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構造予測及び活性測定系による双方向アプローチを基盤とした革新的HBV阻害薬の探索

研究課題

研究課題/領域番号 19K05734
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
研究機関大阪大学

研究代表者

大崎 恵理子  大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (50447801)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2021年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードB型肝炎ウイルス / ポリメラーゼ / 逆転写酵素 / 立体構造解析 / スクリーニング / 非核酸系RT阻害剤 / 核酸アナログ / HBV / polymerase / RT / NNRTI / ドッキングシミュレーション / 非核酸系RT阻害剤阻害剤 / 立体構造予測 / モデル解析
研究開始時の研究の概要

研究代表者はB型肝炎ウイルスのポリメラーゼ活性に重要なRTドメインの高純度精製,および精製RTを用いた特異的活性測定系の確立に成功し,スクリーニングにより多数のRT阻害候補薬剤を同定した。本研究では候補阻害剤とRTとの相互作用について,立体構造予測に基づくドッキングシミュレーションにより解析し,作用機序の解明および複数の薬剤の組み合わせによる高活性阻害剤の設計を行う。さらには活性測定システムにより,シミュレーションで得られた候補阻害薬剤との相互作用を実際に検証し最適化することで,耐性変異のすきを与えずに迅速・顕著なウイルス排除を可能とするような,これまでにない画期的治療薬の創出を目指す。

研究成果の概要

本研究ではB型肝炎ウイルス(HBV)のポリメラーゼの逆転写酵素(RT)ドメインの予測分子モデルを作製し,構造に基づくin silicoスクリーニングにより,RTとの結合親和性の高い化合物の探索を試みた。得られたヒット化合物について,高純度精製RTを用いたin vitroアッセイ系により阻害効果を評価したところ,実際に阻害効果を示す化合物の同定に成功した。さらにドッキングシミュレーションにより結合部位を予測し,化合物の組み合わせを検討したところ,併用による相加的・相乗的阻害効果が得られたことから,期待以上の予測精度で候補薬剤の絞り込みに成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

B型肝炎ウイルス(HBV)の持続感染者は,2019年の推計では世界で約3億人の持続感染者が存在し年間約89万人が死亡しており,治療薬開発は重要な課題である。薬剤開発において標的分子の立体構造データは必須であるが, HBVポリメラーゼの立体構造はウイルス発見から約60年近く経過した今なお解かれていない。本研究により予測分子モデルおよびシミュレーションの精度が期待以上に高いことが示唆され,薬剤探索の有用なツールとなることが示唆された。また,逆転写酵素(RT)ドメインの結晶化に世界で初めて成功し,立体構造の完全解明の日も近く,本研究の成果が薬剤開発の情報基盤の構築に貢献するものと確信する。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 1件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (6件) 図書 (5件)

  • [雑誌論文] 立体構造を基盤としたHBVポリメラーゼ阻害剤の開発2022

    • 著者名/発表者名
      大﨑恵理子,上田啓次
    • 雑誌名

      Medical Science Digest

      巻: 47 ページ: 752-754

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Chronic Hepatitis B Treatment Strategies Using Polymerase Inhibitor-Based Combination Therapy2021

    • 著者名/発表者名
      Ohsaki Eriko、Suwanmanee Yadarat、Ueda Keiji
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 13 号: 9 ページ: 1-10

    • DOI

      10.3390/v13091691

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 新型コロナウイルスに対する畜産動物の感受性に関する文献考察2021

    • 著者名/発表者名
      水野信哉, 大﨑恵理子
    • 雑誌名

      アグリバイオ

      巻: 1 ページ: 94-97

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Molecular and Cellular Interactions Between the Host and Herpesviruses2021

    • 著者名/発表者名
      Eriko Ohsaki, Keiji Ueda
    • 雑誌名

      Frontiers

      巻: 11 ページ: 21-28

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Screening and Evaluation of Novel Compounds against Hepatitis B Virus Polymerase Using Highly Purified Reverse Transcriptase Domain2020

    • 著者名/発表者名
      Ohsaki Eriko、Ueda Keiji
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 12 号: 8 ページ: 840-840

    • DOI

      10.3390/v12080840

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Impact of the interaction of hepatitis B virus with mitochondria and associated proteins.2020

    • 著者名/発表者名
      Hossain MG, Akter S, Ohsaki E, Ueda K.
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 12 号: 2 ページ: 1-15

    • DOI

      10.3390/v12020175

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書 2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of a Precore-Defective Hepatitis B Virus Genotype D2 Strain Isolated in Bangladesh2020

