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ヒト型糖鎖生合成酵素と相同性を有する昆虫由来酵素群の構造機能相関解明と応用展開

研究課題

研究課題/領域番号 19K15748
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分38030:応用生物化学関連
研究機関静岡大学

研究代表者

宮崎 剛亜  静岡大学, グリーン科学技術研究所, 助教 (30775721)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード糖転移酵素 / 糖質加水分解酵素 / N結合型糖鎖 / O結合型糖鎖 / CAZy / 糖タンパク質 / X線結晶構造解析 / 昆虫 / クライオ電子顕微鏡 / カイコ / 糖鎖 / オリゴ糖 / スクロース
研究開始時の研究の概要

N結合型糖鎖はタンパク質の翻訳後修飾の一つであり、ヒトなどの真核生物においてあらゆる生理機能や疾患などに関与する極めて重要な役割を果たしている。医療用の糖タンパク質の生産方法として昆虫細胞やカイコ虫体を用いた発現系が検討されているが、昆虫のN結合型糖鎖の構造はヒトのそれとは異なる点が大きな問題となっている。一方で、昆虫にはヒト型糖鎖生合成に必須な酵素と類似するタンパク質の遺伝子をゲノム中に有しているが、それらの機能や構造はほとんど解明されていない。本研究では、これら昆虫の機能未知酵素群の構造や機能を明らかにし、これらを利用したヒト型糖鎖の合成や新規機能性糖質を創出することを目的とする。

研究成果の概要

糖タンパク質糖鎖生合成に関与するヒト由来酵素と配列相同性を有する昆虫由来糖転移酵素および糖質加水分解酵素に着目し、カイコ由来β-1,4-GalNAc転移酵素の機能と他の糖転移酵素の一部のドメインの立体構造と機能を明らかにした。カイコ由来α-L-フコシダーゼとα-N-アセチルガラクトサミニダーゼの糖タンパク質糖鎖に対する基質特異性を明らかにした。その他の糖質関連酵素として、2種類のカイコ由来スクロース分解酵素、糖鎖に作用する2種類の腸内細菌由来酵素、N結合型糖鎖前駆体の部分構造であるコージビオースとニゲロースをそれぞれ特異的に加水分解する2種類のバクテリア由来新規酵素の立体構造を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

糖鎖はあらゆる生理機能や疾患、細菌やウイルスの感染に関与しているため、創薬・医療の観点からも重要な研究対象である。本研究においてヒトと昆虫の酵素活性と構造の違いを明らかにしたことから、昆虫細胞や虫体を用いたヒト型糖タンパク質生産の基盤構築に寄与するものと考えらえる。また、糖鎖およびその部分構造に高い特異性を持つ複数の酵素を発見し、その立体構造を明らかにしたことから、酵素を利用した糖鎖の加工技術の開発に応用できる可能性を示した。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (45件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 2件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (26件) (うち国際学会 4件、 招待講演 1件) 図書 (1件) 備考 (3件)

  • [国際共同研究] University of Vienna(オーストリア)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] UCT, Prague/Czech Academy of Sciences(チェコ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Vienna(オーストリア)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] UCT, Prague(チェコ)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Structural and mechanistic insights into the substrate specificity and hydrolysis of GH31 α-N-acetylgalactosaminidase2022

    • 著者名/発表者名
      Takatsugu Miyazaki, Marina Ikegaya, Santiago Alonso-Gil
    • 雑誌名

      Biochimie

      巻: 195 ページ: 90-99

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2021.11.007

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Unlocking the hydrolytic mechanism of GH92 α‐1,2‐mannosidases: Computation inspires the use of C‐glycosides as Michaelis complex mimics2022

    • 著者名/発表者名
      Santiago Alonso‐Gil, Kamil Parkan, Jakub Kaminsky, Radek Pohl, Takatsugu Miyazaki
    • 雑誌名

      Chemistry - A European Journal

      巻: 28 号: 14

    • DOI

      10.1002/chem.202200148

    • NAID

      120007193746

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural basis of the strict specificity of a bacterial GH31 α-1,3-glucosidase for nigerooligosaccharides2022

    • 著者名/発表者名
      Marina Ikegaya, Toshio Moriya, Naruhiko Adachi, Masato Kawasaki, Enoch Y. Park, Takatsugu Miyazaki
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 298 号: 5 ページ: 101827-101827

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.101827

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure of a bacterial α-1,2-glucosidase defines mechanisms of hydrolysis and substrate specificity in GH65 family hydrolases2021

