| 研究課題/領域番号 |
19K08938
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(C)
|
| 配分区分 | 基金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 審査区分 |
小区分54030:感染症内科学関連
|
|---|
| 研究機関 | 地方独立行政法人東京都健康長寿医療センター(東京都健康長寿医療センター研究所) (2020-2021)
東京女子医科大学 (2019) |
|---|
研究代表者 |
吉田 敦 地方独立行政法人東京都健康長寿医療センター(東京都健康長寿医療センター研究所), 東京都健康長寿医療センター研究所, 研究員 (40364541)
|
|---|
| 研究分担者 |
菊池 賢 東京女子医科大学, 医学部, 教授 (60214748)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2021年度)
|
| 配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
|
|---|
| キーワード | 迅速発育抗酸菌 / 同定 / 薬剤感受性 / 誘導耐性 / ゲノム解析 / non-coding RNA / 抗酸菌 / ゲノム / 治療 / 感染症 |
|---|
| 研究開始時の研究の概要 |
1．迅速発育抗酸菌（RGM)のnon-coding RNAに関する基礎的検討
我々は既に全国から収集した臨床分離RGM（400株以上）について同定・薬剤耐性のデータを得ている。これまでの全ゲノムデータから、RGMの病原性や薬剤耐性に関わりうるnon-coding RNA領域の候補を探し、それらが臨床分離株でどのように保有されているのか、変異は何か、解析する。
2．non coding RNAと薬剤感受性との相関および新規抑制物質の探索
1．の研究から新たな候補物質探索の可能性の見通しを明らかにする。一方でnon-coding RNA領域を修飾し、菌の増殖抑制を来しうる候補物質/方法を探索する。
|
| 研究成果の概要 |
迅速発育抗酸菌を全国から500株以上収集し、遺伝子同定、薬剤感受性、マクロライド耐性機構の結果を得た。検体間、分離地域間で菌種に差があること、およびM. abscessus感染症の新たな治療の選択肢について報告することができた。分離株の全ゲノム解析では、外来性の因子との関連を明らかにするとともに、同一患者由来で、複数の薬剤に誘導耐性を獲得したM. abscessus 5株について、SNPの変異が経時的に増加することを見出した。この5株間の比較で、クラリスロマイシン投与下で発現が増加するRNAを見出しており、詳細な解析を実施しているところである。
|
| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
多数の迅速発育抗酸菌の臨床分離株を用いた解析により、アルベカシン、シタフロキサシン、リファブチンが治療選択のオプションとなりうることを示した。さらに下気道検体では有意にM. abscessusの割合が高いこと、北日本では有意にM. abscessusの分離割合が高いことを見出した。一方ゲノム解析では、臨床分離株はしばしば外来性の因子を有すること、さらに複数の薬剤に誘導耐性を有しても、SNPの変異数はそれほど多くは増加しないことが明らかになった。転写レベルでの変化が主体であると推測されたが、関与するRNA、non-coding RNAの同定には、条件検討を含む詳細な解析が必要であった。
|
