次世代シーケンス技術を活用した子宮肉腫のゲノム病理学的研究

• 研究課題/領域番号: 19K07433
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分49020:人体病理学関連
• 研究機関: 金沢大学 (2021); 大阪大学 (2019-2020)
• 研究代表者: 前田 大地 金沢大学, 医学系, 教授 (30585500)
• 研究分担者: 後藤 明輝 秋田大学, 医学系研究科, 教授 (90317090)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2022-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2021年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: 子宮肉腫 / 子宮間葉系腫瘍

研究開始時の研究の概要

子宮肉腫の遺伝子変異、融合遺伝子を検出するにあたって、次世代シーケンサー(NGS)を活用する。まず、独自の技術を用いて既知の子宮肉腫関連の遺伝子異常を網羅する遺伝子パネルを構築し、約80例の子宮肉腫ホルマリン固定検体を対象にターゲットシーケンスを行う。並行して凍結検体を用いた全ゲノム解析を施行し、新規遺伝子異常の同定を目指す。これらを統合して子宮肉腫のgenomic landscapeを描く。

研究成果の概要

子宮肉腫の背景遺伝子異常については未だ不明な部分が多い。また、子宮肉腫の組織分類は、変遷が続いており、病理診断の現場では少なからず混乱が生じている。本研究では、子宮肉腫の遺伝子変異、融合遺伝子を検出するにあたって、次世代シーケンサー(NGS)を活用した。具体的には多数の遺伝子を網羅する独自のパネルを構築し、それらを用いて診断困難な子宮肉腫の背景遺伝子異常を探索した。その結果、JAZF1融合遺伝子を有する子宮内膜間質肉腫のみならず、GREB1融合遺伝子を有する稀な腫瘍の同定に至っている。

研究成果の学術的意義や社会的意義

子宮肉腫の成り立ちを背景遺伝子異常の観点から整理し、より正確な病理診断を可能とすることで、適切な治療への誘導が可能になると考えられる。子宮肉腫に関しては様々な融合遺伝子の存在が知られるようになってきている。我々が開発した遺伝子パネルはその多くをカバーするもので、それを用いて今後、多数例の検討を行うことで、日本人の子宮肉腫の全貌を明らかにしていくことが可能だと考えいてる。

