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"Generation of HIV-1 resistant T cells from induced pluripotent stem cell using CRISPR/Cas9 system"

研究課題

研究課題/領域番号 19K17925
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分54030:感染症内科学関連
研究機関大阪大学 (2021-2022)
神戸大学 (2019)

研究代表者

オフィンニ ユディル  大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任研究員(常勤) (30837901)

研究期間 (年度) 2021-03-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2020年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2019年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワードHIV-1 / iPSC / CRISPR/Cas9 / T cell / Feeder-free / Lentivirus
研究開始時の研究の概要

HIV-1 infection is incurable. To cure HIV-1 infection, direct disruption of viral gene is necessary. We previously have developed anti-HIV gene editing using CRISPR/Cas9. To proceed into clinical application, usage of stem cells is the most promising. We plan to use induced pluripotent stem cells (iPSC) to generate large supply of T cells. Thus, our study plan is to efficiently develop iPSC containing anti-HIV-1 CRISPR/Cas9, and differentiate iPSC to generate HIV-1 resistant T cells. Successful generation may lead to a clinically applicable, complete cure for HIV-1.

研究実績の概要

Step 1 of the study has been published in Viruses in 2020 and selected as a cover story of the journal's #11 issue. In Step 2, I have successfully transduced Cas9-gRNA into human mobilized hematopoietic stem cells (HSC) using a lentivector with Cocal virus pseudotyped-envelope. But, Step 3 did not go well as I moved to the US (HIV lab in Harvard), Osaka (Immunology), and now Kobe (Clinical Virology). The labs were not an iPSC lab. iPSC differentiation needed strict protocol and culture environment, and I did not succeed in differentiating the transduced iPSC. I am still hoping to establish a position in an iPSC lab to continue the project.
I prematurely ended the KAKENHI project as I was adopted as a Program-Specific Assistant Professor in Kobe and cannot have any extra research effort.

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 10件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Monkeypox: A Comprehensive Review2022

    • 著者名/発表者名
      Harapan Harapan、Ophinni Youdiil、Megawati Dewi、Frediansyah Andri、Mamada Sukamto S.、Salampe Mirnawati、Bin Emran Talha、Winardi Wira、Fathima Raisha、Sirinam Salin、Sittikul Pichamon、Stoian Ana M.、Nainu Firzan、Sallam Malik
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 14 号: 10 ページ: 2155-2155

    • DOI

      10.3390/v14102155

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Molnupiravir: A lethal mutagenic drug against rapidly mutating severe acute respiratory syndrome coronavirus 2?A narrative review2022

    • 著者名/発表者名
      Masyeni Sri、Iqhrammullah Muhammad、Frediansyah Andri、Nainu Firzan、Tallei Trina、Emran Talha Bin、Ophinni Youdiil、Dhama Kuldeep、Harapan Harapan
    • 雑誌名

      Journal of Medical Virology

      巻: - 号: 7 ページ: 3006-3016

    • DOI

      10.1002/jmv.27730

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Perceived risk of infection and death from COVID-19 among community members of low- and middle-income countries: A cross-sectional study2022

    • 著者名/発表者名
      Gachabayov Mahir、Sharun Khan、Felsenreich Daniel M.、Nainu Firzan、Anwar Samsul、Yufika Amanda、Ophinni Youdiil、Yamada Chika、Fahriani Marhami
    • 雑誌名

      F1000Research

      巻: 11 ページ: 345-345

    • DOI

      10.12688/f1000research.109575.1

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Beliefs on social distancing and face mask practices during the COVID-19 pandemic in low- and middle-income countries: a cross-sectional study2022

    • 著者名/発表者名
      Harapan Harapan、Yufika Amanda、Anwar Samsul、Ophinni Youdiil、Yamada Chika、Sharun Khan
    • 雑誌名

      F1000Research

      巻: 11 ページ: 206-206

    • DOI

      10.12688/f1000research.79534.1

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Multiplexed tat-Targeting CRISPR-Cas9 Protects T Cells from Acute HIV-1 Infection with Inhibition of Viral Escape2021

    • 著者名/発表者名
      Ophinni Youdiil、Miki Sayaka、Hayashi Yoshitake、Kameoka Masanori
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 12 号: 11 ページ: 1223-1223