    • 著者名/発表者名
      Hossain Md Golzar、Mahmud Md Muket、Rahman Md Arifur、Akter Sharmin、Nazir K. H. M. Nazmul Hussain、Saha Sukumar、Wada Masami、Ohsaki Eriko、Honda Tomoyuki、Ueda Keiji
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 9 号: 11

    • DOI

      10.1128/mra.00083-20

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Establishment of a system for finding inhibitors of ε RNA binding with the HBV polymerase2020

    • 著者名/発表者名
      Liu Xiao‐Quan、Ohsaki Eriko、Ueda Keiji
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 25 号: 8 ページ: 523-537

    • DOI

      10.1111/gtc.12778

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Interplay Between KSHV and the Host DNA Damage Response2020

    • 著者名/発表者名
      Ohsaki Eriko、Ueda Keiji
    • 雑誌名

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      巻: 10 ページ: 604351-604351

    • DOI

      10.3389/fcimb.2020.604351

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of a Pre-core-Defective Hepatitis B Virus Genotype D2 Strain Isolated in Bangladesh2020

    • 著者名/発表者名
      Md. Golzar Hossain, Md Muket Mahmud, Md. Arifur Rahman, Sharmin Akter, K.H.M. Nazmul Nazir, Sukumar Saha, Masami Wada, Eriko Ohsaki, Tomoyuki Honda, and Keiji Ueda
    • 雑誌名

      The American Society for Microbiology

      巻: 9 ページ: 303-349

    • DOI

      10.1016/b978-0-12-374153-0.00015-1

    • ISBN
      9780123741530
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] B型肝炎ウイルスポリメラーゼ阻害剤のスクリーニングと薬剤評価2022

    • 著者名/発表者名
      Eriko Ohsaki, Kazuhiro Murai, Hayato Hikita, Masami Wada, Keiji Ueda
    • 学会等名
      第69回日本ウイルス学会 学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] UPF1もしくはStaufen1を介した細胞内因性RNA分解機構は,HBV RNAの安定性を介してウイルス複製を制御する2022

    • 著者名/発表者名
      Masami Wada, Eriko Ohsaki, Keiji Ueda
    • 学会等名
      第69回日本ウイルス学会 学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 1.Virtual screening and docking analysis of hits with the reverse transcriptase domain of HBV polymerase.2021

    • 著者名/発表者名
      Eriko Ohsaki, Yadarat Suwanmanee, Masami Wada, Keiji Ueda
    • 学会等名
      第68回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 2.Regulation of HBV RNAs by nonsense-mediated mRNA decay pathway controls viral replication.2021

    • 著者名/発表者名
      Masami Wada, Eriko Ohsaki, Keiji Ueda.
    • 学会等名
      第68回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Evaluation of novel candidate NNRTIs against Hepatitis B virus2019

    • 著者名/発表者名
      Eriko Ohsaki, Yadarat Suwanmanee, Keiji Ueda
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会 学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Novel non-nucleo(s)tide RT inhibitor candidates reducing HBV DNA amplification.2019

    • 著者名/発表者名
      Eriko Ohsaki, Yadarat Suwanmanee, Keiji Ueda
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] 新型コロナウイルスに対する畜産動物の感受性に関する文献考察 アグリバイオ2021年1月号2021

    • 著者名/発表者名
      水野信哉, 大﨑恵理子
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      北隆館 ニュー・サイエンス社
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Liver Diseases-A Multidisciplinary Textbook2020

    • 著者名/発表者名
      Mizuno S, Ohsaki E.
    • 総ページ数
      10
    • 出版者
      Springer Nature Switzerland
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] 低温医学と冬眠科学をつなぐ増殖因子の役割 アグリバイオ2020年1月号2020

    • 著者名/発表者名
      水野信哉, 大﨑恵理子
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      北隆館 ニュー・サイエンス社
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Molecular Basis of Fibrogenesis and Angiogenesis During Chronic Liver Disease: Impact of TGF-β and VEGF on Pathogenic Pathways: Liver Diseases-A Multidisciplinary Textbook2020

    • 著者名/発表者名
      S. Mizuno, E. Ohsaki
    • 総ページ数
      10
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9783030244316
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] 低温医学と冬眠科学をつなぐ増殖因子の役割: アグリバイオ2020年1月号2020

    • 著者名/発表者名
      水野信哉, 大﨑恵理子
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      北隆館 ニュー・サイエンス社
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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