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相分離RNPナノ構造体の構築・設計原理の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K06479
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43010:分子生物学関連
研究機関大阪大学 (2020-2021)
北海道大学 (2019)

研究代表者

山崎 智弘  大阪大学, 生命機能研究科, 特任講師 (90732280)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードRNA / 相分離 / 非膜性構造体 / NEAT1 / パラスペックル / 長鎖ノンコーディングRNA / ブロック共重合体 / ミセル化 / ミセル / RNA結合タンパク質 / arcRNA / 核内構造体
研究開始時の研究の概要

細胞に多数存在する長鎖ノンコーディングRNA(lncRNA)の中で一群のものは、相分離構造体構築のための骨格として機能する。このようなlncRNAは生理的に非常に重要な機能を持つ例が多く報告されている。しかし、このような構造体の性状がどのようにlncRNAによって規定されているかは明らかではない。そこで、その性状決定機構ならびにその設計原理を明らかにすることで、RNAによる相分離構造体形成の根幹をなす分子原理を解き明かす。

研究成果の概要

細胞内に多数存在する非膜性構造体は、相分離機構により形成され、細胞内プロセスを円滑に進めるために重要な役割を担う。一群の非膜性構造体の形成には、RNAが必須の役割を持つ。こうしたRNAのうち代表的なNEAT1 lncRNAが構築するパラスペックルの作動原理を解析し、パラスペックルの機能に重要と考えられる特徴的な形態や内部構造は、ミセル化と呼ばれる新規の細胞内相分離機構により形成されることを明らかにした。また、RNAを足場とする人工非膜性構造体実験系の確立にも成功し、RNAによる相分離機構を体系的に理解するための研究基盤を構築した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

近年注目を集める細胞内相分離研究において、多くの研究が液液相分離機構を対象としているが、本研究では、それとは異なる新たな細胞内相分離機構として、ブロック共重合体のミセル化というメカニズムを明らかにした。そのため、本成果は、今後の相分離研究の基盤として重要であると考えられる。また、ヒトゲノムから多量に産生されるタンパク質をコードしない長鎖ノンコーディングRNA(lncRNA)には、非膜性構造体を誘導するものが多く存在していることがわかりつつある。そのため、こうしたメカニズムの理解はlncRNAの作動原理や機能、さらには疾患における役割を理解する上で重要な基盤となることも期待できる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 2件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件) 図書 (5件) 備考 (5件)

  • [国際共同研究] CNRS(フランス)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] CNRS(フランス)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Institut Gustave Rossy, CNRS(フランス)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of Western Australia(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Biotechnology Center TU Dresden(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Paraspeckles are constructed as block copolymer micelles.2021

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Yamazaki, Tetsuya Yamamoto, Hyura Yoshino, Sylvie Souquere, Shinichi Nakagawa, Gerard Pierron, Tetsuro Hirose
    • 雑誌名

      EMBO Journal

      巻: - 号: 12

    • DOI

      10.15252/embj.2020107270

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] ArcRNAs and the formation of nuclear bodies.2021

    • 著者名/発表者名
      Shinichi Nakagawa, Tomohiro Yamazaki, Taro Mannen, Tetsuro Hirose
    • 雑誌名

      Mammalian Genome

      巻: - 号: 2 ページ: 382-401

    • DOI

      10.1007/s00335-021-09881-5

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Control of condensates dictates nucleolar architecture.2021

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Yamazaki, Tetsuro Hirose
    • 雑誌名

      Science

      巻: 373 号: 6554 ページ: 486-487

    • DOI

      10.1126/science.abj8350

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNAが形作る相分離構造体2021

    • 著者名/発表者名
      山崎智弘、廣瀬哲郎
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 93 ページ: 385-390

    • NAID

      40022647432

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] CRISPR-mediated mutagenesis of long noncoding RNAs2021

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki T., Hirose T.
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2254 ページ: 283-303

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1158-6_18

    • ISBN
      9781071611579, 9781071611586
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phase separation driven by production of architectural RNA transcripts.2020

    • 著者名/発表者名
      Tetsuya Yamamoto, Tomohiro Yamazaki, Tetsuro Hirose
    • 雑誌名

      Soft matter

      巻: 16 号: 19 ページ: 4692-4698

    • DOI

      10.1039/c9sm02458a

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detailed analyses of the crucial functions of Zn transporter proteins in alkaline phosphatase activation2020

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Eisuke、Ogawa Namino、Takeda Taka-aki、Nishito Yukina、Tanaka Yu-ki、Fujiwara Takashi、Matsunaga Mayu、Ueda Sachiko、Kubo Naoya、Tsuji Tokuji、Fukunaka Ayako、Yamazaki Tomohiro、Taylor Kathryn M.、Ogra Yasumitsu、Kambe Taiho
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 295 号: 17 ページ: 5669-5684

    • DOI

      10.1074/jbc.ra120.012610

    • NAID

      120006850466

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Architectural RNAs for Membraneless Nuclear Body Formation2020

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki T., Nakagawa S., Hirose T.
    • 雑誌名

      Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology

      巻: LXXXIV ページ: 1-11

    • DOI

      10.1101/sqb.2019.84.039404

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Molecular anatomy of the architectural NEAT1 noncoding RNA: The domains, interactors, and biogenesis pathway required to build phase-separated nuclear paraspeckles2019