    • 著者名/発表者名
      Shuntaro Nakamura, Takanori Nihira, Rikuya Kurata, Hiroyuki Nakai, Kazumi Funane, Enoch Y. Park, Takatsugu Miyazaki
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 297 号: 6 ページ: 101366-101366

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.101366

    • NAID

      120007174372

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Biochemical characterization of Bombyx mori α-N-acetylgalactosaminidase belonging to the glycoside hydrolase family 312021

    • 著者名/発表者名
      Marina Ikegaya, Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • 雑誌名

      Insect Molecular Biology

      巻: - 号: 4 ページ: 367-378

    • DOI

      10.1111/imb.12701

    • NAID

      120007008554

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure-function analysis of silkworm sucrose hydrolase uncovers the mechanism of substrate specificity in GH13 subfamily 17 exo-α-glucosidases2020

    • 著者名/発表者名
      Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 295 号: 26 ページ: 8784-8797

    • DOI

      10.1074/jbc.ra120.013595

    • NAID

      120006845708

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Crystal structure of the Enterococcus faecalis α-N-acetylgalactosaminidase, a member of the glycoside hydrolase family 312020

    • 著者名/発表者名
      Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 594 号: 14 ページ: 2282-2293

    • DOI

      10.1002/1873-3468.13804

    • NAID

      120006845707

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] カイコの糖鎖生物学と糖鎖工学-カイコの糖鎖構造改変と複合型糖鎖生合成酵素の解析2020

    • 著者名/発表者名
      宮崎 剛亜
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 58 ページ: 330-332

    • NAID

      130008046472

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] α-L-Fucosidase from Bombyx mori has broad substrate specificity and hydrolyzes core fucosylated N-glycans2020

    • 著者名/発表者名
      Shuntaro Nakamura, Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • 雑誌名

      Insect Biochemistry and Molecular Biology

      巻: 124 ページ: 103427-103427

    • DOI

      10.1016/j.ibmb.2020.103427

    • NAID

      120006860060

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural insight into the substrate specificity of Bombyx mori β-fructofuranosidase belonging to the glycoside hydrolase family 322020

    • 著者名/発表者名
      Takatsugu Miyazaki, Nozomi Oba, Enoch Y. Park
    • 雑誌名

      Insect Biochemistry and Molecular Biology

      巻: 127 ページ: 103494-103494

    • DOI

      10.1016/j.ibmb.2020.103494

    • NAID

      120006894646

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Biochemical characterization and mutational analysis of silkworm Bombyx mori β-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase and insight into the substrate specificity of β-1,4-galactosyltransferase family enzymes2019

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki T, Miyashita R, Nakamura S, Ikegaya M, Kato T, Park EY
    • 雑誌名

      Insect Biochemistry and Molecular Biology

      巻: 115 ページ: 103254-103254

    • DOI

      10.1016/j.ibmb.2019.103254

    • NAID

      120006763934

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Enterococcus faecalis由来GH31 α-N-アセチルガラクトサミニダーゼと基質との複合体構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      宮崎剛亜, 池谷真里奈, Alonso-Gil Santiago
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] GH65 α-1,2-グルコシダーゼとグルコシダーゼ阻害剤の複合体構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      中村駿太郎, 朴龍洙, 宮崎剛亜
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 糖質加水分解酵素ファミリー31に属するα-1,3-グルコシダーゼの構造と基質特異性の相関の解析2022

    • 著者名/発表者名
      池谷真里奈, 朴龍洙, 宮崎剛亜
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 糖質加水分解酵素ファミリー31に属するα-1,3-グルコシダーゼのX線結晶構造およびクライオ電子顕微鏡構造2022

    • 著者名/発表者名
      池谷真里奈, 守屋俊夫, 安達成彦, 川崎政人, 朴龍洙, 宮崎剛亜
    • 学会等名
      2021年度量子ビームサイエンスフェスタ
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of a glycoside hydrolase family 97 enzyme from Flavobacterium johnsoniae2022

    • 著者名/発表者名
      Rikuya Kurata, Shuntaro Nakamura, Enoch Y. Park, Takatsugu Miyazaki
    • 学会等名
      The 8th International Symposium toward the Future of Advanced Researches in Shizuoka University (ISFAR-SU2022)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] GH65 α-1,2-グルコシダーゼと1-deoxynojirimycinの複合体構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      中村駿太郎, 宮崎剛亜
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会中部支部名古屋講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 糖質加水分解酵素ファミリー31に属する細菌および真菌由来 α-1,3-グルコシダーゼの機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      池谷真里奈, 宮崎剛亜
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会中部支部名古屋講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] The GH92 enzymatic mechanism: computation inspires the use of C-glycosides as Michaelis complex mimics2021