    • DOI

      10.3390/v12111223

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Global prevalence of prolonged gastrointestinal symptoms in COVID-19 survivors and potential?pathogenesis:?A systematic review and meta-analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Yusuf Fauzi、Fahriani Marhami、Mamada Sukamto S.、Frediansyah Andri、Abubakar Azzaki、Maghfirah Desi、Fajar Jonny Karunia、Maliga Helnida Anggun、Ilmawan Muhammad、Emran Talha Bin、Ophinni Youdiil、Innayah Meutia Rizki、Masyeni Sri、Ghouth Abdulla Salem Bin、Yusuf Hanifah、Dhama Kuldeep、Nainu Firzan、Harapan Harapan
    • 雑誌名

      F1000Research

      巻: 10 ページ: 301-301

    • DOI

      10.12688/f1000research.52216.1

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Anosmia and dysgeusia in SARS-CoV-2 infection: incidence and effects on COVID-19 severity and mortality, and the possible pathobiology mechanisms - a systematic review and meta-analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Mutiawati Endang、Fahriani Marhami、Mamada Sukamto S.、Fajar Jonny Karunia、Frediansyah Andri、Maliga Helnida Anggun、Ilmawan Muhammad、Emran Talha Bin、Ophinni Youdiil、Ichsan Ichsan、Musadir Nasrul、Rabaan Ali A.、Dhama Kuldeep、Syahrul Syahrul、Nainu Firzan、Harapan Harapan
    • 雑誌名

      F1000Research

      巻: 10 ページ: 40-40

    • DOI

      10.12688/f1000research.28393.1

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Designing an epitope vaccine against Dermatophagoides pteronyssinus: An in silico study2021

    • 著者名/発表者名
      Adji Aryani、Niode Nurdjannah J.、Memah Ventje V.、Posangi Jimmy、Wahongan Greta J.P.、Ophinni Youdiil、Idroes Rinaldi、Mahmud Shafi、Emran Talha Bin、Nainu Firzan、Tallei Trina E.、Harapan Harapan
    • 雑誌名

      Acta Tropica

      巻: 222 ページ: 106028-106028

    • DOI

      10.1016/j.actatropica.2021.106028

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Suicidal ideation, psychopathology and associated factors among HIV-infected adults in Indonesia2020

    • 著者名/発表者名
      Ophinni Youdiil, Adrian, Siste Kristiana, Wiwie Martina, Anindyajati Gina, Hanafi Enjeline, Damayanti Reza, Hayashi Yoshitake
    • 雑誌名

      BMC Psychiatry

      巻: 20 号: 1 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1186/s12888-020-02666-1

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] piRNA-Guided CRISPR-like Immunity in Eukaryotes2019

    • 著者名/発表者名
      Ophinni Youdiil, Palatini Umberto, Hayashi Yoshitake, Parrish Nicholas F
    • 雑誌名

      Trends in Immunology

      巻: 40 号: 11 ページ: 998-1010

    • DOI

      10.1016/j.it.2019.09.003

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] CRISPR-Cas9 to cure viral infection2022

    • 著者名/発表者名
      Youdiil Ophinni
    • 学会等名
      Malaysian Society of Human Genetics and Indonesian Society of Human Genetics Joint Webinar
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] CRISPR-Cas9 as a curative drug for HIV-1 infection2021

    • 著者名/発表者名
      Youdiil Ophinni
    • 学会等名
      The 4th International Conference On Bioinformatics, Biotechnology, And Biomedical Engineering
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Cutting the virus: gene editing to cure chronic viral infection2021

    • 著者名/発表者名
      Youdiil Ophinni
    • 学会等名
      Lecture Course for Doctoral Students, Faculty of Medicine Universitas Indonesia
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] CRISPR/Cas9 system targeting HIV-1 regulatory genes inactivates latent proviral DNA and prevents new infection in T cell culture with inhibition of viral escape2019

    • 著者名/発表者名
      Ophinni Youdiil, Inoue Mari, Kotaki Tomohiro, Kameoka Masanori, Hayashi Yoshitake.
    • 学会等名
      10th International AIDS Society (IAS) Conference on HIV Science
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [図書] Apoptosis and phagocytosis as antiviral mechanisms2023

    • 著者名/発表者名
      Firzan Nainu, Youdiil Ophinni, Akiko Shiratsuchi, Yoshinobu Nakanishi
    • 総ページ数
      21
    • 出版者
      Springer Nature
    • ISBN
      9783031400865
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] piRNA抗ウイルス免疫に関するレビュー

    • URL

      https://www.kobe-u.ac.jp/research_at_kobe/NEWS/news/2019_11_19_01.html

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-12-25  

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