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α-ヒドロキシ酸を利用した微生物による有用ペプチド生産系の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19K05821
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分38030:応用生物化学関連
研究機関早稲田大学 (2023)
国立研究開発法人理化学研究所 (2019-2022)

研究代表者

大竹 和正  早稲田大学, 理工学術院, 助教 (80593631)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2019年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード応用生物化学 / タンパク質工学 / バイオテクノロジー / 微生物工学 / 非天然型アミノ酸 / 人工アミノ酸 / 拡張遺伝暗号
研究開始時の研究の概要

申請者らはタンパク質工学と改変型微生物の融合により、微生物生体内で非天然型アミノ酸導入タンパク質を高効率で生産することを可能としている。
本課題ではこの手法を拡張し、微生物と非天然型アミノ酸誘導体を利用した有用ペプチドの高効率な生産系の確立を第一の目標とする。また、簡便で低コストな生産系を実現するため、微生物自身が非天然型アミノ酸誘導体を産生できるように改変することを第二の目標とする。

研究実績の概要

申請者らはタンパク質工学と改変型微生物の融合により、微生物生体内で非天然型アミノ酸導入タンパク質を高効率で生産することを可能としてきた。
本課題ではこの手法を拡張し、微生物と非天然型アミノ酸誘導体を利用した有用ペプチドの高効率な生産系の確立を第一の目標とする。また、簡便で低コストな生産系を実現するため、微生物自身が非天然型アミノ酸誘導体を産生できるように改変することを第二の目標とする。
本研究課題では、申請者らが保持するα-ヒドロキシ酸(AHA)特異的改変型酵素や大腸菌コドン再定義株などのタンパク質工学、合成生物学的な知見や技術に代謝工学的観点からのアプローチを取り入れることにより、安価な化合物から細胞内のマシーナリーを用いて有用ペプチドを効率的に生産する系を開発することを目的とする。第一段階として非天然型の側鎖をもつAHAであるAlocLysOHと組換えタンパク質発現・精製手法を利用し通常は細菌で生産することが困難な抗菌性ペプチドの生産系の構築を目指している。大腸菌コドン再定義株を用いたAlocLysOHの導入法については確立している。具体的な抗菌ペプチドのターゲットを選定
し、発現コンストラクトについても複数のパターンを設定して検討を行った。ペプチド-キャリアタンパク質の融合体を封入体として発現し、可溶化、塩基性条件下での切断、ニッケルカラムによるキャリアタンパク質除去を行い精製ペプチドを得る手法について一定の目処がついた。修飾ペプチドを含む他種のペプチドにも応用すべく展開を検討中である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

COVID-19の影響及び研究代表者の研究箇所の移転により研究計画に遅れが出ている。
また、当初の研究計画のうちAHA導入酵素の改変並びにペプチド発現コンストラクトについては当初想定していた計画の変更を余儀なくされたため遅延に繋がっている。

今後の研究の推進方策

大腸菌とAlocLysOHを用いたペプチド生産系を確立し、修飾ペプチドも含め生産できるペプチド種を増やしていきたい。
AHA導入酵素の改変についても異なるアプローチにより実現可能性を引き続き模索する。

報告書

(5件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2019

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (3件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Correlation between in vitro and in vivo gene-expression strengths is dependent on bottleneck process2024

    • 著者名/発表者名
      Toshihiko Enomoto, Kazumasa Ohtake, Naoko Senda, and Daisuke Kiga
    • 雑誌名

      New Generation Computing

      巻: -

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Site‐specific photo‐crosslinking/cleavage for protein?protein interface identification reveals oligomeric assembly of lysosomal‐associated membrane protein type 2A in mammalian cells2023

    • 著者名/発表者名
      Terasawa Kazue、Seike Tatsuro、Sakamoto Kensaku、Ohtake Kazumasa、Terada Tohru、Iwata Takanori、Watabe Tetsuro、Yokoyama Shigeyuki、Hara‐Yokoyama Miki
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 32 号: 12

    • DOI

      10.1002/pro.4823

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The two domain architecture of LAMP2A regulates its interaction with Hsc702022

    • 著者名/発表者名
      Yuta Ikami, Kazue Terasawa, Kensaku Sakamoto, Kazumasa Ohtake, Hiroyuki Harada Tetsuro Watabe, Shigeyuki Yokoyama, Miki Hara-Yokoyam
    • 雑誌名

      Experimental Cell Research

      巻: 411 号: 1 ページ: 112986-112986

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2021.112986

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] An expanded genetic code facilitates antibody chemical conjugation involving the lambda light chain2021

    • 著者名/発表者名
      Kato Akifumi、Ohtake Kazumasa、Tanaka Yoshitaka、Yokoyama Shigeyuki、Sakamoto Kensaku、Shiraishi Yasuhisa
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 546 ページ: 35-39

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.02.005

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Direct homophilic interaction of LAMP2A with the two-domain architecture revealed by site-directed photo-crosslinks and steric hindrances in mammalian cells2021

    • 著者名/発表者名
      Terasawa Kazue、Kato Yuji、Ikami Yuta、Sakamoto Kensaku、Ohtake Kazumasa、Kusano Seisuke、Tomabechi Yuri、Kukimoto-Niino Mutsuko、Shirouzu Mikako、Guan Jun-Lin、Kobayashi Toshihide、Iwata Takanori、Watabe Tetsuro、Yokoyama Shigeyuki、Hara-Yokoyama Miki
    • 雑誌名

      Autophagy

      巻: 17 号: 12 ページ: 1-19

    • DOI

      10.1080/15548627.2021.1911017

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Variants of the industrially relevant protease KP-43 with suppressed activity under alkaline conditions developed using expanded genetic codes2019

    • 著者名/発表者名
      Osamura Tatsuya、Okuda Mitsuyoshi、Yamaguchi Atsushi、Ohtake Kazumasa、Sakamoto Kensaku、Takimura Yasushi
    • 雑誌名

      Biochemistry and Biophysics Reports

      巻: 17 ページ: 93-96

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2018.12.001

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 非アミノ酸をコード化した遺伝暗号の下での大腸菌進化2023

    • 著者名/発表者名
      坂本健作、大竹和正、芝井厚、古澤力
    • 学会等名
      第45 回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 新型コロナウイルス変異株に対応する次世代型ACE2-Fc 製剤の開発2023

    • 著者名/発表者名
      高田理彩、尾上遥南、鈴木喬 介、石本憲司、大竹和正、坂本健作、吉岡靖雄、中川晋作、樋野展正
    • 学会等名
      第45 回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 非アミノ酸を含む遺伝暗号の開発と大腸菌進化への影響2022

    • 著者名/発表者名
      大竹和正
    • 学会等名
      第16回無細胞生命科学研究会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [産業財産権] タンパク質における別のタンパク質と相互作用する部分の特定方法2023

    • 発明者名
      横山三紀、寺澤和恵、横山茂之、坂本健作、大竹和正
    • 権利者名
      横山三紀、寺澤和恵、横山茂之、坂本健作、大竹和正
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-098438
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-12-25  

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