研究成果

• [雑誌論文] Overexpression of HIF1α in Hunner Lesions of Interstitial Cystitis: Pathophysiological Implications (2022)
  • 著者名/発表者名: Akiyama Yoshiyuki、Miyakawa Jimpei、O’Donnell Michael A.、Kreder Karl J.、Luo Yi、Maeda Daichi、Ushiku Tetsuo、Kume Haruki、Homma Yukio
  • 雑誌名: Journal of Urology 巻: 207 号: 3 ページ: 635-646
  • DOI: 10.1097/ju.0000000000002278
• [雑誌論文] Disorganization of intercalated discs in dilated cardiomyopathy (2021)
  • 著者名/発表者名: Ito Yukinobu、Yoshida Makoto、Masuda Hirotake、Maeda Daichi、Kudo-Asabe Yukitsugu、Umakoshi Michinobu、Nanjo Hiroshi、Goto Akiteru
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 号: 1 ページ: 11852-11852
  • DOI: 10.1038/s41598-021-90502-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Detection of MED12 mutations in mesenchymal components of uterine adenomyomas (2021)
  • 著者名/発表者名: Kito Masahiko、Maeda Daichi、Kudo-Asabe Yukitsugu、Tamura Daisuke、Makino Kenichi、Sageshima Masato、Nanjo Hiroshi、Terada Yukihiro、Goto Akiteru
  • 雑誌名: Human Pathology 巻: 109 ページ: 31-36
  • DOI: 10.1016/j.humpath.2020.11.013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Severe Abdominal Recurrence of Low-grade Endometrial Stromal Sarcoma After Hysteroscopic Surgery (2021)
  • 著者名/発表者名: TAMURA DAISUKE、MAEDA DAICHI、ENOMOTO KATSUHIKO、SATO HIROKAZU
  • 雑誌名: Anticancer Research 巻: 41 号: 8 ページ: 4013-4016
  • DOI: 10.21873/anticanres.15199
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive immunohistochemical analysis of the gastrointestinal and M?llerian phenotypes of 139 ovarian mucinous cystadenomas (2021)
  • 著者名/発表者名: Halimi Sultan Ahmad、Maeda Daichi、Ushiku-Shinozaki Aya、Goto Akiteru、Oda Katsutoshi、Osuga Yutaka、Fujii Tomoyuki、Ushiku Tetsuo、Fukayama Masashi
  • 雑誌名: Human Pathology 巻: 109 ページ: 21-30
  • DOI: 10.1016/j.humpath.2020.11.011
  • 査読あり
• [雑誌論文] E74-Like Factor 3 Is a Key Regulator of Epithelial Integrity and Immune Response Genes in Biliary Tract Cancer (2020)
  • 著者名/発表者名: Suzuki Masami、Saito-Adachi Mihoko、Arai Yasuhito、Fujiwara Yuko、Takai Erina、Shibata Shinsuke、Seki Masahide、Rokutan Hirofumi、Maeda Daichi、Horie Masafumi、Suzuki Yutaka、Shibata Tatsuhiro、Kiyono Tohru、Yachida Shinichi
  • 雑誌名: Cancer Research 巻: 81 号: 2 ページ: 489-500
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-19-2988
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Myoepithelioma-like Hyalinizing Epithelioid Tumor of the Foot Harboring an OGT-FOXO1 Fusion (2020)
  • 著者名/発表者名: Yorozu Takashi、Nagahama Kiyotaka、Morii Takeshi、Maeda Daichi、Yoshida Akihiko、Mori Taisuke、Hayashi Akimasa、Shibahara Junji
  • 雑誌名: American Journal of Surgical Pathology 巻: 45 号: 2 ページ: 287-290
  • DOI: 10.1097/pas.0000000000001539
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] Detection of MEAF6‐PHF1 translocation in an endometrial stromal nodule (2020)
  • 著者名/発表者名: Nomura Yusuke、Tamura Daisuke、Horie Masafumi、Sato Masakazu、Sasaki Shinya、Yamamoto Yohei、Kudo‐Asabe Yukitsugu、Umakoshi Michinobu、Koyama Kei、Makino Kenichi、Takashima Shinogu、Imai Kazuhiro、Minamiya Yoshihiro、Munakata Satoru、Yachida Shinichi、Terada Yukihiro、Goto Akiteru、Maeda Daichi
  • 雑誌名: Genes, Chromosomes and Cancer 巻: 59 号: 12 ページ: 702-708
  • DOI: 10.1002/gcc.22892
  • NAID: 120007089057
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Clinicopathological and molecular analyses of linearly expanded epithelial cells with β‐catenin alterations, “β‐catenin signature”, in the normal fallopian tube (2020)
