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シトクロムP450-還元酵素複合体の立体構造解析による電子移動機構解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K06515
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関久留米大学

研究代表者

杉島 正一  久留米大学, 医学部, 准教授 (30379292)

研究分担者 佐藤 秀明  久留米大学, 医学部, 准教授 (60271996)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードX線小角散乱 / 電子伝達複合体 / クライオ電子顕微鏡 / 電子移動 / 酸化還元酵素 / X線結晶構造解析 / 分子間相互作用
研究開始時の研究の概要

シトクロムP450(P450)はステロイドの生合成等の脂質代謝や薬物代謝において、重要な役割を果たす酵素である。本研究では、P450の酵素反応に必要な還元力を供給するNADPH-シトクロムP450還元酵素(CPR)とP450の融合タンパク質であるP450BM-3に着目し、X線小角散乱およびX線結晶構造解析による立体構造決定を目指す。これまでに、明らかにしたCPRから還元力を受け取る別の酵素であるヘムオキシゲナーゼ(HO)とCPRの複合体の立体構造と比較することにより、CPRのダイナミックな構造変化を伴う電子移動機構を検証する。

研究成果の概要

脂質代謝や薬物代謝において重要なシトクロムP450へNADPH-シトクロムP450還元酵素(CPR)からどのように還元力が供給されるのかを明らかにするために、本研究では天然のCPRとP450の融合タンパク質であるP450BM-3に着目し、立体構造決定を目指した。P450BM-3の野生型や変異体についてX線小角散乱測定および多角度光散乱測定を行った結果、P450BM-3は二量体であり、その形成にCPRドメインが寄与することが示唆された。また、クライオ透過電子顕微鏡による単粒子解析を試みたが、2次元分類した際の分子の見え方が限られていることなどから、3次元マップは得られなかった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

P450BM-3のP450ドメインはその酵素活性の高さから産業的応用が期待されている酵素である。これまでに部分構造は明らかとなっているが、全長構造が明らかとなれば、その応用はより発展することが期待される。また、CPRとP450はステロイドホルモンの合成に関与しており、その機能不全による遺伝病が知られている。CPRからP450への電子移動機構が明らかになることによって、その遺伝病の治療法解明に寄与することが期待される。本研究結果ではX線小角散乱測定による低分解能構造しか得られなかったが、今後の研究進展によって、原子分解能の構造が得られれば、上記の目的が達成されることが期待される。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Crystal structures of hydroxymethylbilane synthase complexed with a substrate analog: a single substrate-binding site for four consecutive condensation steps2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Hideaki、Sugishima Masakazu、Tsukaguchi Mai、Masuko Takahiro、Iijima Mikuru、Takano Mitsunori、Omata Yoshiaki、Hirabayashi Kei、Wada Kei、Hisaeda Yoshio、Yamamoto Ken
    • 雑誌名

      Biochemical Journal

      巻: 478 号: 5 ページ: 1023-1042

    • DOI

      10.1042/bcj20200996

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Conformational equilibrium of NADPH-cytochrome P450 oxidoreductase is essential for heme oxygenase reaction2020

    • 著者名/発表者名
      Sugishima M., Taira J., Sagara T., Nakao R., Sato H., Noguchi M., Fukuyama K., Yamamoto K., Yasunaga T., Sakamoto H.
    • 雑誌名

      Antioxidants

      巻: 9 号: 8 ページ: 1-13

    • DOI

      10.3390/antiox9080673

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Functional diversification of two bilin reductases for light perception and harvesting in unique cyanobacterium Acaryochloris marina MBIC 110172020

    • 著者名/発表者名
      Miyake Keita、Fushimi Keiji、Kashimoto Tomonori、Maeda Kaisei、Ni‐Ni‐Win、Kimura Hiroyuki、Sugishima Masakazu、Ikeuchi Masahiko、Narikawa Rei
    • 雑誌名

