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ヘリコバクター・シネディの特定のクローンに存在する新規のゲノム修飾の役割解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K07074
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分47030:薬系衛生および生物化学関連
研究機関国立感染症研究所

研究代表者

林原 絵美子  国立感染症研究所, 細菌第二部, 室長 (20349822)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2019年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードHelicobacter cinaedi / Phosphorothioate DNA / Phosphorothioate化修飾 / DNA修飾 / メチル化 / Helicobacter / Dnd遺伝子 / Restriction-Modification
研究開始時の研究の概要

Helicobacter cinaediは菌血症や蜂窩織炎の原因菌として分離され,院内感染を起こす.申請者は,院内感染事例由来の特定のクローンにはDNAのPhosphorothioate(PT)化修飾を行うdnd遺伝子群が特異的に存在することを見出した.DNAのメチル化修飾は外来DNAから自己のDNAを守るRMシステムの一環であるだけでなく,遺伝子の発現調節を介して病原性や環境適応に寄与している.一方,PT化修飾は近年明らかになったDNA修飾であり,その役割には不明な点が多い.そこで,本研究ではH. cinaediの病原性や環境適応におけるPT化修飾の寄与を明らかにする.

研究成果の概要

Helicobacter cinaediの院内感染由来クローンに特異的に存在するPhosphorothioate化修飾(PT化修飾)を行うdnd遺伝子群について、欠損株を作製し研究を行った。まずSMRT法によりPT化を解析した結果、全標的モチーフのうち8.9%がPT化されていた。トランスクリプトーム解析の結果、欠損株ではDccSRやPtmGをコードする遺伝子が有意に発現減少していた。またCaco-2細胞への感染実験により、dnd遺伝子群の欠損により細胞障害性は増加することが分かった。以上の研究成果はPT化修飾がH. cinaediの環境適応および病原性発現に寄与している可能性を示すものである。

研究成果の学術的意義や社会的意義

PT化修飾は近年明らかになったばかりの細菌特有のDNA修飾であり、本研究ではPT化修飾が環境応答や病原性に寄与している可能性を示した。Helicobacter cinaediは菌血症や蜂窩織炎の原因となる細菌であり、時に院内感染を引き起こす。今後H. cinaediの菌株間の環境適応能や病原性の違いにおけるPT化修飾の新たな役割が解明されることが期待される。

報告書

(6件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 2件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Characterization of HcaA, a novel autotransporter protein in <i>Helicobacter cinaedi</i> , and its role in host cell adhesion2023

    • 著者名/発表者名
      Aoki Sae、Mori Shigetarou、Matsui Hidenori、Shibayama Keigo、Kenri Tsuyoshi、Rimbara Emiko
    • 雑誌名

      mSphere

      巻: 8 号: 6

    • DOI

      10.1128/msphere.00403-23

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ヒトに感染するHelicobacter属菌について2023

    • 著者名/発表者名
      林原 絵美子
    • 雑誌名

      日本臨床微生物学会雑誌

      巻: 33 ページ: 1-11

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Characterization of HcaA, a novel autotransporter protein in Helicobacter cinaedi, and its role in host cell adhesion2022

    • 著者名/発表者名
      Aoki Sae、Mori Shigetarou、Matsui Hidenori、Shibayama Keigo、Kenri Tsuyoshi、Rimbara Emiko
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 517170-517170

    • DOI

      10.1101/2022.11.18.517170

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Determining Infected Aortic Aneurysm Treatment Using Focused Detection of Helicobacter cinaedi2022

    • 著者名/発表者名
      Jien Saito、Emiko Rimbara、Shingo Inaguma、Chihiro Hasegawa、Shinji Kamiya、Akihiro Mizuno、Yoshiaki Sone、Tatsuhito Ogawa、Yukihide Numata、Satoru Takahashi、Miki Asano
    • 雑誌名

      Emerging Infectious Diseases

      巻: 28 号: 7 ページ: 1494-1498

    • DOI

      10.3201/eid2807.212505

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 2 Establishment of a reference panel of Helicobacter pylori strains for antimicrobial susceptibility testing.2022

    • 著者名/発表者名
      Kenji Yokota, Takako Osaki, Shunji Hayashi, Shin-Ichi Yokota, Hiroaki Takeuchi, Emiko Rimbara, Hinako Ojima, Toyotaka Sato, Hideo Yonezawa, Keigo Shibayama, Kengo Tokunaga, Shigeru Kamiya, Kazunari Murakami, Mototsugu Kato, Toshiro Sugiyama
    • 雑誌名

      Helicobacter

      巻: Jun;27(3) 号: 3 ページ: 12874-12874

    • DOI

      10.1111/hel.12874

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Non-Helicobacter pylori Helicobacter (NHPH) positive gastric cancer2022

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Tomohiko、Lee Hyun Seok、Nam Su Youn、Katoh Hiroto、Ishibashi Yuko、Yamagata Murayama Somay、Matsui Hidenori、Masuda Hiroki、Rimbara Emiko、Sakurazawa Nobuyuki、Suzuki Hideyuki、Yoshida Hiroshi、Seto Yasuyuki、Ishikawa Shumpei、Jeon Seong Woo、Nakamura Masahiko、Nomura Sachiyo
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1038/s41598-022-08962-y

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of Helicobacter suis from human stomach2021

