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HDACの遺伝的・化学的改変による環境ストレス応答最適化法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19K05960
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分38060:応用分子細胞生物学関連
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

上田 実  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (30632541)

研究分担者 工藤 紀雄  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員 (80632421)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードヒストンアセチル化修飾 / ヒストン脱アセチル化酵素 / HDAC阻害剤 / シロイヌナズナ / 環境ストレス応答 / 環境ストレス耐性強化 / アセチル化修飾 / 環境ストレス耐性強 / ヒストン脱アセチル化酵 / HDA19 / 稔性回復 / ケミカルスクリーニング / 環境ストレス耐性 / ケミカルデザイン / 人工合成HDAC
研究開始時の研究の概要

結晶構造解析やケミカルスクリーニングにより新規に開発した化合物の利用や、人工的に改変したHDACをコードする遺伝子を利用することで、植物が環境ストレス耐性を保持しつつ、稔性を維持できる手法の開発を目指す。

研究成果の概要

生命の遺伝情報を刻むDNAを折り畳む働きを有するヒストンは、そのN末端で起こるアセチル化等の化学修飾を介して、遺伝子発現を制御する。植物の環境ストレス応答でもその化学修飾を介して重要な役割を果たすことが知られている。代表者はヒストンの脱アセチル化を触媒するHDACの一つ、HDA19の機能抑制がシロイヌナズナの環境ストレス耐性を高めることを見出している。本研究では、HDA19の構造改変によりストレス耐性を高めつつ、結実性低下等の不良形質を回避できることを示した。また、HDA19の酵素活性測定系やクラスI HDAC活性阻害を可視化する系の確立により、HDA19等へ作用する化合物探索を可能とした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

化合物処理という一過的な活性調節は、不稔などの農業上の不良形質の顕出を抑制する効果が期待できる。本研究で確立したin vivoやin vitroでのアッセイ系を利用することで、新規の化合物探索が可能となった、今後はよりオフターゲットの少ない、植物HDACにのみ作用する化合物の探索を進め、より緻密なストレス耐性操作方法の確立が期待できる。また、本研究期間内に国際共同研究も展開できており、HDA19が非ヒストンタンパク質の脱アセチル化修飾にも関与することが示唆されている。更なる解析を進めることで、新規のストレス耐性付与機構の同定が期待できる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] ミュンスター大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] ミュンスター大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Sustained defense response via volatile signaling and its epigenetic transcriptional regulation2022

    • 著者名/発表者名
      Onosato, Haruki; Fujimoto, Genya; Higami, Tomota; Sakamoto, Takuya; Yamada, Ayaka; Suzuki, Takamasa; Ozawa, Rika; Matsunaga, Sachihiro; Seki, Motoaki; Ueda, Minoru; Sako, Kaori; Galis, Ivan; Arimura, Gen-ichiro
    • 雑誌名

      Plant Physiology

      巻: - 号: 2 ページ: 922-933

    • DOI

      10.1093/plphys/kiac077

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Histone modifications form epigenetic regulatory networks to regulate abiotic stress response2020

    • 著者名/発表者名
      Ueda, M. and Seki, M.
    • 雑誌名

      Plant Physiol.

      巻: 182 号: 1 ページ: 15-26

    • DOI

      10.1104/pp.19.00988

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Transcriptome analysis of the hierarchical response of HDAC proteins that respond in an antagonistic manner to salinity stress.2019

    • 著者名/発表者名
      Ueda, M., Matsui, A., Watanabe, S., Kobayashi, M., Saito, K., Tanaka, M., Ishida, J., Kusano, M., Seo, M. and Seki, M.
    • 雑誌名

      Front. Plant Sci.

      巻: 10 ページ: 1323-1323

    • DOI

      10.3389/fpls.2019.01323

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] HDAC阻害剤のシロイヌナズナHDACに対する選択性評価と可視化2022

    • 著者名/発表者名
      上田 実、工藤 紀雄、松井 章浩、中田 明子、田中 真帆、高橋 聡史、石田 順子、佐々木 卓、吉田 稔、関 原明
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Transcriptome characterization of salinity stress response coordinated by histone deacetylase proteins that respond in an antagonistic manner2021

    • 著者名/発表者名
      上田 実、松井 章浩、渡邊 俊介、小林 誠、 斉藤 和季、 田中 真帆、石田 順子、草野 都、瀬尾 光範、関 原明
    • 学会等名
      31st International Conference on Arabidopsis Research
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 相反する塩ストレス応答を担うヒストン脱アセチル化酵素群による階層的制御の解明に向けたトランスクリプトーム解析2021

    • 著者名/発表者名
      上田 実、松井 章浩、渡邊 俊介、小林 誠、 斉藤 和季、 田中 真帆、石田 順子、草野 都、瀬尾 光範、関 原明
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-12-25  

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