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日本人の性分化関連遺伝子バリアントの頻度、および表現型との関連性の検討

研究課題

研究課題/領域番号 19K18626
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分56040:産婦人科学関連
研究機関東北大学

研究代表者

近藤 亜希子  東北大学, 医学系研究科, 大学院非常勤講師 (20644818)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード性分化疾患 / DSD / 性分化関連遺伝子 / 塩基配列変異 / バリアント / 東北メディカル・メガバンク計画 / 全ゲノム解析 / 住民ゲノム参照パネル / 東北メディカル・メガバンク / 性分化疾患関連バリアント / 東北メディカル・メガバンク機構 / 疾患頻度調査
研究開始時の研究の概要

性分化疾患は性染色体のゲノム変異と性分化関連遺伝子の塩基配列バリアントにより様々な表現型となる。日本人の一般集団における性分化関連遺伝子のバリアントの種類とその頻度の報告はない。本研究は東北メディカル・メガバンク機構のバイオバンクを用いて、日本人の一般集団における疾患特異的および疾患の表現型の程度に関連する性分化関連遺伝子バリアントの頻度を解明する。さらにそのバリアントと、それを保持する症例の表現型との関連性を探索し、性分化異常の治療の個別化や原因不明の不妊や性腺機能低下を含む生殖機能異常の原因の解明を目的とする。

研究成果の概要

本研究は東北メディカル・メガバンク機構が構築した日本人8380人を含む全ゲノム参照パネルにおいて、潜性遺伝形式の性分化疾患(DSD)および中枢性性腺機能低下症(CHG)に関連する遺伝子およびアンドロゲン受容体(AR)遺伝子、総計32遺伝子の病的バリアントについて検討した。病的バリアント候補(P)または病的バリアントの可能性が高い(LP)バリアントを、ClinVar、InterVarおよびHuman Gene Mutationのデータベースを用いて抽出した。25の遺伝子で91の病的バリアント候補を認めた。およそ157人に1人程度が潜性DSDおよびCHGの病的バリアントを保因することが示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究は、東北メディカル・メガバンク機構が構築した日本人8380人の全ゲノム参照パネルにおいて、潜性遺伝形式をとる性分化疾患、中枢性性腺機能低下症およびアンドロゲン受容体遺伝子に関連する遺伝子から抽出した32遺伝子の病的バリアントについて検討した。病的バリアント候補を抽出し、既存の遺伝子バリアントのデータベースを用いて病的妥当性を評価した。25の遺伝子で91の病的バリアント候補を認め、28の新規病的バリアント候補が同定された。本研究は日本人の潜性遺伝形式性分化疾患および中枢性性腺機能低下症の原因解明に役立つことが期待される。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Pathological variants in genes associated with disorders of sex development and central causes of hypogonadism in a whole-genome reference panel of 8380 Japanese individuals2022

    • 著者名/発表者名
      Shiga Naomi、Yamaguchi-Kabata Yumi、Igeta Saori、Yasuda Jun、Tadaka Shu、Minato Takamichi、Watanabe Zen、Kanno Junko、Tamiya Gen、Fuse Nobuo、Kinoshita Kengo、Kure Shigeo、Kondo Akiko、Tachibana Masahito、Yamamoto Masayuki、Yaegashi Nobuo、Sugawara Junichi
    • 雑誌名

      Human Genome Variation

      巻: 9 号: 1 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1038/s41439-022-00213-w

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Estimating carrier frequencies of pathogenic gene variants associated with sex development in general Japanese individuals2021

    • 著者名/発表者名
      志賀尚美、山口由美、井ケ田小緒里、藤峯絢子、久野貴司、横山絵美、近藤亜希子、渡邉善、立花眞仁、安田純、菅原準一、八重樫伸生
    • 学会等名
      第73回日本産科婦人科学会学術集会  JSOG Congress Award Candidate
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 日本人8380人の全ゲノム参照パネルを用いた性分化疾患関連遺伝子の病的変異の探索2021

    • 著者名/発表者名
      志賀尚美
    • 学会等名
      第66回日本人類遺伝学会/第28回日本遺伝子診療学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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