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“樹液酵母”とは何か ―好樹液性昆虫との共生関係の解明―

研究課題

研究課題/領域番号 19K06160
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分40010:森林科学関連
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

遠藤 力也  国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 研究員 (90634494)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード酵母生態 / 微生物資源 / 樹液 / MALDI-TOF MS / フルクトース / 共生 / 森林昆虫
研究開始時の研究の概要

“樹液酵母”とは何か、好樹液性昆虫との関係性に着目し、生態・分類の両面からその正体を詳細に解明する。また、広く研究コミュニティで二次利用できるよう分離菌株を公的菌株保存機関へ寄託し、バイオリソースとして整備する。
代表的な樹液酵母について生理生化学的性状、分子系統学的位置を明らかにし、樹液中や樹皮上での増殖能や好樹液性昆虫との生物間相互作用を推定する。その上で、栄養共生や熱共生を念頭に、樹液酵母と好樹液性昆虫の共生関係の解明を目指す。

研究実績の概要

初夏~秋に、コナラやクヌギの樹幹に樹液が滲出している様子はよく観察される。樹液から様々な酵母が分離されることは半世紀以上前から海外で報告されているが、樹液中の酵母(樹液酵母)の存在量について定量的なデータが乏しく、国内で詳細に解析した研究も無い。我が国の森林における「樹液酵母」とは何か解明するため、2019年度には樹液から菌類を分離し菌種の特定と存在量の定量を行った。2020年度は2019年度の結果の再現性を確認する予定だったが、新型コロナウイルス感染症拡大の影響で研究の進捗が滞った。2021年度は再度樹液から菌類を分離し菌種の特定と存在量の定量を行うとともに、樹液のpH測定、樹液に含まれるグルコース・フルクトース・エタノールの測定を実施した。
2022年7月に、樹液に集まる昆虫(好樹液性昆虫)のうちムネアカオオアリとショウジョウバエを野外で採集し、酵母の分離と存在量評価を行った。
2023年3月に早春のコナラ樹液および樹液滲出部近傍のショウジョウバエとアリ類(未同定種)を採集し、酵母の分離と存在量評価を行った。2023年3月に採取した樹液中の酵母の存在量は、樹液 1μLあたり、3.5万~600万 CFU(コロニー形成単位)と極めて多かった。また、2023年3月に採集した樹液およびショウジョウバエからは同種とみられる(顕微鏡観察での簡易同定)酵母が共通して高頻度に検出された。一方ムネアカオオアリからは、樹液酵母とは異なるWickerhamiella属の未記載種が多数分離された。
また、2023年度はこれまでに分離・同定した樹液酵母の代表株、約60株(Saccharomyces属、Hanseniaspora属、Zygosaccharomyces属、Torulaspora属など)について、MALDI-TOF MSのレファレンスライブラリを構築し、樹液酵母の簡易迅速同定を可能にする基盤技術を整備した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

新型コロナウイルス感染症(Covid-19)の拡大に伴って、2020年4月~8月にかけて所属機関から在宅勤務命令と出勤制限を受けた。それゆえ、ラボでの現場勤務時間が喪失(平日3~4か月分に相当)し、通常業務が逼迫したことで本課題遂行に充分な研究時間を確保できなかった。加えて、Covid-19拡大抑止の観点から、出張など移動の自粛を余儀なくされ、2020年度中のサンプリングおよび現地調査の機会が喪失した。2021-2022年度は状況が改善したが、2022年夏は記録的な猛暑の影響のためか、従来のサンプリング地における樹液溜りが十分に発見できなかった。2023年度はほぼ2019年以前の状況に戻り、挽回したものの研究進捗状況はなおやや遅れている。

今後の研究の推進方策

本課題の遂行には、樹液の野外調査・採集活動が必須である。2022年夏は記録的な猛暑の影響のためか、従来のサンプリング地における樹液溜りが十分に発見できなかったが、好樹液性昆虫を採集し、虫体から酵母を分離できた。また、年明けの2023年3月には早春の樹液溜りを発見・採集でき、これらから分離した酵母の群集構造の解析と種同定を進めている。2023年度は、樹液に集まる昆虫の一例としてムネアカオオアリから分離された酵母の解析を行ったが、樹液酵母菌叢ではあまり出現しないWickerhamiella属の未記載種が多数含まれていた。すなわち、樹液に棲息する酵母と、好樹液性昆虫から高頻度に分離される酵母の種が一致しないケースであり、「好樹液性昆虫の共生酵母は、樹液酵母群のうちのいずれかの種である」というこれまでの想定を覆す結果であった。
このようなケースがあることから、樹液酵母の生活史全容を解明するために、より多種の好樹液性昆虫とその随伴酵母種を特定する必要がある。これまでの研究から、主要なものに限っても、Saccharomyces属、Hanseniaspora属、Zygosaccharomyces属、Torulaspora属、Starmerella属などが樹液酵母であることが分かっている。2024年度は、より多くの好樹液性昆虫について随伴酵母種(共生菌種)を特定し、できるだけ多種の樹液酵母の生態解明を目指す。

