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がん治療薬の設計基盤となるSACLAによるRasの原子スケール動的構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 19K06525
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関神戸大学

研究代表者

島 扶美  神戸大学, 科学技術イノベーション研究科, 教授 (60335445)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード分子動画 / がん遺伝子産物 / X線自由電子レーザー / X線結晶構造解析 / 核磁気共鳴法 / シグナル伝達 / X線自由電子レーザー / 構造ベース創薬 / rasがん遺伝子産物
研究開始時の研究の概要

薬剤結合ポケットに大きな揺らぎを持つため、SPring-8などを利用した従来型の理論的分子設計のみでは医薬品創出が困難ながん遺伝子産物Rasに対して、SPring-8の10億倍の明るさを持ちなおかつ10fs発光(照射)という放射線損傷が進む前の結晶構造観察が可能なX線レーザーを供給できるX線自由電子レーザー施設・SACLAと時分割シリアルフェムト秒結晶構造解析を組み合わせた手法で、世界初の原子スケールでのRasの薬剤結合ポケット開閉運動のメカニズムを原子レベルでのコマ撮り動画の作成を通じて解明し、 SACLAならびにSPring-8を活用した創薬基盤技術の新たな可能性を拓く。

研究成果の概要

低分子量G蛋白質RasはGTP結合型(活性型)とGDP結合型(不活性型)を行き来しながら細胞内シグナル伝達を制御する。Rasは医薬品開発の恰好のターゲットであるが医薬品開発成功例が極めて少ない。その原因の一つとして、RasのGTP加水分解機能に関連する薬剤結合領域の構造ダイナミックスが挙げられる。本研究では、Rasの基質として光制御可能なGTPアナログを用いてSACLA/Spring-8/NMRによる時分割構造解析を行った。その結果、これまで未解明であった天然型GTP結合型RasからGDP型に至る原子スケールでの分子動画の一部撮影に成功し、新たな創薬領域を開拓する可能性が示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

Rasの機能攻略の難易度の高さの一要因として、他の抗がん剤の標的の薬剤結合ポケットにはない大きな揺らぎ=開閉運動の存在があげられる。ここでは、申請者が同定したリード化合物(特許取得済)の効率的な構造最適化を可能にするために、最新鋭のX線自由電子レーザー施設SACLAとPring-8をフル利用し、従来技術では解析困難だったRasの活性制御に直結した薬剤結合ポケットの開閉運動の構造ダイナミクスを原子スケールで解明する。Rasの構造・活性変化の世界初の原子レベルでのコマ撮り動画が作成できれば学術的インパクトは大きく、Ras阻害剤の構造デザインに活用できれば、健康社会への貢献も極めて大である。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2021 2020 2019

すべて 学会発表 (5件) (うち招待講演 1件)

  • [学会発表] 低分子量G蛋白質RasのGTP加水分反応過程におけるヌクレオチド近傍の構造変化2021

    • 著者名/発表者名
      佐伯茉帆, 槇野義輝, 河村高志, 南後恵理子, 熊坂崇, 島扶美
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 光反応性基質を利用したがん遺伝子産物Rasの酵素触媒反応の可視化2021

    • 著者名/発表者名
      島扶美, 槇野義輝, 南後恵理子, 熊坂崇
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Analysis of conformational dynamics of small G-protein Ras on GTP hydrolysis process by SACLA, SPring-8 and NMR2020

    • 著者名/発表者名
      Maho Saeki, Yoshiteru Makino, Shigeyuki Matsumoto, Takashi Kawamura, Eriko Nango, Takashi Kumasaka and Fumi Shima
    • 学会等名
      43回日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 微小結晶を利用したRas caged-GTP時分割測定の試み2020

    • 著者名/発表者名
      河村 高志, 槇野 義輝*, 長谷川 和也, 中根 崇智, 馬場 清喜, 南後 恵理子, 田中里枝, 岩田想, 島扶美*, 熊坂崇
    • 学会等名
      第33回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Caged-GTPを用いたがん遺伝子産物RasのSACLA、Spring-8、NMRによるGTP加水分解過程の構造変化の解明2019

    • 著者名/発表者名
      槇野義輝*、河村高志、松本篤幸、南後恵理子、岩田想、熊坂崇、島扶美*
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-12-25  

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