    • 著者名/発表者名
      Rimbara Emiko、Suzuki Masato、Matsui Hidenori、Nakamura Masahiko、Morimoto Misako、Sasakawa Chihiro、Masuda Hiroki、Nomura Sachiyo、Osaki Takako、Nagata Noriyo、Shibayama Keigo、Tokunaga Kengo
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 118 号: 13

    • DOI

      10.1073/pnas.2026337118

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Helicobacter suis Strain SNTW101c, Originally Isolated from a Patient with Nodular Gastritis2020

    • 著者名/発表者名
      Rimbara Emiko、Suzuki Masato、Matsui Hidenori、Nakamura Masahiko、Kobayashi Hirotaka、Mori Shigetarou、Shibayama Keigo
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 9 号: 1

    • DOI

      10.1128/mra.01340-19

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Characterization of novel autotransporter protein HcaA in Helicobacter cinaedi2023

    • 著者名/発表者名
      青木 沙恵、森 茂太郎、松井 英則、柴山 恵吾、見理 剛、林原 絵美子
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Helicobacter cinaedi における新規病原因子の特徴および役割の解明2023

    • 著者名/発表者名
      青木 沙恵、森 茂太郎、松井 英則、柴山 恵吾、見理 剛、林原 絵美子
    • 学会等名
      第29回日本ヘリコバクター学会 学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of novel autotransporter protein HcaA in Helicobacter cinaedi2022

    • 著者名/発表者名
      Sae Aoki, Shigetarou Mori, Hidenori Matsui, Keigo Shibayama, Tsuyoshi Kenri, Emiko Rimbara
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Isolation and characterization of non-Helicobacter pylori Helicobacter species infecting human stomach2022

    • 著者名/発表者名
      Emiko Rimbara
    • 学会等名
      The 21th International Workshop on Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Characterization Of Helicobacter Suis Isolated From Human Stomach2022

    • 著者名/発表者名
      Rimbara E, Suzuki M, H. Matsui, M. Nakamura, M. Morimoto, C. Sasakawa, H. Masuda, S. Nomura, T. Osaki, N. Nagata, K. Shibayama, K. Tokunaga
    • 学会等名
      World Microbe Forum
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヒト胃に感染するヘリコバクター・スイスについて2022

    • 著者名/発表者名
      林原絵美子
    • 学会等名
      第91回日本感染症学会西日本地方会学術集会、第64回日本感染症学会中日本地方会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 3.イヌおよびネコの胃生検組織から分離された2つの新種Helicobacter属菌2022

    • 著者名/発表者名
      青木 沙恵、鈴木 仁人,森 茂太郎,柴山 恵吾,大野 耕一,見理 剛,林原 絵美子
    • 学会等名
      第104回日本細菌学会関東支部総会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Bacterial and genomic characteristics of non-Helicobacter pylori Helicobacter species, including Helicobacter suis2022

    • 著者名/発表者名
      Rimbara E, Suzuki M, Tokunaga K, Mabe K, Nanjo S, Aoki S, Matsui H, Ohno K, Shibayama K, Kenri T.
    • 学会等名
      第27回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 胃MALTリンパ腫におけるHelicobacter suis感染の関与2020

    • 著者名/発表者名
      徳永 健吾 , 林原 絵美子 , 松井 英則 , 鈴木 仁人 , 大崎 敬子 , 井田 陽介 , 三好 佐和子 , 長濱 清隆 , 大野 亜希子 , 三好 潤 , 柴山 恵吾 , 久松 理一 , 岡本 晋
    • 学会等名
      第100回日本消化器内視鏡学会総会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Helicobacter suis胃粘膜感染と病態発症2020

    • 著者名/発表者名
      鈴木 仁人, 林原 絵美子, 松井 英則, 徳永 健吾, 柴山 恵吾
    • 学会等名
      日本ヘリコバクター学会第26回学術集会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Helicobacter suis SNTW101株の培養成功と完全ゲノム配列の決定2020

    • 著者名/発表者名
      林原 絵美子(国立感染症研究所 細菌第二部), 松井 英則, 鈴木 仁人, 中村 正彦, 柴山 恵吾, 徳永 健吾
    • 学会等名
      日本ヘリコバクター学会第26回学術集会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Antimicrobial resistance in Helicobacter cinaedi2020

    • 著者名/発表者名
      林原絵美子、森茂太郎、金玄、鈴木仁人、柴山恵吾
    • 学会等名
      第93回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヘリコバクター・スイス感染症の診断のための定期健康診断の提案2020

    • 著者名/発表者名
      松井 英則, 林原 絵美子, 鈴木 仁人, 柴山 恵吾
    • 学会等名
      第93回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Helicobacter suis SNTW101株の培養成功と完全ゲノム配列の決定2019

    • 著者名/発表者名
      林原絵美子、松井英則、鈴木仁人、中村正彦、柴山恵吾
    • 学会等名
      第25回日本ヘリコバ クター学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 培養、血清抗体を含めた新たな診断法- ヘリコバクター・スイス感染の迅速検査法の開発(II)2019

    • 著者名/発表者名
      松井 英則, 林原 絵美子, 鈴木 仁人, 柴山 恵吾, 村山 そう明, 寺尾 秀一, 下山 克, 間部 克裕, 中村 正彦
    • 学会等名
      第25回日本ヘリコバ クター学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2025-01-30  

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