| 研究課題/領域番号 |
19K17935
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| 研究種目 |
若手研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
小区分54030:感染症内科学関連
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| 研究機関 | 埼玉医科大学 |
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研究代表者 |
今井 一男 埼玉医科大学, 医学部, 非常勤講師 (10816606)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2021-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2020年度)
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| 配分額 *注記 |
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2020年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2019年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
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| キーワード | 次世代シーケンサー / 呼吸器感染症 / ウイルス / メタゲノム解析 / MinION / ナノポア型シーケンサー / 呼吸器ウイルス / メタゲノム / ポータブルシーケンサー / 遺伝子診断法開発 / メタゲノム診断法 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
小児呼吸器感染症の早期診断・早期治療のために、安価・簡便かつ網羅的なウイルス感染症に対する診断技術の開発が急務である。本研究では、持ち運び可能な次世代シーケンサーを用いて、日常臨床に応用可能なポータブルタイプの網羅的ウイルス診断技術の開発を行い、小児患者から採取した咽頭由来検体を用いて、その臨床的有用性を評価することを目的とする。
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| 研究成果の概要 |
本研究は、安価なナノポア・シーケンサーであるFlongleを活用した小児及び成人の呼吸器ウイルスのメタゲノム診断技術の開発及び検証を目指し、実施した。呼吸器ウイルスに感染した患者から採取した臨床検体よりRNAを抽出・精製した後、２本鎖DNAを合成・増幅し、Flongleによるナノポア・シーケンスを行った。得られたデータをコンピューター解析することで、網羅的に呼吸器ウイルスを診断し、ウイルスゲノム解析が可能な方法を確立した。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究の成果は、呼吸器ウイルスの診断とウイルスゲノム解析に活用できる検査法に留まらず、様々なウイルス感染症診断に展開できるウイルス同定技術へと発展できる可能性がある。この成果により、これまで診断が困難であったウイルス感染症を安価かつ簡便に同定することができ、診断および実際の治療に役立つ可能性があることに加え、病態に関連する可能性のあるウイルスゲノム解析を行えるツールとなり得ることに意義がある。併せて、新興感染症としてパンデミックを起こした新型コロナウイルス感染症の新たな診断法としても、国内の感染症対策に寄与する可能性がある。
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