研究課題/領域番号 |
19K07074
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分47030:薬系衛生および生物化学関連
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研究機関 | 国立感染症研究所 |
研究代表者 |
林原 絵美子 国立感染症研究所, 細菌第二部, 室長 (20349822)
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研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2019年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
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キーワード | Phosphorothioate化修飾 / Helicobacter cinaedi / DNA修飾 / メチル化 / Helicobacter / Dnd遺伝子 / Restriction-Modification / Phosphorothioate DNA |
研究開始時の研究の概要 |
Helicobacter cinaediは菌血症や蜂窩織炎の原因菌として分離され,院内感染を起こす.申請者は,院内感染事例由来の特定のクローンにはDNAのPhosphorothioate(PT)化修飾を行うdnd遺伝子群が特異的に存在することを見出した.DNAのメチル化修飾は外来DNAから自己のDNAを守るRMシステムの一環であるだけでなく,遺伝子の発現調節を介して病原性や環境適応に寄与している.一方,PT化修飾は近年明らかになったDNA修飾であり,その役割には不明な点が多い.そこで,本研究ではH. cinaediの病原性や環境適応におけるPT化修飾の寄与を明らかにする.
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研究実績の概要 |
DNAのPhosphorothioate(PT)化修飾は最近近年明らかになった新規のDNA修飾であり,メチル化修飾では塩基がメチル化されるのに対し,PT化修飾ではデオキシリボースを繋ぐリン酸基の酸素が硫黄に置換される.メチル化修飾は外来DNAから自己のDNAを守るRestriction-Modification(RM)システムの一環であるだけでなく,遺伝子の発現調節を介して病原性や環境適応に寄与している.一方,PT化修飾の役割には不明な点が多い.そこで,本研究ではH. cinaediのPT化修飾が,病原性や環境適応においてどのような役割を果たしているのかに着目する. 今年度はCaco-2感染実験での評価とマウス感染実験での評価系を構築を行った。またSMRT法により同定したPT化の標的モチーフ(PT化されているのは一部のモチーフのみ)とトランスクリプトーム解析で発現変動のあった遺伝子について位置関係の解析を行った。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
評価系構築に時間を要したため。
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今後の研究の推進方策 |
病原性への影響の評価の結果を取りまとめ、Helicobacter属菌で初めてPT化標的部位を同定し、その役割について検討した報告として論文化する予定である。
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