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「その場」でのビジュアルプロテオミクスによる成長円錐の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 19K06594
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関東京大学

研究代表者

福田 善之  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 特任講師 (60571099)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードボルタ位相差クライオ電子線トモグラフィー / 初代培養神経細胞 / 成長円錐 / クライオFIB-SEM / サブトモグラム平均化 / リフトアウト法 / クライオ電子線トモグラフィー / ボルタ位相差電子線トモグラフィー / リボソーム / テンプレートマッチング / クライオFIB/SEM / ボルタ位相差クライオ透過電子顕微鏡 / その場でのビジュアルプロテオミクス
研究開始時の研究の概要

クライオ電子顕微鏡技術の発展により、細胞内のタンパク質複合体を直接検出し、その機能状態を示す空間分解能で構造の解析が可能である、「その場」でのビジュアルプロテオミクスが開発された。本研究では、タンパク質の空間的相関と細胞機能の制御機構との関連性を解明することを目的としている。具体的には、「その場」でのビジュアルプロテオミクスを用いて、成長円錐における局所タンパク質合成およびユビキチン―プロテアソーム系を介した局所タンパク質分解の制御機構をリボソームや26Sプロテアソームなどの関連分子の空間的相関性の観点からの解明を試みる。

研究成果の概要

クライオ電子顕微鏡技術の発展により、細胞内のタンパク質複合体を直接検出し、その機能状態を示す空間分解能で構造の解析が可能である、「その場」でのビジュアルプロテオミクスが開発された。本研究課題では、マウス海馬由来初代培養神経細胞のトモグラムを、「その場」でのビジュアルプロテオミクスを行ったところ、神経突起内にポリソームと思われる構造が確認された。また、使用している装置のアップデートに伴い、本研究計画への応用を目的としてクライオリフトアウト法の導入を行い、高圧凍結したマウス精子をテスト試料としてリフトアウト法の立ち上げに成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究計画は本来の研究計画を変更して、クライオFIB-SEMを用いたラメラの作製およクライオリフトアウト法の確立に多くの時間を費やした。世界的に見て、クライオFIB-SEMは構造生物学における最先端技術の一つである。しかしながら、日本国内においては、クライオFIB-SEMの装置は導入されているものの、使用者できる研究者が少ないという問題がある。そのため、本研究計画において、クライオFIB-SEMの手法開発を行ったことで、国内におけるクライオFIB-SEM使用者の裾野を広げ、構造生物学分野の活性化に貢献できたと考えている。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2021 2020

すべて 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件、 招待講演 3件)

  • [学会発表] Cryo electron tomography of cellular specimens2021

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyuki Fukuda
    • 学会等名
      The KSBMB International Conference 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Workflow of cryo electron tomography2021

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyuki Fukuda
    • 学会等名
      Cryo-Electron Microscopy Course at OIST
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クライオFIB-SEMを用いたクライオ電子線トモグラフィー試料の作製2020

    • 著者名/発表者名
      福田善之
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会 第76回学術講演会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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