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骨形成に関与する核内受容体の脂溶性シグナル伝達分子認識機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K06588
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関高知大学

研究代表者

杉山 成  高知大学, 教育研究部自然科学系理工学部門, 教授 (90615428)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード転写因子 / 脂溶性ビタミン / 凝固ゲル中結晶 / X線結晶構造解析 / X線結晶構造解析 / 脂溶性ビタミンK / 凝固ゲル中結晶化 / タンパク質 / タンパク質結晶 / 脂溶性リガンド / ステロイドX受容体
研究開始時の研究の概要

SXRは骨粗鬆症治療薬の標的タンパク質である。脂溶性ビタミンK2と結合することで活性化され、骨形成に関与する遺伝子発現を誘導する転写因子である。これまでの研究から、脂溶性ビタミンK2と類似構造を持つ各種脂溶性ビタミンKにおいて、SXRに対する結合能と転写活性の強さに明確な差があることを発見した。本研究では、各種脂溶性ビタミンK-SXRの複合体構造とSXRに対する結合能および転写活性の強さをそれぞれ比較することによって、これまで未解明であった転写活性に関わる多様な複合体構造の変化を明らかにし、SXRの分子認識機構の解明と転写活性化機構の構造基盤を解明することを目的とする。

研究成果の概要

ステロイドX受容体(SXR)は、骨粗鬆症治療薬の標的タンパク質である。脂溶性ビタミンと結合することで活性化され、SXRとヘテロ2量体を形成し骨形成に関与する遺伝子発現を誘導する。本研究では、SXRの分子認識機構の構造基盤を解明するためSXRの結晶構造解析を行った。各種脂溶性化リガンドとSXRの複合体結晶を得るため、凝固ゲル中結晶化法の改良を行った。改良した本方法を用いることでSXRを熱変性させること無く凝固ゲル中SXR結晶の育成に成功した。さらに、凝固ゲル中結晶を50%DMSO含有水溶液に溶解させたリガンド溶液中へソーキングさせたところSXR複合体結晶の取得に成功し複合体構造を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

脂溶性ビタミンとSXRの相互作用は、脂溶性ビタミンの環状部分と側鎖部分の両方が協同的に関わっている。これらの多様な複合体構造の変化を原子レベルで明らかにすることによって、脂溶性化合物とタンパク質の新しい構造基盤を構築することができれば、その学術的意義は大きい。また、凝固ゲル中結晶化法はこれまで困難であった難水溶性化合物-タンパク質の複合体構造解析を容易にするだけでなく,新しい創薬法の開発へ向けて貢献できる技術である。本方法を汎用化することができれば,これまで困難であった難水溶性化合物と標的タンパク質との複合体構造を取得することが容易となり創薬への貢献が期待できるため社会的意義は大きい。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Growth of protein crystals in high-strength hydrogels with the dialysis membrane2021

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Sugiyama, Keisuke Kakinouchi, Hiroaki Adachi, Tsugio Nagasawa, Noriaki Kunimune, Michio Murata, and Yusuke Mori
    • 雑誌名

      Jpn. J. Appl. Phys.

      巻: 60 号: 1 ページ: 015506-015506

    • DOI

      10.35848/1347-4065/abd0c7

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of strict substrate recognition of L-lysine α-oxidase from Trichoderma viride2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Kondo, Masaki Kitagawa, Yuya Matsumoto, Masaya Saito, Marie Amano, Shigeru Sugiyama, Takashi Tamura, Hitoshi Kusakabe, Kenji Inagaki, Katsumi Imada
    • 雑誌名

      Protein Sci.

      巻: 29 号: 11 ページ: 2213-2225

    • DOI

      10.1002/pro.3946

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Effect of ultra-fine bubble water on protein crystal nucleation2020

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Sugiyama, Tomoya Kitatani, Taichi Naruse, Yumeto Otsuka, Hiroaki Adachi, Toshihiro Fujita, and Yusuke Mori
    • 雑誌名

      Jpn. J. Appl. Phys.

      巻: 59 号: 11 ページ: 115505-115505

    • DOI

      10.35848/1347-4065/abc2a0

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Growth of protein crystals in high-strength hydrogels with the dialysis membrane2021

    • 著者名/発表者名
      T. Naruse, K. Hamada, H. Adachi, T. Nagasawa, N. Kunimune, M. Murata, Y. Mori, S. Sugiyama
    • 学会等名
      25th Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 難水溶性リガンド-タンパク質複合体の構造解析へ向けた技術開発2021

    • 著者名/発表者名
      杉山成
    • 学会等名
      フロンティア理工学研究所2020年度シンポジウム「バイオインフォマティクスと関連技術の最前線」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 凝固ゲル中結晶化法の汎用化を目指した結晶作製装置の開発2021

    • 著者名/発表者名
      成瀬太智,濱田健太,安達宏昭,長澤次男,国宗範彰,村田道雄,森勇介,杉山成
    • 学会等名
      第50回結晶成長国内会議(JCCG‐50)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 凝固ゲル中結晶化法による脂溶性化合物複合体解析2020

    • 著者名/発表者名
      杉山成,垣之内啓介,安達宏昭,国宗範彰,村田道雄,森勇介
    • 学会等名
      第61回日本生化学会中国・四国支部例会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書 2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Development and evaluation of the high-strength hydrogel method for high versatility2020

    • 著者名/発表者名
      成瀬太智,天野妙法華,国宗範彰,長澤次男,安達宏昭,森勇介,杉山成
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 凝固ゲル中結晶化法を用いた骨形成に関与するステロイドX受容体の分子認識2020

    • 著者名/発表者名
      杉山成,垣之内啓介,廣田佳久,中川公恵,岡野登志夫,村田道雄
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] タンパク質結晶の最前線(普及版)2020

    • 著者名/発表者名
      杉山成,他51名
    • 総ページ数
      288
    • 出版者
      株式会社シーエムシー出版
    • ISBN
      9784781314730
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [産業財産権] 有機高分子結晶製造装置2021

    • 発明者名
      杉山成,国宗範彰,成瀬太智
    • 権利者名
      杉山成,国宗範彰,成瀬太智
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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