研究課題/領域番号 |
19K06610
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分43050:ゲノム生物学関連
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研究機関 | 三重大学 |
研究代表者 |
竹林 慎一郎 三重大学, 生物資源学研究科, 准教授 (50392022)
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研究分担者 |
平谷 伊智朗 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (40583753)
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研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2021年度)
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配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
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キーワード | DNA複製 / 染色体 / シングルセル / 染色体ドメイン / 染色体機能ドメイン |
研究開始時の研究の概要 |
最近申請者は、単一細胞レベルでしかもゲノムワイドに複製ドメイン構造を解析できるscRepli-seq法を開発した。この方法を用いることで、「染色体ドメイン構造は生体内の個々の細胞レベルで見たときにどれほど厳密な制御をうけているのか」、「この厳密性(あるいは曖昧さ)が胚体内での細胞の位置情報や遺伝子発現パターンとどのような関係にあるのか」、「単一細胞内での父由来、母由来染色体の挙動の違いはどれほど考慮する必要があるのか」といった問いに対して明確な答えを出す。
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研究成果の概要 |
動物細胞の染色体複製ドメイン構造(DNA複製の開始や複製フォークの進行が協調して制御される染色体構造単位)を単一細胞で、かつゲノム網羅的に調べることができる申請者独自の技術single-cell DNA replication sequencing (scRepli-seq)法を用い、これまでアプローチが困難であった個々の細胞レベルでの染色体構造制御を明らかにした。
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
これまでDNA複製制御を単一細胞レベルで、高解像度、広範囲にわたって詳細に解析した例はなく、本研究で得られた成果は今後のDNA複製研究に大きく貢献することは確実である。DNA複製に着目することで、これまでアプローチの難しかった個々の細胞レベルでの染色体構造の安定性や揺らぎの実体を明らかにしたことは、巨大な染色体分子の動態を理解するためのモデリングやシミュレーションにとって非常に有用で、関連学問分野への波及効果が期待できる。
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