      The FEBS Journal

      巻: - 号: 18 ページ: 4016-4031

    • DOI

      10.1111/febs.15230

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書 2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Coupling of Redox and Structural States in Cytochrome P450 Reductase Studied by Molecular Dynamics Simulation2019

    • 著者名/発表者名
      Iijima Mikuru、Ohnuki Jun、Sato Takato、Sugishima Masakazu、Takano Mitsunori
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 9341-9341

    • DOI

      10.1038/s41598-019-45690-2

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Crystal structure of phytochromobilin synthase in complex with biliverdin IXα, a key enzyme in the biosynthesis of phytochrome2019

    • 著者名/発表者名
      Sugishima Masakazu、Wada Kei、Fukuyama Keiichi、Yamamoto Ken
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 295 号: 3 ページ: 771-782

    • DOI

      10.1074/jbc.ra119.011431

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Bilin-metabolizing Enzymes: Site-specific Reductions Catalyzed by Two Different Type of Enzymes2019

    • 著者名/発表者名
      Sugishima, M., Wada, K., Unno, M., Fukuyama, K.
    • 雑誌名

      Current Opinion in Structural Biology

      巻: 59 ページ: 73-80

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2019.03.005

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Domain movements of NADPH-cytochrome P450 oxidoreductase (CPR) are required for the smooth electron transfer from CPR to heme-heme oxygenase-1 (HO-1) complex2021

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Sugishima, Junichi Taira, Mikuru Iijima, Hideaki Sato, Kei Wada, Masato Noguchi, Keiichi Fukuyama, Mitsunori Takano, Hiroshi Sakamoto, Ken Yamamoto
    • 学会等名
      25th Congress of the International Union of Crystallography
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural and functional analysis of tomato HY2 which synthesizes the chromophore for plant phytochrome2021

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Sugishima, Kei Wada, Natsuki Saito, Masaki Unno, Keiichi Fukuyama, Ken Yamamoto
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Relationship between the protonation state of the substrate and the absorption spectrum in a mutant of the enzyme that synthesizes a photosynthetic pigment2021

    • 著者名/発表者名
      Masaki Unno, Keisuke Igarashi, Yoshinori Hagiwara, Masakazu Sugishima, Kei Wada, Keiichi Fukuyama, Atsushi Ikeda, Katsuhiro Kusaka, Naomine Yano, Tatsuya Joutsuka, Andreas Ostermann
    • 学会等名
      MLZ Conference 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] フィトクロム発色団合成酵素HY2の結晶大型化に向けて2020

    • 著者名/発表者名
      杉島正一、和田 啓、齋藤夏希、海野昌喜、福山恵一、山本 健
    • 学会等名
      日本結晶学会2020年度年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 光応答タンパク質フィトクロムの発色団合成機構2020

    • 著者名/発表者名
      杉島正一、和田 啓、福山恵一、山本 健
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] フィトクロム発色団合成酵素のX線結晶構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      杉島正一、和田 啓、山本 健
    • 学会等名
      2019年度日本生化学会九州支部例会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] フィトクロモビリン合成酵素の酵素反応と立体構造2019

    • 著者名/発表者名
      杉島正一、和田 啓、山本健
    • 学会等名
      第43回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 基質誘導体を結合したヒドロキシメチルビランシンターゼ反応中間体の構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤秀明、杉島正一、塚口舞、増子隆博、小俣義明、和田啓、久枝良雄、山本健
    • 学会等名
      第43回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 赤色光受容体フィトクロムの光受容色素合成に必須な酵素の立体構造と機能2019

    • 著者名/発表者名
      杉島正一、和田啓、福山恵一、山本健
    • 学会等名
      2019年度日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ヘム分解酵素HO-1によるCOとO2の厳密な識別機構2019

    • 著者名/発表者名
      杉島正一
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] ホームページ

    • URL

      https://sites.google.com/view/msugishima76

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2019 実施状況報告書
  • [備考] 個人のホームページ

    • URL

      https://sites.google.com/view/msugishima76

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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