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植物ゲノムにおける転移因子由来非コードRNAの転写制御

研究課題

研究課題/領域番号 19K06619
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43050:ゲノム生物学関連
研究機関沖縄科学技術大学院大学

研究代表者

佐瀬 英俊  沖縄科学技術大学院大学, 植物エピジェネティクスユニット, 准教授 (70510006)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードエピジェネティクス / トランスポゾン / 植物ゲノム / トランスポソン / エピゲノム / シロイヌナズナ / 非コードRNA / 転移因子 / RNA
研究開始時の研究の概要

植物のゲノムでは遺伝子内部の非翻訳領域に転移因子(トランスポゾン)が大量に蓄積している。本研究は植物ゲノムの遺伝子内部に存在する転移因子由来の潜在的プロモーターから転写されるRNAの転写制御メカニズムをエピジェネティック制御の観点から明らかにすることを目的とする。

研究成果の概要

植物ゲノムでは進化の過程で遺伝子内部の非翻訳領域(インントロンやUTR配列)に転移因子 (トランスポゾン)が大量に蓄積されている。本研究において我々はシロイヌナズナにおけるゲノムワイドな転写開始点の解析を行い、普段はエピジェネティック修飾によって抑制されているCrypticな転写開始点から発現するRNAクラスターを3000以上新たに同定し、その多くが転移因子配列由来であることを見出した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

これまで理解されていなかった植物ゲノムにおける遺伝子の転写開始点制御と転移因子配列のエピジェネティック制御について本研究成果から明らかになった。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 3件)

  • [雑誌論文] Epigenetic regulation of spurious transcription initiation in Arabidopsis2020

    • 著者名/発表者名
      Le NT, Harukawa Y, Miura S, Boer D, Kawabe A, Saze H.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 3224-3224

    • DOI

      10.1038/s41467-020-16951-w

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 植物における環境要因におけるエピゲノム変化と継世代伝達の可能性2021

    • 著者名/発表者名
      佐瀬英俊
    • 学会等名
      日本遺伝学会第93回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Epigenetic regulation of intragenic transposons and gene transcription in plant genomes2021

    • 著者名/発表者名
      Hidetoshi Saze
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 植物における遺伝子内トランスポゾン配列の抑制的クロマチン修飾の維持機構2020

    • 著者名/発表者名
      佐瀬英俊
    • 学会等名
      日本植物学会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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