    • 著者名/発表者名
      Santiago Alonso-Gil, Kamil Parkan, Jakub Kaminsky, Radek Pohl, Takatsugu Miyazaki
    • 学会等名
      EMBO Workshop: Advances and Challenges in Biomolecular Simulations
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] GH65 α-1,2-グルコシダーゼの多分岐デキストランおよびその部分構造に対する活性2021

    • 著者名/発表者名
      中村駿太郎, 中井博之, 朴龍洙, 宮崎剛亜
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会2021年度大会(第70回)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] GH31に属する新規α-1,3-グルコシダーゼの機能と構造の解析2021

    • 著者名/発表者名
      池谷真里奈, 朴龍洙, 宮崎剛亜
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会2021年度大会(第70回)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Flavobacterium johnsoniae由来GH97酵素の基質特異性の解析2021

    • 著者名/発表者名
      倉田陸矢, 中村駿太郎, 朴龍洙, 宮崎剛亜
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会2021年度大会(第70回)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 系統解析によって見出した GH31 ファミリーα-1,3-グルコシダーゼの機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      池谷 真里奈, 宮崎 剛亜
    • 学会等名
      生物工学若手研究者の集い 夏のオンラインセミナー2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] カイコが有する二種類のスクロース加水分解酵素の構造機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      宮崎 剛亜
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会東日本支部シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] α-L-Fucosidase from Bombyx mori has wide substrate specificity and hydrolyzes core-fucosylated N-glycans2021

    • 著者名/発表者名
      Shuntaro Nakamura, Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • 学会等名
      The 7th International Symposium toward the Future of Advanced Researches in Shizuoka University (ISFAR-SU2021)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Functional analysis of a glycoside hydrolase family 31 enzyme from Bombyx mori obtained via horizontal gene transfer2021

    • 著者名/発表者名
      Marina Ikegaya, Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • 学会等名
      The 7th International Symposium toward the Future of Advanced Researches in Shizuoka University (ISFAR-SU2021)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 糖質加水分解酵素ファミリー65に属するα-1,2-グルコシダーゼの基質認識機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      中村 駿太郎, 宮崎 剛亜
    • 学会等名
      2020年度量子ビームサイエンスフェスタ
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] カイコ由来 GH32 β-フルクトフラノシダーゼ BmSUC1の立体構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      宮崎 剛亜, 大場 望美, 朴 龍洙
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Flavobacterium johnsoniae由来α-1,2-グルコシダーゼの立体構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      中村 駿太郎, 中井 博之, 朴 龍洙, 宮崎 剛亜
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Enterococcus faecalis 由来GH31 α-N-アセチルガラクトサミニダーゼの構造機能解析2020

    • 著者名/発表者名
      宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会2020年度大会(第69回)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 水平伝播によって獲得したカイコ由来GH31 α-N-アセチルガラクトサミニダーゼの発現と機能の解析2020

    • 著者名/発表者名
      池谷 真里奈, 宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会2020年度大会(第69回)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Flavobacterium johnsoniae由来新奇α-1,2-グルコシダーゼの性質解析2020

    • 著者名/発表者名
      中村 駿太郎, 宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会2020年度大会(第69回)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] カイコ由来スクロース加水分解酵素の基質および阻害剤との複合体構造解析2020

    • 著者名/発表者名
      宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] カイコ由来α-N-アセチルガラクトサミニダーゼの酵素学的性質の解析2020

    • 著者名/発表者名
      池谷 真里奈, 宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] カイコ由来α-L-fucosidaseの糖タンパク質のN型糖鎖に対する活性の解析2020

    • 著者名/発表者名
      中村 駿太郎, 宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] カイコ由来 GH13_17 スクロース加水分解酵素のX線結晶構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会2019年度大会(第68回)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] カイコ由来 α-L-fucosidase の性質の解析2019

    • 著者名/発表者名
      中村 駿太郎, 宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • 学会等名
      日本応用糖質科学会2019年度大会(第68回)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] Green Science and Technology: Chapter 20. Glycobiology and Glycoengineering in Silkworm2019

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki T, Park EY
    • 総ページ数
      344
    • 出版者
      CRC Press
    • ISBN
      9780367415136
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [備考] 静岡大学農学部生物工学研究室宮崎グループWeb page

    • URL

      https://wwp.shizuoka.ac.jp/glycoenzyme/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
  • [備考] 静岡大学農学部生物工学研究室Web page

    • URL

      http://www.agr.shizuoka.ac.jp/c/biotech/

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 静岡大学生物工学研究室Web page

    • URL

      http://www.agr.shizuoka.ac.jp/c/biotech/

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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