  • 著者名/発表者名: Koyama Kei、Maeda Daichi、Kito Masahiko、Tamura Daisuke、Kudo‐Asabe Yukitsugu、Katoh Hiroto、Ishikawa Shumpei、Nanjo Hiroshi、Terada Yukihiro、Goto Akiteru
  • 雑誌名: Histopathology 巻: 77 号: 6 ページ: 880-889
  • DOI: 10.1111/his.14227
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Differential expression of human papillomavirus 16-, 18-, 52-, and 58-derived transcripts in cervical intraepithelial neoplasia (2020)
  • 著者名/発表者名: Baba S, Taguchi A, Kawata A, Hara K, Eguchi S, Mori M, Adachi K, Mori S, Iwata T, Mitsuhashi A, Maeda D, Komatsu A, Nagamatsu T, Oda K, Kukimoto I, Osuga Y, Fujii T, Kawana K.
  • 雑誌名: Virol J 巻: 17 号: 1 ページ: 32-32
  • DOI: 10.1186/s12985-020-01306-0
  • NAID: 120007089054
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Post-mortem Plasma Cell-Free DNA Sequencing: Proof-of-Concept Study for the "Liquid Autopsy". (2020)
  • 著者名/発表者名: Ito Y, Yoshida M, Inoue T, Habuchi T, Ikoma S, Katoh H, Kato M, Shibata T, Ishikawa S, Yachida S, Goto A.
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 10(1) 号: 1 ページ: 2120-2120
  • DOI: 10.1038/s41598-020-59193-y
  • NAID: 120007089050
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] An extragonadal yolk sac tumor presumed to be of postmeiotic germ cell origin by genetic zygosity analysis via single nucleotide polymorphism array (2019)
  • 著者名/発表者名: Tamura Daisuke、Maeda Daichi、Sato Toshiharu、Sugawara Tae、Shirasawa Hiromitsu、Shimizu Dai、Sato Naoki、Goto Akiteru、Terada Yukihiro
  • 雑誌名: Genes, Chromosomes and Cancer 巻: 59 号: 3 ページ: 209-213
  • DOI: 10.1002/gcc.22817
  • NAID: 120007089058
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Safety and efficacy of mucosal immunotherapy using human papillomavirus (HPV) type 16 E7-expressing Lactobacillus-based vaccine for the treatment of high-grade squamous intraepithelial lesion (HSIL): the study protocol of a randomized placebo-controlled clinical trial (MILACLE study), (2019)
  • 著者名/発表者名: Ikeda Y, Uemura Y, Asai-Sato M, Nakao T, Nakajima T, Iwata T, Akiyama A, Satoh T, Yahata H, Kato K, Maeda D, Aoki D, Kawana K
  • 雑誌名: Jap J Clin Oncol, 巻: 49(9) 号: 9 ページ: 877-880
  • DOI: 10.1093/jjco/hyz095
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Gallbladder cancer harboring ERBB2 mutation on the primary and metastatic site: A case report (2019)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Chiaki、Maeda Daichi、Kimura Akie、Otsuru Toru、Iwagami Yoshifumi、Nishida Naohiro、Sakai Daisuke、Shitotsuki Ryo、Yachida Shinichi、Doki Yuichiro、Satoh Taroh
  • 雑誌名: World Journal of Gastrointestinal Oncology 巻: 11 号: 9 ページ: 761-767
  • DOI: 10.4251/wjgo.v11.i9.761
  • NAID: 120007089055
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Distribution of Tattoo Pigment in Lymph Nodes Dissected for Gynecological Malignancy (2019)
  • 著者名/発表者名: Tamura Daisuke、Maeda Daichi、Terada Yukihiro、Goto Akiteru
  • 雑誌名: International Journal of Surgical Pathology 巻: 27 号: 7 ページ: 773-777
  • DOI: 10.1177/1066896919846395
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Taxonomy of Interstitial Cystitis/Bladder Pain Syndrome Based on Whole Transcriptome Profiling by Next-Generation RNA Sequencing of Bladder Mucosal Biopsies (2019)
  • 著者名/発表者名: Akiyama Yoshiyuki、Maeda Daichi、Katoh Hiroto、Morikawa Teppei、Niimi Aya、Nomiya Akira、Sato Yusuke、Kawai Taketo、Goto Akiteru、Fujimura Tetsuya、Fukuhara Hiroshi、Nakagawa Tohru、Igawa Yasuhiko、Ishikawa Shumpei、Fukayama Masashi、Kume Haruki、Homma Yukio
  • 雑誌名: Journal of Urology 巻: 202 号: 2 ページ: 290
  • DOI: 10.1097/ju.0000000000000234
  • 査読あり / 国際共著