報告書

(5件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 3件、 招待講演 5件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] 森林に潜む酵母2023

    • 著者名/発表者名
      遠藤 力也
    • 雑誌名

      生物工学会誌

      巻: 101 号: 10 ページ: 531-534

    • DOI

      10.34565/seibutsukogaku.101.10_531

    • ISSN
      0919-3758, 2435-8630
    • 年月日
      2023-10-25
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Taxonomic study of polymorphic basidiomycetous fungi Sirobasidium and Sirotrema: Sirobasidium apiculatum sp. nov., Phaeotremella translucens comb. nov. and rediscovery of Sirobasidium japonicum in Japan2022

    • 著者名/発表者名
      Muneki Yamada, Rikiya Endoh, Hiroshi Masumoto, Yuma Yoshihashi, Moriya Ohkuma & Yousuke Degawa
    • 雑誌名

      Antonie van Leeuwenhoek

      巻: 115 号: 12 ページ: 1421-1436

    • DOI

      10.1007/s10482-022-01787-9

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Revision of <i>Xylonaceae</i> (<i>Xylonales</i>, <i>Xylonomycetes</i>) to include Sarea and Tromera2021

    • 著者名/発表者名
      Akira Hashimoto*, Hiroshi Masumoto, Rikiya Endoh, Yousuke Degawa, Moriya Ohkuma
    • 雑誌名

      Mycoscience

      巻: 62 号: 1 ページ: 47-63

    • DOI

      10.47371/mycosci.2020.11.001

    • NAID

      130007970911

    • ISSN
      1340-3540, 1618-2545
    • 年月日
      2021-01-20
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] D-Fructose Assimilation and Fermentation by Yeasts Belonging to Saccharomycetes: Rediscovery of Universal Phenotypes and Elucidation of Fructophilic Behaviors in Ambrosiozyma platypodis and Cyberlindnera americana2021

    • 著者名/発表者名
      Rikiya Endoh*, Maiko Horiyama and Moriya Ohkuma
    • 雑誌名

      Microorganisms

      巻: 9(4) 号: 4 ページ: 758-758

    • DOI

      10.3390/microorganisms9040758

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Prototheca paracutis sp. nov., oleaginous achlorophyllous microalga isolated from a mangrove forest2019

    • 著者名/発表者名
      Sineenath Kunthiphun, Rikiya Endoh (Co-first, corresponding author), Masako Takashima, Moriya Ohkuma, Somboon Tanaspawat, Ancharida Savarajara
    • 雑誌名

      Mycoscience

      巻: 印刷中 号: 3 ページ: 165-169

    • DOI

      10.1016/j.myc.2019.02.003

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 菌類の機能形質と環境条件2023

    • 著者名/発表者名
      遠藤 力也
    • 学会等名
      日本菌学会第66回大会 自由集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Ecology and potential as bioresource of 'sap yeasts' on Quercus trees2023

    • 著者名/発表者名
      Rikiya Endoh
    • 学会等名
      Tsukuba Conference 2023 [C-08] Interactive understanding of plant-microbe-soil interactions in the field environment
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 森林に潜む酵母2023

    • 著者名/発表者名
      遠藤 力也
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会 シンポジウム11 酵母という生き物 ~生態学的ふるまいとその多様性の理解に向けて~
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Quercus属の樹液に見られる酵母の種多様性2023

    • 著者名/発表者名
      遠藤 力也
    • 学会等名
      第135回日本森林学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 微生物株の新規 MALDI-TOF MSレファレンスライブラリー ’EMALiMB’ の開発2023

    • 著者名/発表者名
      遠藤 力也
    • 学会等名
      日本微生物資源学会第29回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 理研BRC-JCMにおける 酵母類リソースの開発と高付加価値化2021

    • 著者名/発表者名
      遠藤 力也
    • 学会等名
      日本微生物資源学会第27回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Development of MALDI-TOF MS data that enables rapid identification of various microbes2021

    • 著者名/発表者名
      Rikiya Endoh1, Sayaka Ban, Masahiro Hayashi, Kaori Tanaka, Takashi Yaguchi, Moriya Ohkuma
    • 学会等名
      ANRRC (Asian Network of Research Resource Centers) 2021
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Exploring New Yeast Resources - Lessons from Japanese Oak Wilt -2021

    • 著者名/発表者名
      Rikiya Endoh
    • 学会等名
      Korea-Japan Joint Symposium on Mycology
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] コナラ属樹木の”樹液酵母”とは何か?2020

    • 著者名/発表者名
      遠藤力也、大熊盛也
    • 学会等名
      第131回日本森林学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] 微生物資源の整備と利活用の戦略2023

    • 著者名/発表者名
      遠藤 力也
    • 総ページ数
      578
    • 出版者
      (株)エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      9784860438586
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] 〝酵母〟なのか〝キノコ〟なのか -二面性持つシロキクラゲ目の新種発見、分類の一部見直しも提唱-

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2022/20221116_1/index.html

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 酵母の果糖発酵と資化能力を再発見 -388株の酵母を使って見過ごされてきた能力を検証-

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2021/20210405_1/index.html

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-12-25  

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