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深層学習による画像解析を用いた顕微鏡画像からの新規抗動脈硬化治療薬の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19K08549
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分53020:循環器内科学関連
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

楠本 大  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 助教 (70571727)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード血管老化 / 細胞老化 / 人工知能 / 畳み込みニューラルネットワーク / 新規評価指標 / 細胞形態 / Deep-SeSMo / 血管内皮細胞 / 動脈硬化 / 薬剤スクリーニング / 深層学習 / 抗老化
研究開始時の研究の概要

近年わが国でも動脈硬化を基盤とした心筋梗塞や脳梗塞への罹患率は上昇している。動脈硬化の進展において、血管内皮細胞の細胞老化が重要であることが近年数多く報告されている。本研究では、近年大発展を遂げている深層学習の技術をの用いて、細胞老化をを抑制できるような薬剤の開発を行い、動脈硬化を抑制可能な薬剤開発を目標としている。本研究の遂行により、動脈硬化のみならず、加齢関連疾患や老化などを抑制可能な薬剤開発につながる可能性もある。

研究成果の概要

昨今、加齢関連疾患の病態において細胞老化が重要な位置付けを占めていることが報告されている。特に、血管内皮細胞の老化は様々な臓器の病態進行に重要であることから、新規の治療標的であると考えられる。本研究では、人工知能技術の一つである畳み込みニューラルネットワークを用いて、細胞形態を指標として血管内皮細胞の老化度合いを定量的評価する技術(Deep-SeSMo)を開発した。Deep-SeSMoは分子生物学的ラベルを用いることなく、簡単な顕微鏡撮影のみで細胞老化が評価可能であり、ラベルフリーで薬剤スクリーニングが実行可能である。同システムを用いることで血管老化を抑制する候補化合物を同定した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では畳み込みニューラルネットワークを用いて、細胞老化の程度を高い精度を持って定量的に評価可能であることが判明した。従来、画像解析を用いて疾患細胞を分類することは可能であったが、本研究では学習済みモデルを用いて確率分布に従って出力を行うことで、その病的中間状態に対して定量的な連続評価を可能にしたことは新規性が非常に高い。本技術は、病的細胞評価方法の基盤的技術となる可能性があり、さらなる発展が期待される。また血管老化による臓器障害は今後もさらに増加することが予想されることから、本技術を用いて血管老化抑制薬の探索が進むことが期待される。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 2件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Coupling of angiogenesis and odontogenesis orchestrates tooth mineralization in mice2022

    • 著者名/発表者名
      Matsubara T, Iga T, Sugiura Y, Kusumoto D, Sanosaka T, Tai-Nagara I, Takeda N, Fong GH, Ito K, Ema M, Okano H, Kohyama J, Suematsu M, *Kubota Y.
    • 雑誌名

      J Exp Med

      巻: 219 号: 4

    • DOI

      10.1084/jem.20211789

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Tumor-specific inter-endothelial adhesion mediated by FLRT2 facilitates cancer aggressiveness2022

    • 著者名/発表者名
      Ando T, Tai-Nagara I, Sugiura Y, Kusumoto D, Okabayashi K, Kido Y, Sato Kohji, Saya H, Navankasattusas S, Li DY, Suematsu M, Kitagawa Y, Seiradake E, Yamagishi S, *Kubota Y.
    • 雑誌名

      J Clin Invest

      巻: 132 号: 6 ページ: 153626-153626

    • DOI

      10.1172/jci153626

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Anti-senescent drug screening by deep learning-based morphology senescence scoring2021

    • 著者名/発表者名
      Kusumoto Dai、Seki Tomohisa、Sawada Hiromune、Kunitomi Akira、Katsuki Toshiomi、Kimura Mai、Ito Shogo、Komuro Jin、Hashimoto Hisayuki、Fukuda Keiichi、Yuasa Shinsuke
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 257-257

    • DOI

      10.1038/s41467-020-20213-0

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The application of convolutional neural network to stem cell biology.2019

    • 著者名/発表者名
      Kusumoto D, Yuasa S
    • 雑誌名

      Inflamm Regen.

      巻: 39 号: 1

    • DOI

      10.1186/s41232-019-0103-3

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Artificial Intelligence for Vascular biology2022

    • 著者名/発表者名
      楠本 大
    • 学会等名
      血管生物若手研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Anti-senescent drug screening by deep learning-based morphology senescence scoring2020

    • 著者名/発表者名
      Dai Kusumoto, Tomohisa Seki, Hiromune Sawada, Toshiomi Katsuki, Mai Kimura, Shogo Itoh, Jin Komuro, Hisayuki Hashimoto, Keiichi Fukuda, and Shinsuke Yuasa
    • 学会等名
      American Heart Association Scientific Sessions 2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Deep learning-based drug screening system to develop novel cardiovascular treatment2020

    • 著者名/発表者名
      Dai Kusumoto
    • 学会等名
      第4回日本循環器学会基礎研究フォーラム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 深層学習を用いた画像解析による抗血管老化薬スクリーニングと新規抗老化薬の同定2019

    • 著者名/発表者名
      楠本 大、 澤田 拓宗、関 倫久、勝木 俊臣 木村 舞、小室 仁、橋本 寿之、湯浅 慎介、福田 恵一
    • 学会等名
      日本血管生物医学会学術集会.
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 深層学習を用いた画像認識システムの疾患創薬への応用.2019

    • 著者名/発表者名
      楠本 大、 湯浅 慎介、福田 恵一
    • 学会等名
      日本循環制御医学会.
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [備考] AI画像認識により細胞の老化度をスコア化、血管老化を抑制する薬剤候補同定に成功

    • URL

      https://www.keio.ac.jp/ja/press-releases/2021/1/12/28-77467/

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [産業財産権] プログラム、スクリーニング方法、至適濃度の特定方法、薬剤剤造方法、モデル生成方法、情報処理方法、及び情報処理装置2022

    • 発明者名
      楠本 大
    • 権利者名
      株式会社Heartseed社
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 外国

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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