| 研究課題/領域番号 |
19K16391
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| 研究種目 |
若手研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
小区分47050:環境および天然医薬資源学関連
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| 研究機関 | 国立研究開発法人理化学研究所 (2020-2021)
千葉大学 (2019) |
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研究代表者 |
Rai Amit (ライ アミット) 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (60760535)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2021年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
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| キーワード | Camptothecin / Medicinal plants / MIAs / Whole genome sequencing / Phytogenomics / Ophiorrhiza pumila / Comparative genomics / Systems biology / Metabolic gene clusters / Pangenome / Ophiorrhiza japonica / Evolution / Nothapodytes foetida / STR / Secoiridoids / Metabolic gene cluster / OpCYP1 / Pan-Genome / Genome analysis / Metabolite profiling / Specialized metabolites / Systems Biology / Indole Alkaloids / Biosynthesis |
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| 研究開始時の研究の概要 |
Camptothecin (CPT) is one of the most potent anti-cancer compound derived from the plant source. Lack of stable supply for CPT is a grave concern and the reason for the exorbitant cost for cancer treatment. This study aims to understand camptothecin biosynthesis in order to derive a sustainable source of its production.
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| 研究成果の概要 |
ここでは、Ophiorrhiza pumila, Ophiorrhiza japonica, および Nothapodytesfoetidaの高品質なゲノムアセンブリを報告します。 比較ゲノム解析は、カンプトテシン（CPT）生合成の出現を導いた重要な酵素としてストリクトシジンシンターゼ（STR）を示しました。 進化に向けた代謝遺伝子クラスターの重要性と、特殊な代謝物を合成する能力を維持することの重要性を示しました。 CPT生合成から推定代謝中間体を同定しました。 最後に、生合成経路に関連する候補遺伝子を特定するために、STRノックアウトラインを確立しました。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
This study have produced three high quality genome assemblies of important medicinal plants to explore evolutionary basis of camptothecin biosynthesis, one of the most potent anti-cancer drug in the world. Results and resources will be useful to establish sustainable source of camptothecin.
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