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次世代シークエンス解析を用いた新規てんかん遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 19K17307
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分52050:胎児医学および小児成育学関連
研究機関愛知医科大学 (2020-2023)
横浜市立大学 (2019)

研究代表者

東 慶輝  愛知医科大学, 医学部, 講師 (60628593)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード次世代シークエンス解析 / てんかん / てんかん症候群
研究開始時の研究の概要

小児期発症のてんかんでは年齢依存性に発症する一連のてんかん症候群が知られている。治療抵抗性の発作と精神運動発達遅滞を合併するてんかん性脳症について、遺伝学的な検索が現在も行われているが、既報遺伝子の検索では変異を同定できない症例も多く、未知の遺伝子を病因とする発症メカニズムの存在が推測される。当研究では、次世代シークエンサーなどの先進的な手法で新規てんかん遺伝子を探索することを目的とする。候補遺伝子については分子生物学的手法を用いた実験を行い、病原性の証明および発症メカニズムを明らかにすることで、難治とされるてんかん症候群において、新規の治療法につながる結果を得ることを目指している。

研究成果の概要

当研究では、次世代シークエンサーなどの先進的な手法で新規てんかん遺伝子を探索することを目的とした。期間中にてんかんなど神経疾患を中心とする症例76例の次世代シークエンス解析を担当した。このうち、26例に既報の責任遺伝子に変異を同定し、2例に病原性を有すると考えられるcopy number variationを同定した。過去に報告のなかった遺伝子にde novoのミスセンス変異を有する症例について、新規責任遺伝子の可能性を考えて国際的なデータベースに登録し、他施設の症例とあわせて報告の準備を行っている。

研究成果の学術的意義や社会的意義

次世代シークエンサーを用いた遺伝学的解析を用いて、既報の遺伝子において過去に報告のない変異を含む病原性変異を同定し、さらに過去に病原性の報告のない遺伝子にde novo変異およびbi-allelicのrare variantのデータを蓄積することができた。また、これらの新たな知見の一部を報告し、学術的および社会的な意義をもたらすことができた。

報告書

(6件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023 2022 2020 2019

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] A Novel Mutation of VPS13D-related Disorders with Parkinsonism2024

    • 著者名/発表者名
      Harada S, Azuma Y, Misumi Y, Hayashi H, Matsubara S, Nakahara K, Miyatake S, Matsumoto N, Ueda M.
    • 雑誌名

      Internal Medicine

      巻: 63 号: 18 ページ: 2551-2553

    • DOI

      10.2169/internalmedicine.3101-23

    • ISSN
      0918-2918, 1349-7235
    • 年月日
      2024-09-15
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Subcortical infarction in a young adult with Hunter syndrome2022

    • 著者名/発表者名
      Kimura M, Azuma Y, Taguchi S, Takagi M, Mori H, Shimomura Y, Niwa JI, Doyu M, Okumura A.
    • 雑誌名

      Brain Dev

      巻: 44(5) 号: 5 ページ: 343-346

    • DOI

      10.1016/j.braindev.2022.01.003

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hemizygous FLNA variant in West syndrome without periventricular nodular heterotopia2020

    • 著者名/発表者名
      Hiromoto Y, Azuma Y, Suzuki Y, Hoshina M, Uchiyama Y, Mitsuhashi S, Miyatake S, Mizuguchi T, Takata A, Miyake N, Kato M, Matsumoto N.
    • 雑誌名

      Hum Genome Var

      巻: 7 号: 1 ページ: 43-43

    • DOI

      10.1038/s41439-020-00131-9

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Review of results of SCN1A genetic testing after insurance coverage.2023

    • 著者名/発表者名
      東 慶輝, 高木 みずき, 沼本 真吾, 倉橋 宏和, 奥村 彰久
    • 学会等名
      第56回 日本てんかん学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ケトン食療法が著効したSTXBP1 変異の1例2023

    • 著者名/発表者名
      東 慶輝, 高木 みずき, 佐田 淳, 沼本 真吾, 倉橋 宏和, 奥村 彰久
    • 学会等名
      第15回 日本てんかん学会東海北陸地方会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 全エクソーム解析でIRF2BPL遺伝子変異を同定したWest症候群の一例2023

    • 著者名/発表者名
      東 慶輝, 吉田 登, 高木 みずき, 沼本 真吾, 倉橋 宏和, 奥村 彰久
    • 学会等名
      第65回 日本小児神経学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 一卵性双生児の発症者と非発症者ともに病的モザイク変異を認めたSETX-ALS4症例2019

    • 著者名/発表者名
      東 慶輝、宮武 聡子、塚本-宮城 愛、瓦井 俊孝、内山 由理、水口 剛、三橋 里美、高田 篤、三宅 紀子、松本 直通
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] Epilepsy: A Comprehensive Textbook Edition: 3, Chapter 20 How to Interpret and Act on Clinical Exomes in Epilepsy:2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshiteru Azuma, Naomichi Matsumoto
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      LWW
    • ISBN
      9781975105525
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2025-01-30  

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