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カキ小果変異体に着目した果実サイズ制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K15832
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分39030:園芸科学関連
研究機関京都大学

研究代表者

西山 総一郎  京都大学, 農学研究科, 助教 (50827566)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2019年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード果樹 / ゲノム / 倍数体 / トランスクリプトーム / 果実発達 / 果実品質 / 倍数性 / 器官サイズ / 全ゲノム解析 / 枝変わり
研究開始時の研究の概要

果樹における果実サイズは主要な育種対象の一つであり、これを自在に操ることは育種・栽培に関わる者の悲願である。‘突核無’はカキの九倍体品種‘平核無’の枝変わりであり、栽培ガキとしては特異に小果である。我々はこれをカキの果実サイズの遺伝解析を可能とする材料とみなして研究を行っている。これまでその高次倍数性や、栄養繁殖による多型の蓄積が常に解析のネックであったが、近年‘突核無’から元品種の‘平核無’と同様のサイズに成長する復帰体が複数得られている。本研究ではそれらの全ゲノムやトランスクリプトーム等の比較を行い、小果変異とその作用機作の解明を目指すものである。

研究成果の概要

本研究では、果実の商品価値を決定する重要な要素の一つである果実サイズについて、カキの主要栽培品種である九倍体 ‘平核無’ から生じた小果変異を対象に、ゲノミクスと果実生理の側面から解析した。今回対象とした小果変異体は、細胞サイズに違いはないが、細胞数が極めて少ない。開花期前後の子房組織の発達特性やトランスクリプトームを詳細に調査した結果、器官発達の速度が果実サイズと関連している可能性が示された。ゲノムデータも組合わせ、‘平核無’ のゲノム特性や、小果変異の果実成熟に対する多面発現のメカニズムと起源を推定することができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

果樹における果実サイズは主要な育種対象の一つであり、これを自在に操ることは育種・栽培に関わる者の悲願である。本研究では、園芸学上重要な果実サイズ多様性の基盤となる分子メカニズムの一端を明らかにした。果樹作物において果実サイズの制御メカニズムが明らかにされた例は極めて限られており、本研究の成果は重要である。また、本研究では、小果変異を制御する有力な候補遺伝子や、エピジェネティック制御と思われる新たな果実サイズ変異体を見出しており、今後この解析を通して果実サイズの人為改変に向けた新たな知見が得られると期待できる。

報告書

(3件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Frequent reversion and continuous size variation of a small fruit mutant 'Totsutanenashi' persimmon2021

    • 著者名/発表者名
      Sheng Wang, ChunLai Tam, Ippei Naito, Soichiro Nishiyama, and Ryutaro Tao
    • 雑誌名

      Acta Horticulturae

      巻: -

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] カキ’平核無’に生じた小果変異の起源と多面発現2021

    • 著者名/発表者名
      西山総一郎・Sheng Wang・ChunLai Tam・田尾龍太郎
    • 学会等名
      園芸学会令和3年度春季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Transcriptome Analysis on Fruit Size Control in ‘Totsutanenashi’ Persimmon2020

    • 著者名/発表者名
      Sheng Wang・ChunLai Tam・Soichiro Nishiyama・Ryutaro Tao
    • 学会等名
      3rd Asian Horticulture Congress
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 九倍体カキ’平核無’とその枝変わり群の系統分化2020

    • 著者名/発表者名
      西山総一郎・王盛・田尾龍太郎
    • 学会等名
      育種学会第138回講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] カキの果実発達を制御する遺伝子発現ネットワーク2019

    • 著者名/発表者名
      西山総一郎・尾上典之・河野淳・佐藤明彦・米森敬三・田尾龍太郎
    • 学会等名
      園芸学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2022-01-27  

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