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シグナル脂質代謝酵素DGKαの触媒機構及び分子内活性化制御機構の構造基盤の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K06527
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関九州大学

研究代表者

高橋 大輔  九州大学, 薬学研究院, 講師 (70791523)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード脂質代謝酵素 / ジアシルグリセロールキナーゼ / EFハンド / 構造解析 / NMR / X線小角散乱 / SEC-SAXS/MALS / DGKα / 溶液NMR / 脂質キナーゼ / マルチドメイン酵素 / DGK / EF-hand / 複数ドメイン蛋白質 / 構造生物学 / 分子間相互作用
研究開始時の研究の概要

脂質代謝酵素の一つであるDGKαは,”がん細胞を増殖させるが,逆にT細胞の活性を減弱する”という生理学的にユニークな働きをもつため,DGKαは,新規がん免疫創薬の標的として近年注目され,阻害剤のスクリーニングも進められてきた.しかし,細胞膜近傍の疎水的な環境で働くDGKの分子機構の詳細は,不明のままであり,合理的な阻害剤設計に必要なDGKの立体構造も未だ決定されていない.本研究では,DGKαの触媒機構,及び複数の制御ドメインによる分子内活性化制御機構を構造生物学・物理化学・生化学的手法により多角的かつ詳細に解析し,DGKαの構造基盤を明らかにする.

研究成果の概要

本研究では,新規がん免疫治療薬の標的として考えられている脂質代謝酵素DGKαの触媒機構,活性制御機構の構造基盤の解明を目的とした.まず,昆虫細胞発現系を用いて高純度のDGKαを調製し,結晶化を試みたが,結晶を得ることができなかった.打開策として,クライオ電顕単粒子解析による構造決定を目指し,抗DGKα抗体Fab断片との複合体を調製し,解析を進めた.また,N末端のEF領域がCa2+結合によりモルテングロビュールの状態から,コンパクトな状態へと変化し,その構造変化が隣接するRVH領域との相互作用を変化することをNMR, X線小角散乱等の物理化学的測定により明らかにした.

研究成果の学術的意義や社会的意義

新規のがん免疫治療薬の標的であるDGKαに関する構造生物学的理解は乏しく,活性が確認されて以来約60年,立体構造は不明のままである.本研究では,DGKα試料の大量発現・精製を進め,新たに抗DGK抗体Fabとの複合体を調製し,クライオ電顕による解析に着手することができた.また,種々の物理化学的手法を用いてDGKαの活性制御を担うN末端領域の構造・相互作用変化をさらに詳細に明らかにすることができた.DGKα阻害剤開発のためには,より高分解能での構造解析が必要になるが,Cryo-EMのための試料調製が進んだことや個々のドメインの相互作用を明らかにしたことは,今後の構造解析に大きく貢献したといえる.

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 3件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (3件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Membrane morphology determines diacylglycerol kinase alpha substrate acyl chain specificity.2021

    • 著者名/発表者名
      Bozelli Jr., J.C., Jenny Yune, J., Takahashi, D., Sakane, F., and Epand, R.M.
    • 雑誌名

      FASEB Journal

      巻: 35 号: 6

    • DOI

      10.1096/fj.202100264r

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Membrane morphology determines diacylglycerol kinase alpha substrate acyl chain specificit2021

    • 著者名/発表者名
      Jose Carlos Bozelli Junior, Jenny Yune, Daisuke Takahashi, Fumio Sakane, and Richard M. Epand
    • 雑誌名

      FASEB Journal

      巻: Accepted

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Palmitic acid- and/or palmitoleic acid-containing phosphatidic acids are generated by diacylglycerol kinase α in starved Jurkat T cells2020

    • 著者名/発表者名
      Murakami Y, Murakami C, Hoshino F, Lu Q, Akiyama R, Yamaki A, Takahashi D, Sakane F.
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: in press 号: 4 ページ: 1054-1060

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.02.162

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of α-synuclein N-terminal domain as a novel cellular phosphatidic acid sensor2019

    • 著者名/発表者名
      Yamada H, Mizuno S, Honda S, Takahashi D, Sakane F
    • 雑誌名

      FEBS J

      巻: in press 号: 11 ページ: 2212-2234

    • DOI

      10.1111/febs.15137

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Microarray analysis of gene expression in the diacylglycerol kinase η knockout mouse brain2019

    • 著者名/発表者名
      Komenoi S, Suzuki Y, Asami M, Murakami C, Hoshino F, Chiba S, Takahashi D, Kado S, Sakane F.
    • 雑誌名

      Biochemistry and Biophysics Reports

      巻: 19 ページ: 100660-100660

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2019.100660

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Myristic acid specifically stabilizes diacylglycerol kinase delta protein in C2C12 skeletal muscle cells.2019

    • 著者名/発表者名
      Iwata, K., Sakai, H., Takahashi, D. and Sakane F.
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta - Mol Cell Biol Lipids

      巻: In press 号: 7 ページ: 1031-1038

    • DOI

      10.1016/j.bbalip.2019.04.003

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Expression, purification and characterization of human diacylglycerol kinase zeta2019

    • 著者名/発表者名
      Saito, T., Takahashi, D. and Sakane, F.
    • 雑誌名

      ACS Omega

      巻: 4 号: 3 ページ: 5540-5546

    • DOI

      10.1021/acsomega.9b00079

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Crystal structure and calcium-induced conformational changes of diacylglycerol kinase α EF-hand domains2019

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Daisuke、Suzuki Kano、Sakamoto Taiichi、Iwamoto Takeo、Murata Takeshi、Sakane Fumio
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 28 号: 4 ページ: 694-706

    • DOI

      10.1002/pro.3572

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] マルチドメイン蛋白質DGKαの活性を制御する N末端領域の構造変化の解析2021

    • 著者名/発表者名
      高橋大輔,米澤健人,沖崎悠希,嶋田睦,Jose Caarveiro,阿部義人,植田正,清水伸隆,坂根郁夫
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] DGKα 活性制御の分子基盤:N末端RVH領域へのCa2+結合の物理化学的解析2019

    • 著者名/発表者名
      高橋大輔,嶋田睦,Jose Caarveiro, 阿部義人,植田正,坂根郁夫
    • 学会等名
      第43回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] DGKα 活性制御の分子基盤:N末端RVH領域へのCa2+結合の物理化学的解析2019

    • 著者名/発表者名
      高橋大輔,嶋田睦,Jose Caarveiro, 阿部義人,植田正,坂根郁夫
    • 学会等名
      2019年度 日本生化学会九州支部例会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [備考] 九州大学薬学研究院 蛋白質創薬学分野HP

    • URL

      https://meneki.phar.kyushu-u.ac.jp/Protein/publications.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 九州大学 研究者プロファイル

    • URL

      https://kyushu-u.pure.elsevier.com/en/persons/daisuke-takahashi

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 九州大学大学院 薬学研究院 蛋白質創薬学分野

    • URL

      http://meneki.phar.kyushu-u.ac.jp/Protein/TOP.html

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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