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タンパク質分子を取り巻く環境を考慮した構造解析によるアミロイド形成機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K07041
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分47020:薬系分析および物理化学関連
研究機関大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究

研究代表者

矢木 真穂  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究, 生命創成探究センター, 助教 (40608999)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードアミロイド線維 / アミロイドβ / 微小重力環境 / 低温大気圧プラズマ / ガングリオシド / 核磁気共鳴 / クライオ電子顕微鏡 / 国際宇宙ステーション / 微小重力 / アミロイド
研究開始時の研究の概要

タンパク質のアミロイド形成は神経変性疾患等の発症と関わっており、その分子機構を明らかにすることは薬学領域においても重要な課題である。タンパク質の分子間相互作用から線維形成に至るプロセスには、タンパク質を取り巻く様々な環境因子が複雑に関わっており、それらの寄与を考慮しない限りアミロイド形成機構の真の理解は不可能である。そこで本研究では、アルツハイマー病の発症に関わるアミロイドβをモデル分子として、対流等による溶液内ミクロ環境の揺らぎ、溶液-膜界面での空間限定の効果等を考慮した構造解析を行い、これらの環境因子がアミロイド形成に与える影響を詳細に検討して分子会合機構の実態解明に迫る。

研究成果の概要

微小重力環境下で形成したアミロイド線維の精密構造解析を行い、アミロイド線維形成に対する溶液内ミクロ環境の揺らぎの影響を明らかにすることができた。一方、アミロイドβの分子会合に対する溶液-膜界面での空間限定の効果を明らかにするため、固体NMR解析および分子動力学計算を実施し、ガングリオシドを含む脂質膜界面に補足されたアミロイドβの分子集合体の構造を決定するとともに、分子集合の鍵となるアミノ酸残基を特定することに成功した。さらに、高速原子間力顕微鏡を用いて、アミロイド線維の伸長の様子や、抗アミロイドβ抗体がアミロイド線維の伸長末端に特異的に結合して線維伸長を阻害する様子を可視化することができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

タンパク質のアミロイド形成は神経変性疾患等の発症と関わっており、その分子機構を明らかにすることは薬学領域において重要な課題である。タンパク質の分子間相互作用から線維形成に至るプロセスには、タンパク質を取り巻く様々な環境因子が複雑に関わっている。したがって、対流等による溶液内ミクロ環境の揺らぎ、溶液-膜界面での空間限定の効果等の寄与を考慮した構造解析を実施することではじめて、アミロイド形成機構の真の理解が可能となる。さらに、得られた研究成果に基づき、環境因子の影響を考慮したアミロイド標的創薬への新たな展開などが期待される。

報告書

(3件)
  • 2021 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 4件、 招待講演 7件)

  • [国際共同研究] University of Cambridge(英国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Cold Atmospheric Plasma Modification of Amyloid β2021

    • 著者名/発表者名
      Yagi-Utsumi Maho、Tanaka Tomohiro、Otsubo Yoko、Yamashita Akira、Yoshimura Shinji、Nishida Motohiro、Kato Koichi
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 号: 6 ページ: 3116-3116

    • DOI

      10.3390/ijms22063116

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 膜環境におけるアミロイドβの分子集合に関する構造的知見2021

    • 著者名/発表者名
      矢木真穂、加藤晃一
    • 雑誌名

      膜

      巻: 46 ページ: 2-6

    • NAID

      130007977588

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of amyloid β fibril formation under microgravity conditions2020

    • 著者名/発表者名
      Yagi-Utsumi Maho、Yanaka Saeko、Song Chihong、Satoh Tadashi、Yamazaki Chiaki、Kasahara Haruo、Shimazu Toru、Murata Kazuyoshi、Kato Koichi
    • 雑誌名

      npj Microgravity

      巻: 6 号: 1 ページ: 17-17

    • DOI

      10.1038/s41526-020-0107-y

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of amyloid β fibril formation under microgravity conditions2020

    • 著者名/発表者名
      Yagi-Utsumi Maho、Yanaka Saeko、Song Chihong、Satoh Tadashi、Yamazaki Chiaki、Kasahara Haruo、Shimazu Toru、Murata Kazuyoshi、Kato Koichi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2020.03.23.004341

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] NMR Characterization of Conformational Dynamics and Molecular Assemblies of Proteins2019

    • 著者名/発表者名
      Yagi-Utsumi Maho
    • 雑誌名

      Biological & Pharmaceutical Bulletin

      巻: 42 号: 6 ページ: 867-872

    • DOI

      10.1248/bpb.b19-00115

    • NAID

      130007657695

    • ISSN
      0918-6158, 1347-5215
    • 年月日
      2019-06-01
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ガングリオシド膜上におけるアミロイドβの構造転移2020

    • 著者名/発表者名
      矢木真穂
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 宇宙実験からアルツハイマー病の解明を目指す!2020

    • 著者名/発表者名
      矢木真穂
    • 学会等名
      第30回自然科学研究機構シンポジウム「宇宙科学と生命科学の深~いつながり」
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] NMR characterization of the conformations and interactions of amyloid-β on glycolipid membrane2020

    • 著者名/発表者名
      Maho Yagi-Utsumi
    • 学会等名
      7th International Postgraduate Conference on Pharmaceutical Sciences (iPOPS 2020)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Biophysical characterization of environment-dependent biomolecular assemblies2019

    • 著者名/発表者名
      Maho Yagi-Utsumi
    • 学会等名
      ExCELLS visit talks
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] NMR characterization of conformational transition of amyloid-β on ganglioside membrane2019

    • 著者名/発表者名
      Maho Yagi-Utsumi, Satoru G. Itoh, Hisashi Okumura, Katsuyuki Nishimura and Koichi Kato
    • 学会等名
      Frontier Bioorganization Forum 2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] NMR Study of Conformational Transition of Amyloid-β on Ganglioside Membrane2019

    • 著者名/発表者名
      Maho Yagi-Utsumi and Koichi Kato
    • 学会等名
      The 10th Toyota RIKEN International Worksyop on Science of Life Phenomena Woven by Water and Biomolecules
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Biophysical characterization of environment-dependent protein assemblies of physiological and pathological interest2019

    • 著者名/発表者名
      Maho Yagi-Utsumi and Koichi Kato
    • 学会等名
      第57回 日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] アルツハイマー病の解明を目指したNMR構造研究2019

    • 著者名/発表者名
      矢木真穂
    • 学会等名
      東京大学社会連携講座 革新分子構造解析講座:公開シンポジウム -低分子からタンパク質まで,統合分子構造解析-
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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