な阻害剤ならびにタンパク質の構造情報も明らかにした。これらの化合物が高いRTA阻害活性を示したことから、これまで未解明であった学術的な問い「高RTA阻害活性化合物の開発に必要不可欠な構造情報」に対して世界で初めて明確な解答を出すことができた。されに、本研究の成果によって、RTA阻害剤の開発が飛躍的に発展するだけでなく、RTAと同じ作用機序で毒性を発現する毒素タンパク質が関わるすべての中毒の治療薬開発の飛躍的な発展に繋がると考えられる。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] Pterin-based small molecule inhibitor capable of binding to the secondary pocket in the active site of ricin-toxin A chain2022

    • 著者名/発表者名
      Saito Ryota、Goto Masaru、Katakura Shun、Ohba Taro、Kawata Rena、Nagatsu Kazuki、Higashi Shoko、Kurisu Kaede、Matsumoto Kaori、Ohtsuka Kouta
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 17 号: 12 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0277770

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Conformational change in ricin toxin A-Chain: A critical factor for inhibitor binding to the secondary pocket2022

    • 著者名/発表者名
      Goto Masaru、Higashi Shoko、Ohba Taro、Kawata Rena、Nagatsu Kazuki、Suzuki Saori、Anslyn Eric V.、Saito Ryota
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 627 ページ: 1-4

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.08.008

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Differential DNA-binding and cofactor recruitment are possible determinants of the synthetic steroid YK11-dependent gene expression by androgen receptor in breast cancer MDA-MB 453?cells2022

    • 著者名/発表者名
      Kanno Yuichiro、Saito Nao、Saito Ryota、Kosuge Tomohiro、Shizu Ryota、Yatsu Tomofumi、Hosaka Takuomi、Nemoto Kiyomitsu、Kato Keisuke、Yoshinari Kouichi
    • 雑誌名

      Experimental Cell Research

      巻: 419 号: 2 ページ: 113333-113333

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2022.113333

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] リシン毒素A鎖のコンフォーメーション変化:活性部位に隣接する二次ポケットへの阻害剤取込みを可能にする重要因子2023

    • 著者名/発表者名
      後藤勝・河田麗菜・永津和輝・片倉駿・栗栖楓・東翔子・齋藤良太
    • 学会等名
      第20回ホスト-ゲスト・超分子化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 2位に水素結合性アロイル基を導入した Botryllazine B類の合成とアルドース還元酵素阻害活性2023

    • 著者名/発表者名
      川田純奈 ・後藤勝 ・齋藤良太
    • 学会等名
      第103日本化学会春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 2位をアリールスルホニル基及びアリールスルフィニル基で修飾した Botryllazine B 類縁体の合成とアルドース還元酵素阻害活性2023

    • 著者名/発表者名
      白井祐生 ・後藤勝 ・齋藤良太
    • 学会等名
      第103日本化学会春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 4位及び4,5位にアルキル基を有する新規3-ヒドロキシチアゾール-2(3H)チオン類及びそれらの亜鉛錯体の合成とインスリン様活性2022

    • 著者名/発表者名
      大庭麟太郎・吉川豊・内藤行喜・安井裕之・齋藤良太
    • 学会等名
      第51回複素環化学討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Botryllazine B誘導体のアルドース還元酵素阻害に関する構造活性相関: 2-ベンゾイル基上の置換基効果2022

    • 著者名/発表者名
      川田純奈・後藤勝・齋藤良太
    • 学会等名
      日本化学会第102春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] フタルイミドで修飾したアミノ酸残基を末端に有するトリペプチド含有プテリン誘導体のリシン毒素 A 鎖阻害能評価2021

    • 著者名/発表者名
      栗栖 楓・坂本 奈津美・東 翔子・後藤 勝・齋藤 良太
    • 学会等名
      第50回複素環化学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] リシンAサブユニット新規阻害剤の結合メカニズム2021

    • 著者名/発表者名
      大庭 太郎・栗栖 楓・坂本 奈津美・東 翔子・齋藤 良太・後藤 勝
    • 学会等名
      2021年度日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] トリペプチド側鎖を有する新規プテリン-7-カルボキサミド類の合成とリシン毒素A鎖阻害活性評価2020

    • 著者名/発表者名
      片倉駿, 東翔子, 後藤勝, 齋藤良太
    • 学会等名
      第10回CSJ化学フェスタ
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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