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低エネルギー反応を利用する化学合成微生物の個体群動態と進化の理論的研究

研究課題

研究課題/領域番号 19K06853
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分45040:生態学および環境学関連
研究機関奈良女子大学

研究代表者

瀬戸 繭美  奈良女子大学, 自然科学系, 助教 (10512717)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2021年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2020年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード微生物生態 / 非平衡熱力学 / 数理モデリング / 生物エネルギー論 / 酸化還元反応 / 化学合成微生物 / 個体群動態 / ギブスエネルギー / 化学合成細菌 / 群集生態学 / 地球微生物学 / 個体群動態モデル / 生体エネルギー論 / 化学合成無機独立栄養 / 数理モデル / 微生物生態学 / 熱力学 / 種間相互作用 / 進化
研究開始時の研究の概要

地球上の生物は光か化学反応のいずれかをエネルギー源として用いる。細菌や古細菌には鉄や水素や硫黄を利用した反応からエネルギーを得るものが存在し、彼らの存在は炭素や窒素の挙動に影響するだけで無く重金属の動態や毒性にも影響をもたらす。彼らの特徴は有機物を酸素で酸化する化学反応(好気呼吸)からエネルギーを得る動物と異なり、反応から獲得することができるエネルギー量が非常に低い点である。本研究では低エネルギー反応を利用する微生物の増殖動態をモデル化し、それらの微生物の増殖過程を理解し、個体群の相互作用と進化動態について理論的な理解を試みる。

研究成果の概要

生態学の基盤理論は地球表層の生態系(陸上や沿岸環境)の観測結果に基づき構築されてきた。一方で深海にも莫大な生物量が存在し、細菌と古細菌が生物生産を支える。深海で利用可能なエネルギー量は、表層生態系で利用可能なエネルギー量と比較し少ない。本研究では光をエネルギー源としない微生物群集と生態系の理解するために、個体群動態モデルを用いた理論研究を実施した。その結果、微生物は代謝産物を受け渡すことで反応速度だけでなくエネルギー転換効率を上昇していることが明らかになった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

地下生態系に存在する細菌や古細菌の多くは電子移動を伴う化学反応を利用して自らのエネルギーに転換し、生物生産を支える。こうしたエネルギー利用形態の生物は地球の最古の生命に近い形態であることが示唆されている。よって、光に依存しない微生物生態系を理解することは、初期生命が生態系を築くに至るプロセスを知るために役に立つ。また、生態学のこれまでの基盤理論に地下生態系の理論を追加し、比較することで、より普遍的な生態系理論の確立を目指すことができる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 1件、 招待講演 5件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] Ecohydrology Research Group(カナダ)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Microbial material cycling, energetic constraints and ecosystem expansion in subsurface ecosystems2020

    • 著者名/発表者名
      Seto Mayumi、Iwasa Yoh
    • 雑誌名

      Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences

      巻: 287 号: 1931 ページ: 20200610-20200610

    • DOI

      10.1098/rspb.2020.0610

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] How Thermodynamics Illuminates Population Interactions in Microbial Communities2020

    • 著者名/発表者名
      Seto Mayumi、Iwasa Yoh
    • 雑誌名

      Frontiers in Ecology and Evolution

      巻: 8 ページ: 602809-602809

    • DOI

      10.3389/fevo.2020.602809

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The fitness of chemotrophs increases when their catabolic by‐products are consumed by other species2019

    • 著者名/発表者名
      Seto Mayumi、Iwasa Yoh
    • 雑誌名

      Ecology Letters

      巻: 22 号: 12 ページ: 1994-2005

    • DOI

      10.1111/ele.13397

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Potential for Aerobic Methanotrophic Metabolism on Mars2019

    • 著者名/発表者名
      Seto Mayumi、Noguchi Katsuyuki、Cappellen Philippe Van
    • 雑誌名

      Astrobiology

      巻: 19 号: 10 ページ: 1187-1195

    • DOI

      10.1089/ast.2018.1943

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 化学合成微生物群集と酸化還元ネットワークの共発展2022

    • 著者名/発表者名
      瀬戸繭美
    • 学会等名
      第69回日本生態学会 2022年3月15日
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 硝化反応における微生物代謝の競争と協力2021

    • 著者名/発表者名
      瀬戸繭美
    • 学会等名
      第31回日本数理生物学会大会(2021年度年会)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 代謝エネルギーを介して見る微生物群集2021

    • 著者名/発表者名
      瀬戸繭美
    • 学会等名
      京都大学生態学研究センター共同利用ワークショップ 微生物を軸とした群集構造研究の統合とさらなる展開
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] エネルギー生産反応を介した 相利的な種間相互作用2021

    • 著者名/発表者名
      瀬戸繭美
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 光非依存生産者の種間相互作用と生物地球化学サイクルの数理モデル2020

    • 著者名/発表者名
      瀬戸繭美
    • 学会等名
      日本数理生物学会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 微生物代謝ネットワークと生態系の共進化: 化学エネルギー観点からの進化的制約とは?2020

    • 著者名/発表者名
      瀬戸繭美
    • 学会等名
      第16回生物数学の理論とその応用~生命現象の定量的理解に向けて~
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] エネルギーで読み解く微生物相互作用と微生物代謝の進化2020

    • 著者名/発表者名
      瀬戸繭美
    • 学会等名
      京都大学生態学研究センターセミナー
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Catabolic mutualistic interactions can lead ecosystem expansion2019

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Seto
    • 学会等名
      24th International Symposium on Environmental Biogeochemistry
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] エネルギー獲得を巡る微生物相互作用:ニッチ構築と物質フローの拡大2019

    • 著者名/発表者名
      瀬戸繭美
    • 学会等名
      2019年度(第29回)日本数理生物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 酸化還元反応と生命 - 微生物代謝の進化と生態系の発展 -2019

    • 著者名/発表者名
      瀬戸繭美
    • 学会等名
      ソフトマターの未来材料シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Application of bioenergetics in astrobiology and ecology2019

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Seto
    • 学会等名
      Ecohydrology Research Symposium
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] 瀬戸研究室

    • URL

      https://www.e.ics.nara-wu.ac.jp/~seto/index_ja.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 研究者自身が管理しているホームページにおける発表論文のWebページ

    • URL

      https://www.e.ics.nara-wu.ac.jp/~seto/publications_ja.html

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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