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DNAメチル化を標的とするリキッドバイオプシーを用いた膵癌診断技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19K07771
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
研究機関東北大学

研究代表者

顧 兆悌  東北大学, 医学系研究科, 非常勤講師 (40451520)

研究分担者 元井 冬彦  山形大学, 医学部, 教授 (30343057)
畠 達夫  東北大学, 医学系研究科, 大学院非常勤講師 (30806237)
福重 真一  東北大学, 医学系研究科, 特任教授 (90192723)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード癌 / ゲノム / 遺伝子 / 膵癌 / DNAメチル化 / リキッドバイオプシー / デジタルPCR / qMSP
研究開始時の研究の概要

血漿中の癌特異的なドライバー遺伝子変異などを調べる「リキッドバイオプシー」は診断に有効であるが、臨床応用には、さらなる検出感度の向上が重要である。これまで申請者らは、膵癌における高メチル化遺伝子の探索をおこない、膵癌特異的に高率にメチル化され、転写抑制される6遺伝子(NEFL、NEFM、NEFH、NPTX2、IRX4、LHX6)を明らかにした。これら遺伝子の再活性化はいずれも膵癌細胞の増殖抑制を引き起こすことから膵腫瘍形成における重要な役割が示唆された。本研究では、これら6遺伝子のDNAメチル化を標的とするリキッドバイオプシーの技術開発をおこない、早期診断への可能性や予後との関連を調べる。

研究成果の概要

本研究では、我々が独自に開発した高メチル化遺伝子探索法MeTAにより膵癌特異的に高率にメチル化され、転写抑制される6遺伝子のDNAメチル化を標的とするリキッドバイオプシーの技術開発を検討した。膵癌を含めた膵疾患患者の血漿2 mLから得られたcfDNA量は平均17.4 ngであり、高分子のバンドラダーを検出できなかった。現時点でのDNAメチル化の検出は難しいが、血漿サンプリング法やメチル化DNA濃縮法などの検討が必要である。一方、MeTAで同定されたLHX6遺伝子の解析から高メチル化による転写抑制は膵癌細胞の増殖に重要な役割を果たすことを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

MeTAにより同定された膵癌特異的メチル化遺伝子LHX6が膵癌の増殖に関係することから、膵癌の診断、治療のターゲットになる可能性もあり、さらなる検討が必要である。
また、本研究から膵疾患患者の血漿から得られるcfDNA量、品質では、現状でDNAメチル化解析に用いることは困難であることがわかった。DNAメチル化を用いたリキッドバイオプシーは、膵癌の早期診断に重要であることから、膵疾患のcfDNAの量、質をカバーするあらたな方法を見つけ出す必要がある。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [国際共同研究] University of Chittagong(バングラデシュ)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Epigenetic inactivation of IRX4 is responsible for acceleration of cell growth in human pancreatic cancer2020

    • 著者名/発表者名
      Kanchan Chakma, Zhaodi Gu, Yakefujiang Abudurexiti, Tatsuo Hata, Fuyuhiko Motoi, Michiaki Unno, Akira Hori, Shinichi Fukushige
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 111 号: 12 ページ: 4594-4604

    • DOI

      10.1111/cas.14644

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Methylation-mediated Silencing of the LIM Homeobox 6 (LHX6) Gene Promotes Cell Proliferation in Human Pancreatic Cancer2020

    • 著者名/発表者名
      Yakefujiang Abudurexiti, Zhaodi Gu, Kanchan Chakma, Tatsuo Hata, Fuyuhiko Motoi, Michiaki Unno, Akira Horii, Shinichi Fukushige
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun

      巻: - 号: 3 ページ: 626-632

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.03.120

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] LHX6はエピジェネティックに不活性化される膵癌の癌抑制遺伝子候補である2019

    • 著者名/発表者名
      ヤクブアブドゥリシディ、堀井明、元井冬彦、海野倫明、福重真一
    • 学会等名
      第78回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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