    • 著者名/発表者名
      Hirose T., Yamazaki T., Nakagawa S.
    • 雑誌名

      WIREs RNA

      巻: 10 号: 6

    • DOI

      10.1002/wrna.1545

    • NAID

      120006941691

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] RNAs as scaffolds of biomolecular condensates: Lessons from paraspeckles scaffolded by NEAT1_2 lncRNAs2022

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Yamazaki, Tetsuya Yamamoto, Hiro Takakuwa, Hyura Yoshino, Wakana Isshiki, Sylvie Souquere, Shinichi Nakagawa, Gerard Pierron, Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      RNAフロンティアミーティング2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Paraspeckles are constructed as block copolymer micelles2021

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Yamazaki, Tetsuya Yamamoto, Sylvie Souquere, Shinichi Nakagawa, Gerard Pierron, Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      第22回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] RNAs as scaffolds of biomolecular condensates: from LLPS to micellization2021

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Yamazaki, Tetsuya Yamamoto, Sylvie Souquere, Shinichi Nakagawa, Gerard Pierron, Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      MBSJ2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Paraspeckles: RNA-scaffolding microphase-separated condensates2020

    • 著者名/発表者名
      山崎智弘
    • 学会等名
      MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Design Principles of Architectural RNAs for Phase-separated Paraspeckle Nuclear Bodies.2019

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki T
    • 学会等名
      Tokyo RNA Club, The 26th Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Formation and function of RNA-induced phase-separated nuclear bodies.2019

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki T, Souquere S, Takakuwa H, Yshino H, Fox AH, Bond CS, Nakagawa S, Pierron G, Hirose T.
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 相分離構造体パラスペックルの性状・機能を規定するNEAT1 lncRNAモジュール2019

    • 著者名/発表者名
      山崎智弘、高桑央、Sylvie Souquere、小松リチャード馨、吉野彪羅、Archa H Fox、Charles S Bond、中川真一、齋藤博英、Gerard Pierron、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      RNAフロンティアミーティング2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 核内相分離構造体パラスペックルの生物物理的性質を規定するNEAT1 lncRNAのRNPモジュール2019

    • 著者名/発表者名
      山崎智弘、高桑央、Sylvie Souquere、吉野彪羅、Archa H Fox、Charles S Bond、中川真一、Gerard Pierron、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      第21回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Hidden codes of NEAT1 lncRNA for biophysical properties of phase-separated paraspeckles.2019

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki T, Souquere S, Takakuwa H, Yoshino H, Fox AH, Bond CS, Nakagawa S, Pierron G, Hirose T.
    • 学会等名
      RNA2019 (24th Annual Meeting of the RNA Society)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 相分離構造体パラスペックルの性状・機能を規定するNEAT1 lncRNAモジュール2019

    • 著者名/発表者名
      山崎智弘、高桑央、Sylvie Souquere、小松リチャード馨、吉野彪羅、Archa H Fox、Charles S Bond、中川真一、齋藤博英、Gerard Pierron、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 相分離構造体パラスペックルの性状・機能を規定するNEAT1 lncRNAモジュール2019

    • 著者名/発表者名
      山崎智弘、高桑央、Sylvie Souquere、小松リチャード馨、吉野彪羅、Archa H Fox、Charles S Bond、中川真一、齋藤博英、Gerard Pierron、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      第5回北海道大学部局横断シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] 相分離 メカニズムと疾患2021

    • 著者名/発表者名
      山崎智弘、廣瀬哲郎(担当:分担執筆、範囲:I. 核内の非膜オルガネラ 4. パラスペックル)
    • 総ページ数
      221
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] 月刊 細胞2021

    • 著者名/発表者名
      山本哲也、山崎智弘、二宮賢介、廣瀬哲郎(担当:分担執筆、範囲:RNA生物学とソフトマター物理学の融合による核内構造体の研究)
    • 総ページ数
      76
    • 出版者
      ニューサイエンス社
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] 相分離生物学の全貌2020

    • 著者名/発表者名
      山崎智弘、廣瀬哲郎(担当:分担執筆, 範囲:核内の相分離)
    • 総ページ数
      402
    • 出版者
      東京化学同人
    • ISBN
      9784807913466
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] 実験医学2019年6月号「細胞内の相分離」(ノンコーディングRNAにより誘導される核内構造体形成機構)2019

    • 著者名/発表者名
      加藤 昌人、廣瀬 哲郎(高桑央、山崎智弘、廣瀬哲郎)
    • 総ページ数
      145
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758125208
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] マイクロRNA研究の進歩(lncRNAの機能と関連疾患)2019

    • 著者名/発表者名
      落合孝広、山本雄介(山崎智弘、廣瀬哲郎)
    • 総ページ数
      120
    • 出版者
      医歯薬出版株式会社
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [備考] Hirose Lab (RNA生体機能研究室)

    • URL

      http://hirose-lab.com/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 大阪大学大学院生命機能研究科 細胞ネットワーク講座 RNA生体機能研究室

    • URL

      https://www.fbs.osaka-u.ac.jp/ja/research_group/detail/7

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] RNAによる核内構造体形成の新たなしくみを発見

    • URL

      https://www.fbs.osaka-u.ac.jp/ja/research_results/papers/detail/1020

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] Hirose Lab (RNA生体機能分野)

    • URL

      http://hirose-lab.com/

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] RNA生体機能分野

    • URL

      http://www.igm.hokudai.ac.jp/rna/index.html

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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